Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07167
- Subject:
- NM_013361.6
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1269
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
|||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCATGTCCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA 222
||||.|||||||.||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|.||||||||||||.
Sbjct 149 AACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGG 222
Query 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC 296
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTC 296
Query 297 CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT 370
|||||||||.|||||||||.|||||||||..||.|||||||||.||||.|||||||.||||||.|.||||||||
Sbjct 297 CTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGT 370
Query 371 TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC 444
||||||||.|.|||||||.||.||||||||||||.|.|||||||.|.|.|||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGACTATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCC 444
Query 445 CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA 518
.|..||||||||||||||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||..||..|||||.|||
Sbjct 445 AATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGA 518
Query 519 GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC 592
|||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 519 GAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCGCTTCATATTCATCAGAGAGTCC 592
Query 593 ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT 666
||.||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCAT 666
Query 667 CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT 740
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 667 CAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT 740
Query 741 TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG 814
||..||||||...||||||||||..||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 741 TACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATG 814
Query 815 ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC 888
|||.|||||||.||.|||||.|||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||.||..||.|
Sbjct 815 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGC 888
Query 889 TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG 962
|||..|.||||||||||
Sbjct 889 TTCCGTCTTAGGTCAAG--------------------------------------------------------- 905
Query 963 TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT 1036
.||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||..||||..
Sbjct 906 ---------------------------TCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAACCAAACAGCA 952
Query 1037 GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA 1110
.||.|.|.|.||||||||||||.|||.|||||||.|||||.|.||||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 953 CTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAA 1026
Query 1111 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1027 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACAC 1100
Query 1185 TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA 1258
||||
Sbjct 1101 TGGA---------------------------------------------------------------------- 1104
Query 1259 GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC 1332
|||||||||||.||||||||..|||||||||||.||||..|||||||||....|||||||
Sbjct 1105 --------------GAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGAC 1164
Query 1333 TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC 1406
||||||||.||.|.||||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||.||||||.|.||||||
Sbjct 1165 TTGCACCATAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTC 1238
Query 1407 AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG 1480
|||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1239 AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTG 1312
Query 1481 TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG 1554
||.||.||.||||||||||||||||.|..|.|.||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1313 TATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGG 1386
Query 1555 AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA 1614
|..|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1387 AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG 1446