Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07167
• Subject: XM_017027258.1
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1269
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
            |||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGTCCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            |||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA  222
            ||||.|||||||.||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|.||||||||||||.
Sbjct  149  AACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGG  222

Query  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC  296
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTC  296

Query  297  CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT  370
            |||||||||.|||||||||.|||||||||..||.|||||||||.||||.|||||||.||||||.|.||||||||
Sbjct  297  CTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGT  370

Query  371  TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC  444
            ||||||||.|.|||||||.||.||||||||||||.|.|||||||.|.|.|||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGACTATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCC  444

Query  445  CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA  518
            .|..||||||||||||||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||..||..|||||.|||
Sbjct  445  AATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGA  518

Query  519  GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC  592
            |||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCGCTTCATATTCATCAGAGAGTCC  592

Query  593  ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT  666
            ||.||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCAT  666

Query  667  CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT  740
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||.|||||..|||||||||||||
Sbjct  667  CAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT  740

Query  741  TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814
            ||..||||||...||||||||||..||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  741  TACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATG  814

Query  815  ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC  888
            |||.|||||||.||.|||||.|||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||.||..||.|
Sbjct  815  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGC  888

Query  889  TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG  962
            |||..|.||||||||||                                                         
Sbjct  889  TTCCGTCTTAGGTCAAG---------------------------------------------------------  905

Query  963  TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT  1036
                                       .||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||..||||..
Sbjct  906  ---------------------------TCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAACCAAACAGCA  952

Query 1037  GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA  1110
            .||.|.|.|.||||||||||||.|||.|||||||.|||||.|.||||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct  953  CTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAA  1026

Query 1111  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1027  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACAC  1100

Query 1185  TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA  1258
            ||||                                                                      
Sbjct 1101  TGGA----------------------------------------------------------------------  1104

Query 1259  GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC  1332
                          |||||||||||.||||||||..|||||||||||.||||..|||||||||....|||||||
Sbjct 1105  --------------GAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGAC  1164

Query 1333  TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC  1406
            ||||||||.||.|.||||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||.||||||.|.||||||
Sbjct 1165  TTGCACCATAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTC  1238

Query 1407  AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG  1480
            |||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1239  AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTG  1312

Query 1481  TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG  1554
            ||.||.||.||||||||||||||||.|..|.|.||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1313  TATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGG  1386

Query 1555  AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA  1614
            |..|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1387  AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG  1446