Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07185
• Subject: NM_003471.3
• Aligned Length: 1271
• Identities: 1113
• Gaps: 115

Alignment

Query    1  ATGCAAGTCTCCATA-----GCCTGCACAGAGCA----------CAATTTG--------AA--------GAGTC  43
            |||||  |||..|||     |||||..|||| ||          |||..||        ||        ||.||
Sbjct    1  ATGCA--TCTGTATAAACCTGCCTGTGCAGA-CATCCCGAGCCCCAAGCTGGGTCTGCCAAAATCCAGTGAATC  71

Query   44  GG------AATGGTGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCAGAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTAA-ACGCAGCC-C  109
            ||      ||||..||.|.|         |.|.|||||.|    |||              || ||.||||| |
Sbjct   72  GGCTCTAAAATGTAGATGGC---------ACCTAGCAGTG----ACC--------------AAGACTCAGCCTC  118

Query  110  GGGC------CAAATTCC------GCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCC-------------TGGGGACGTT  158
            .|||      ||||  ||      ||.|.||           .|.||||||             |||..|.|||
Sbjct  119  AGGCGGCCTGCAAA--CCTGTGAGGCCCAGT-----------GGAGCAGCCGAACAGAAATATGTGGAAAAGTT  179

Query  159  --CACGCCTCAGCATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAAGC--AGACTGGCATGAAATATAGGAATCTT  228
              .|||  |...|||...|||||..|..|.||..||||  ||.|||  ||||.||||||..|||.|||||||||
Sbjct  180  TCTACG--TGTTCATGGAATTTCGTTGCAGGAAACCAC--CAGAGCAGAGACGGGCATGGCATACAGGAATCTT  249

Query  229  GGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTTCAGATGA  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  GGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTTCAGATGA  323

Query  303  GGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCTATGCTG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  GGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCTATGCTG  397

Query  377  CTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGTCATAACA  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  CTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGTCATAACA  471

Query  451  ACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAGGATTGAA  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  ACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAGGATTGAA  545

Query  525  GGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAACACTCCCA  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  GGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAACACTCCCA  619

Query  599  TGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCGAGATGG  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  TGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCGAGATGG  693

Query  673  AGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTGAACAAGC  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  AGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTGAACAAGC  767

Query  747  TGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTGTTGGCG  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  TGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTGTTGGCG  841

Query  821  CAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGTTCCAGG  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  CAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGTTCCAGG  915

Query  895  GCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAACAAGCT  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  GCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAACAAGCT  989

Query  969  AAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGCCTGAGAA  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  AAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGCCTGAGAA  1063

Query 1043  ACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCCATTCAG  1116
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064  ATGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCCATTCAG  1137

Query 1117  GTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAGCAAGAA  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138  GTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAGCAAGAA  1211

Query 1191  GGACTATAGATCA  1203
            |||||||||||||
Sbjct 1212  GGACTATAGATCA  1224