Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07144
- Subject:
- NM_001282515.2
- Aligned Length:
- 1935
- Identities:
- 1889
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGTCGGTCTCCAGCGGCGACCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGAC 74
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGGTCTCCAGCGGCGTCCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGAC 74
Query 75 CAAAGAGGCCGGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCAGCGCCGC----------------- 131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAAGAGGCCGGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCAGCGCCGCGGTATCAGTAACATTCA 148
Query 132 ----------------------------GGAATGGAAGCAACTGGATCCTGCTCAGAGCAACCTGTATAATGAT 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACATGTGACTATGGCCTTTACCCAGAAGGAATGGAAGCAACTGGATCCTGCTCAGAGCAACCTGTATAATGAT 222
Query 178 GTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAAGCCTCAATGGGGTGTCAAGCTCCCAAACCAGACATGATCTCCAAGTT 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAAGCCTCAATGGGGTGTCAAGCTCCCAAACCAGACATGATCTCCAAGTT 296
Query 252 GGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGGGAAAAGACCCAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGAC 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGGGAAAAGACCCAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGAC 370
Query 326 CCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATGATGACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAAC 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATGATGACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAAC 444
Query 400 AAACTCCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCTAAGAAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGG 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACTCCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCTAAGAAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGG 518
Query 474 GAAAAAAAATAATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAAAAGGCTTCTTAAATTTGAGTCATGTGGAAAAA 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAAAAAATAATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAAAAGGCTTCTTAAATTTGAGTCATGTGGAAAAA 592
Query 548 TTTTGAAACAGAATTTAGATTTACCTGATCACTCAAGAAACTGTGTAAAAAGGAAATCTGATGCAGCTAAAGAA 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTTGAAACAGAATTTAGATTTACCTGATCACTCAAGAAACTGTGTAAAAAGGAAATCTGATGCAGCTAAAGAA 666
Query 622 CACAAGAAGTCATTCAACCATAGCTTATCTGATACAAGGAAAGGCAAAAAGCAAACTGGAAAGAAACATGAGAA 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACAAGAAGTCATTCAACCATAGCTTATCTGATACAAGGAAAGGCAAAAAGCAAACTGGAAAGAAACATGAGAA 740
Query 696 ATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGTGTAACAAAACTGGCAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCATAGTT 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGTGTAACAAAACTGGCAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCATAGTT 814
Query 770 CATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGAGAGAAACATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACT 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGAGAGAAACATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACT 888
Query 844 AAGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATGTAATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACA 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATGTAATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACA 962
Query 918 AGGACTCATTGACCATCAGAGAGTTCATACTGGGGAGAAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGATAGCCTTTA 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGACTCATTGACCATCAGAGAGTTCATACTGGGGAGAAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGATAGCCTTTA 1036
Query 992 GCCAAAAGTCACACCTTGTTGTACATCAGAGAACTCACACCGGAGAAAAACCATATGAATGTATTCAGTGTGGC 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCAAAAGTCACACCTTGTTGTACATCAGAGAACTCACACCGGAGAAAAACCATATGAATGTATTCAGTGTGGC 1110
Query 1066 AAAGCCCATGGTCATAAACATGCACTCACTGACCATCTAAGAATTCATACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTGC 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAGCCCATGGTCATAAACATGCACTCACTGACCATCTAAGAATTCATACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTGC 1184
Query 1140 TGAATGTGGGAAAACCTTCAGACACAGCTCAAACCTTATTCAACATGTGAGATCTCACACAGGTGAGAAGCCAT 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAATGTGGGAAAACCTTCAGACACAGCTCAAACCTTATTCAACATGTGAGATCTCACACAGGTGAGAAGCCAT 1258
Query 1214 ATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGTCTTTTAGGTATAACTCATCTCTTACCGAACATGTGAGAACACATACAGGT 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGTCTTTTAGGTATAACTCATCTCTTACCGAACATGTGAGAACACATACAGGT 1332
Query 1288 GAAATACCATATGAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAAGTATAGCTCATCCCTTACTAAACACATGAGAAT 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAATACCATATGAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAAGTATAGCTCATCCCTTACTAAACACATGAGAAT 1406
Query 1362 TCATACAGGTGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTATAC 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCATACAGGTGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTATAC 1480
Query 1436 ATCAAAGAACTCATACTAAGGAGAAACCTTATAAATGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGACATAGCTCATCT 1509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATCAAAGAACTCATACTAAGGAGAAACCTTATAAATGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGACATAGCTCATCT 1554
Query 1510 CTTACTTACCATATGAGAACTCATACAGGTGAAAGTCCCTTTGAATGTAATCAATGTGGGAAAGGCTTTAAACA 1583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTTACTTACCATATGAGAACTCATACAGGTGAAAGTCCCTTTGAATGTAATCAATGTGGGAAAGGCTTTAAACA 1628
Query 1584 AATTGAAGGCCTTACTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCGTATGAGTGTAATGAATGTGGGAAAG 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AATTGAAGGCCTTACTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCGTATGAGTGTAATGAATGTGGGAAAG 1702
Query 1658 CCTTTAGCCAAAAGTCTCACCTCATTGTACATCAGAGAACTCATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGTAACGAA 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTTTAGCCAAAAGTCTCACCTCATTGTACATCAGAGAACTCATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGTAACGAA 1776
Query 1732 TGTGAAAAAGCCTTTAATGCAAAATCACAGCTTGTTATACATCAGCGATCCCACACTGGAGAAAAACCCTATGA 1805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGTGAAAAAGCCTTTAATGCAAAATCACAGCTTGTTATACATCAGCGATCCCACACTGGAGAAAAACCCTATGA 1850
Query 1806 ATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTCAAACAAAATGCATCCCTAACCAAACATGTGAAAACTCATTCAGAAGATA 1879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTCAAACAAAATGCATCCCTAACCAAACATGTGAAAACTCATTCAGAAGATA 1924
Query 1880 AATCTCATGAG 1890
|||||||||||
Sbjct 1925 AATCTCATGAG 1935