Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07155
• Subject: NM_001256280.2
• Aligned Length: 1599
• Identities: 1501
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTG  74

Query   75  GGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACC  148

Query  149  TGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATA  222
            |||||||||||                                                               
Sbjct  149  TGATATCAGTG---------------------------------------------------------------  159

Query  223  ATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCT  296
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  ---------------------------------GATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCT  200

Query  297  TGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  TGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAA  274

Query  371  GACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  GACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAG  348

Query  445  AATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  AATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAA  422

Query  519  CTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  CTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAG  496

Query  593  GAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  GAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGA  570

Query  667  GTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  GTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGT  644

Query  741  CCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  CCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCAC  718

Query  815  AGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  AGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGT  792

Query  889  TTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  TTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAA  866

Query  963  AGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  AGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTG  940

Query 1037  ATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  ATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTAT  1014

Query 1111  CAATGCGGCGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGA  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  CAATGCGGTGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGA  1088

Query 1185  GAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACAC  1162

Query 1259  ACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  ACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACAT  1236

Query 1333  CAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  CAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACT  1310

Query 1407  TCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  TCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGA  1384

Query 1481  AGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACTGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  AGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACCGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCC  1458

Query 1555  TTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA  1599
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  TTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA  1503