Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07144
• Subject: NM_001282518.2
• Aligned Length: 1893
• Identities: 1889
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGTCGGTCTCCAGCGGCGACCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGAC  74
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGTCTCCAGCGGCGTCCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGAC  74

Query   75  CAAAGAGGCCGGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCAGCGCCGC---GGAATGGAAGCAAC  145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||
Sbjct   75  CAAAGAGGCCGGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCAGCGCCGCGAAGGAATGGAAGCAAC  148

Query  146  TGGATCCTGCTCAGAGCAACCTGTATAATGATGTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAAGCCTCAATGGGGTGT  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGATCCTGCTCAGAGCAACCTGTATAATGATGTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAAGCCTCAATGGGGTGT  222

Query  220  CAAGCTCCCAAACCAGACATGATCTCCAAGTTGGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGGGAAAAGACC  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGCTCCCAAACCAGACATGATCTCCAAGTTGGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGGGAAAAGACC  296

Query  294  CAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGACCCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATGATG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGACCCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATGATG  370

Query  368  ACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAACAAACTCCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAACAAACTCCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCT  444

Query  442  AAGAAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGGGAAAAAAAATAATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAA  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGGGAAAAAAAATAATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAA  518

Query  516  AAGGCTTCTTAAATTTGAGTCATGTGGAAAAATTTTGAAACAGAATTTAGATTTACCTGATCACTCAAGAAACT  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGCTTCTTAAATTTGAGTCATGTGGAAAAATTTTGAAACAGAATTTAGATTTACCTGATCACTCAAGAAACT  592

Query  590  GTGTAAAAAGGAAATCTGATGCAGCTAAAGAACACAAGAAGTCATTCAACCATAGCTTATCTGATACAAGGAAA  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTAAAAAGGAAATCTGATGCAGCTAAAGAACACAAGAAGTCATTCAACCATAGCTTATCTGATACAAGGAAA  666

Query  664  GGCAAAAAGCAAACTGGAAAGAAACATGAGAAATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGTGTAACAAAACTGG  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCAAAAAGCAAACTGGAAAGAAACATGAGAAATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGTGTAACAAAACTGG  740

Query  738  CAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCATAGTTCATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGAGAGAAAC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCATAGTTCATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGAGAGAAAC  814

Query  812  ATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACTAAGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATGT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACTAAGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATGT  888

Query  886  AATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACAAGGACTCATTGACCATCAGAGAGTTCATACTGGGGAGAAACC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACAAGGACTCATTGACCATCAGAGAGTTCATACTGGGGAGAAACC  962

Query  960  ATATGAATGTAATGAATGTGGGATAGCCTTTAGCCAAAAGTCACACCTTGTTGTACATCAGAGAACTCACACCG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATATGAATGTAATGAATGTGGGATAGCCTTTAGCCAAAAGTCACACCTTGTTGTACATCAGAGAACTCACACCG  1036

Query 1034  GAGAAAAACCATATGAATGTATTCAGTGTGGCAAAGCCCATGGTCATAAACATGCACTCACTGACCATCTAAGA  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGAAAAACCATATGAATGTATTCAGTGTGGCAAAGCCCATGGTCATAAACATGCACTCACTGACCATCTAAGA  1110

Query 1108  ATTCATACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTGCTGAATGTGGGAAAACCTTCAGACACAGCTCAAACCTTATTCA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTCATACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTGCTGAATGTGGGAAAACCTTCAGACACAGCTCAAACCTTATTCA  1184

Query 1182  ACATGTGAGATCTCACACAGGTGAGAAGCCATATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGTCTTTTAGGTATAACTCAT  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACATGTGAGATCTCACACAGGTGAGAAGCCATATGAATGTAAGGAATGTGGGAAGTCTTTTAGGTATAACTCAT  1258

Query 1256  CTCTTACCGAACATGTGAGAACACATACAGGTGAAATACCATATGAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAAG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCTTACCGAACATGTGAGAACACATACAGGTGAAATACCATATGAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAAG  1332

Query 1330  TATAGCTCATCCCTTACTAAACACATGAGAATTCATACAGGTGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TATAGCTCATCCCTTACTAAACACATGAGAATTCATACAGGTGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAA  1406

Query 1404  AGCTTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTATACATCAAAGAACTCATACTAAGGAGAAACCTTATAAATGTAATG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCTTTCAGCAAGAAGTCACACCTCATTATACATCAAAGAACTCATACTAAGGAGAAACCTTATAAATGTAATG  1480

Query 1478  AGTGTGGAAAAGCCTTTGGACATAGCTCATCTCTTACTTACCATATGAGAACTCATACAGGTGAAAGTCCCTTT  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTGTGGAAAAGCCTTTGGACATAGCTCATCTCTTACTTACCATATGAGAACTCATACAGGTGAAAGTCCCTTT  1554

Query 1552  GAATGTAATCAATGTGGGAAAGGCTTTAAACAAATTGAAGGCCTTACTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGA  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAATGTAATCAATGTGGGAAAGGCTTTAAACAAATTGAAGGCCTTACTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGA  1628

Query 1626  GAAACCGTATGAGTGTAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGCCAAAAGTCTCACCTCATTGTACATCAGAGAACTC  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAAACCGTATGAGTGTAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGCCAAAAGTCTCACCTCATTGTACATCAGAGAACTC  1702

Query 1700  ATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGTAACGAATGTGAAAAAGCCTTTAATGCAAAATCACAGCTTGTTATACAT  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATACTGGGGAGAAACCTTATGAATGTAACGAATGTGAAAAAGCCTTTAATGCAAAATCACAGCTTGTTATACAT  1776

Query 1774  CAGCGATCCCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTCAAACAAAATGCATCCCT  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGCGATCCCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAACTTTCAAACAAAATGCATCCCT  1850

Query 1848  AACCAAACATGTGAAAACTCATTCAGAAGATAAATCTCATGAG  1890
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AACCAAACATGTGAAAACTCATTCAGAAGATAAATCTCATGAG  1893