Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07155
• Subject: NM_019591.4
• Aligned Length: 1599
• Identities: 1597
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTG  74

Query   75  GGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGAATGGCAGCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACC  148

Query  149  TGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATATCAGTGGGGTATCATGGTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATA  222

Query  223  ATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCT  296

Query  297  TGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAA  370

Query  371  GACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAG  444

Query  445  AATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAA  518

Query  519  CTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGTGTGTGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAG  592

Query  593  GAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGAGAGACCTTATGAATGCAGTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGA  666

Query  667  GTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTCATACAGGAGAAAAACCCTACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGT  740

Query  741  CCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCATCAGGAAATTCACACAGGAGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCAC  814

Query  815  AGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTTCTTTTACACCAGAGAAGTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGT  888

Query  889  TTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGAAGTCTCCATTCGTTGTACACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAA  962

Query  963  AGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCCTTTAGGAGTAAGTCCTATCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTG  1036

Query 1037  ATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTGTGGGAAAGCCTTCAATATGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTAT  1110

Query 1111  CAATGCGGCGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGA  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAATGCGGTGAATGTGGGAAAGCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGA  1184

Query 1185  GAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCCCTATGGATGCAGTGAATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACAC  1258

Query 1259  ACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACACCGGAGAGAGACCCTATGAATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACAT  1332

Query 1333  CAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGAGAACTCATTCAACTGAGAAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACT  1406

Query 1407  TCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGATACACCAGAAAACTCATTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGA  1480

Query 1481  AGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACTGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTCATCTCTCAGTGAACATCAGAGAGTTCACACCGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCC  1554

Query 1555  TTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA  1599
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCTGTTGGAATTCAGGGCTTCGTATACATCGGAAGACTCATAAA  1599