Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07140
Subject:
NM_001354729.1
Aligned Length:
940
Identities:
932
Gaps:
6

Alignment

Query   1  MARKRAAGGEPRGRELRSQKSKAKSKARREEEEEDAFEDEKPPKKSLLSKVSQGKRKRGCSHPGGSADGPAKKK  74
           ||||||||||||||||||||||||||||.      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MARKRAAGGEPRGRELRSQKSKAKSKARH------AFEDEKPPKKSLLSKVSQGKRKRGCSHPGGSADGPAKKK  68

Query  75  VAKVTVKSENLKVIKDEALSDGDDLRDFPSDLKKAHHLKRGATMNEDSNEEEEESENDWEEVEELSEPVLGDVR  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  69  VAKVTVKSENLKVIKDEALSDGDDLRDFPSDLKKAHHLKRGATMNEDSNEEEEESENDWEEVEELSEPVLGDVR  142

Query 149  ESTAFSRSLLPVKPVEIEIETPEQAKTRERSEKIKLEFETYLRRAMKRFNKGVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNN  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143  ESTAFSRSLLPVKPVEIEIETPEQAKTRERSEKIKLEFETYLRRAMKRFNKGVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNN  216

Query 223  ICSQPDLHAIGLSIIPARFTRVLPRDVDTYYLSNLVKWFIGTFTVNAELSASEQDNLQTTLERRFAIYSARDDE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217  ICSQPDLHAIGLSIIPARFTRVLPRDVDTYYLSNLVKWFIGTFTVNAELSASEQDNLQTTLERRFAIYSARDDE  290

Query 297  ELVHIFLLILRALQLLTRLVLSLQPIPLKSATAKGKKPSKERLTADPGGSSETSSQVLENHTKPKTSKGTKQEE  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291  ELVHIFLLILRALQLLTRLVLSLQPIPLKSATAKGKKPSKERLTADPGGSSETSSQVLENHTKPKTSKGTKQEE  364

Query 371  TFAKGTCRPSAKGKRNKGGRKKRSKPSSSEEDEGPGDKQEKATQRRPHGRERRVASRVSYKEESGSDEAGSGSD  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365  TFAKGTCRPSAKGKRNKGGRKKRSKPSSSEEDEGPGDKQEKATQRRPHGRERRVASRVSYKEESGSDEAGSGSD  438

Query 445  FELSSGEASDPSDEDSEPGPPKQRKAPAPQRTKAGSKSASRTHRGSHRKDPSLPAASSSSSSSKRGKKMCSDGE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439  FELSSGEASDPSDEDSEPGPPKQRKAPAPQRTKAGSKSASRTHRGSHRKDPSLPAASSSSSSSKRGKKMCSDGE  512

Query 519  KAEKRSIAGIDQWLEVFCEQEEKWVCVDCVHGVVGQPLTCYKYATKPMTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPVWMTV  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513  KAEKRSIAGIDQWLEVFCEQEEKWVCVDCVHGVVGQPLTCYKYATKPMTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPVWMTV  586

Query 593  TRKCRVDAEWWAETLRPYQSPFMDREKKEDLEFQAKHMDQPLPTAIGLYKNHPLYALKRHLLKYEAIYPETAAI  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587  TRKCRVDAEWWAETLRPYQSPFMDREKKEDLEFQAKHMDQPLPTAIGLYKNHPLYALKRHLLKYEAIYPETAAI  660

Query 667  LGYCRGEAVYSRDCVHTLHSRDTWLKKARVVRLGEVPYKMVKGFSNRARKARLAEPQLREENDLGLFGYWQTEE  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661  LGYCRGEAVYSRDCVHTLHSRDTWLKKARVVRLGEVPYKMVKGFSNRARKARLAEPQLREENDLGLFGYWQTEE  734

Query 741  YQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPIGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIVC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735  YQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPIGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIVC  808

Query 815  EEFKDVLLTAWENEQAVIERKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKRRYGPKSEAAAPHTDAGGGLSSDEEE  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809  EEFKDVLLTAWENEQAVIERKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKRRYGPKSEAAAPHTDAGGGLSSDEEE  882

Query 889  GTSSQAEAARILAASWPQNREDEEKQKLKGGPKKTKREKKAAASHLFPFEKL  940
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 883  GTSSQAEAARILAASWPQNREDEEKQKLKGGPKKTKREKKAAASHLFPFEQL  934