Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07155
Subject:
NM_001256280.2
Aligned Length:
533
Identities:
501
Gaps:
32

Alignment

Query   1  MATSFRTASCWGLLSFKDISMEFTWDEWQLLDSTQKYLYRDVILENYHNLISVGYHGTKPDLIFKLEQGEDPWI  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct   1  MATSFRTASCWGLLSFKDISMEFTWDEWQLLDSTQKYLYRDVILENYHNLISV---------------------  53

Query  75  INAKISRQSCPDGWEEWYQNNQDELESIERSYACSVLGRLNLSKTHDSSRQRLYNTRGKSLTQNSAPSRSYLRK  148
                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  54  -----------DGWEEWYQNNQDELESIERSYACSVLGRLNLSKTHDSSRQRLYNTRGKSLTQNSAPSRSYLRK  116

Query 149  NPDKFHGYEEPYFLKHQRAHSIEKNCVCSECGKAFRCKSQLIVHLRIHTGERPYECSKCERAFSAKSNLNAHQR  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117  NPDKFHGYEEPYFLKHQRAHSIEKNCVCSECGKAFRCKSQLIVHLRIHTGERPYECSKCERAFSAKSNLNAHQR  190

Query 223  VHTGEKPYSCSECEKVFSFRSQLIVHQEIHTGGKPYGCSECGKAYSWKSQLLLHQRSHTGVKPYECSECGKAFS  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191  VHTGEKPYSCSECEKVFSFRSQLIVHQEIHTGGKPYGCSECGKAYSWKSQLLLHQRSHTGVKPYECSECGKAFS  264

Query 297  LKSPFVVHQRTHTGVKPHKCSECGKAFRSKSYLLVHIRMHTGEKPYQCSDCGKAFNMKTQLIVHQGVHTGNNPY  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265  LKSPFVVHQRTHTGVKPHKCSECGKAFRSKSYLLVHIRMHTGEKPYQCSDCGKAFNMKTQLIVHQGVHTGNNPY  338

Query 371  QCGECGKAFGRKEQLTAHLRAHAGEKPYGCSECGKAFSSKSYLVIHRRTHTGERPYECSLCERAFCGKSQLIIH  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339  QCGECGKAFGRKEQLTAHLRAHAGEKPYGCSECGKAFSSKSYLVIHRRTHTGERPYECSLCERAFCGKSQLIIH  412

Query 445  QRTHSTEKPYECNECEKAYPRKASLQIHQKTHSGEKPFKCSECGKAFTQKSSLSEHQRVHTGEKPWKCSECGKS  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413  QRTHSTEKPYECNECEKAYPRKASLQIHQKTHSGEKPFKCSECGKAFTQKSSLSEHQRVHTGEKPWKCSECGKS  486

Query 519  FCWNSGLRIHRKTHK  533
           |||||||||||||||
Sbjct 487  FCWNSGLRIHRKTHK  501