Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07167
- Subject:
- NM_006300.4
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1262
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT 74
Query 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA 222
||||.||||||| |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 149 AACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA 216
Query 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC 296
|||||.||||||||.||||||| ||.||.|.|||||||||.||||||||||.||..|
Sbjct 217 GAAGGAAATTCAGGCGGCAAGA------------------CTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC 272
Query 297 CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT 370
.||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||..||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 273 TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT 346
Query 371 TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC 444
||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 347 TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA 420
Query 445 CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA 518
|||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||..||||||.|||
Sbjct 421 CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA 494
Query 519 GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC 592
|||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||.|
Sbjct 495 GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC 568
Query 593 ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT 666
||.||.||||||||||||.||.||||||..||.||||.||||||||.|||||.||||||..|||||||||||.|
Sbjct 569 ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT 642
Query 667 CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT 740
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||.|...|||
Sbjct 643 GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT 716
Query 741 TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG 814
|.|.|||||....||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 717 TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG 790
Query 815 ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC 888
|||.|||||||.||.|||||.|||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 791 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC 864
Query 889 TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG 962
||||...||||||||||
Sbjct 865 TTCTGCCTTAGGTCAAG--------------------------------------------------------- 881
Query 963 TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT 1036
.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 882 ---------------------------TCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAAT 928
Query 1037 GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA 1110
.||||.||||||||||||||||.|.||.|||.||||||||..|||||||||||.|..|.|||||||||.|||||
Sbjct 929 CTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAA 1002
Query 1111 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG 1184
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1003 CCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAG 1076
Query 1185 TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA 1258
||||||||||
Sbjct 1077 TGGAGAAAAA---------------------------------------------------------------- 1086
Query 1259 GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC 1332
|||||.|.||||||||||||||||||||||||..|||.|||||....||||.||
Sbjct 1087 --------------------CCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAAC 1140
Query 1333 TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC 1406
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1141 TTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTC 1214
Query 1407 AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG 1480
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1215 AAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTG 1288
Query 1481 TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG 1554
|||||.||.|.|.|.||||||||||.|...|||||.|.|.|||.||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1289 TACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGG 1362
Query 1555 AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA 1614
|..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|..
Sbjct 1363 AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG 1422