Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07185
- Subject:
- XM_006501056.1
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 1039
- Gaps:
- 124
Alignment
Query 1 ATGCAAGTCTCCATAGCCTGCACAG----AGCA------CA-ATTT--GAAGA----------GTCGGAATG-- 49
||||..| .||||.|||||| .||| || ||.| ||||| .||.|||.|
Sbjct 1 ATGCTGG------CAGCCCGCACAGGCGCTGCAGGGAGTCAGATCTCCGAAGACAACAGCAAGTTCAGAAAGCA 68
Query 50 GTGAGGACCGACTTC---TGAGCAAG-CAGAGCTCC----ACCGCCCCC---AATGTGGTAAAC-GCAGC---- 107
||..||.|...|||| .|.|.||| ||||.|||| |..|||||| ||||....|.|| |||||
Sbjct 69 GTCTGGCCTTTCTTCAGGGGGGAAAGACAGATCTCCCAAGAAAGCCCCCGAGAATGCCAAAGACAGCAGCCTCA 142
Query 108 ------CCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGC---GCAG-----CCTG----GGGACGT------ 157
||||| ||||..|.|| ||| |.|| |||| |||| ||||.||
Sbjct 143 GCCCAACCGGG-CAAAGCCAGC----------TCA--GGGCAAGGCAGCTGGCCCTGCTGCGGGAGGTGGAGAT 203
Query 158 -----------TCACGC-CT----------CAGC-ATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAAGCA-GACT 207
|.|.|| || |||| |.|||| ||||.|||.| || .||.
Sbjct 204 GAACTGGTACCTAAAGCTCTGCGAGCTGTCCAGCGAGCACA---------------CCACGGCACA-CACCACC 261
Query 208 GGCATGAAATATAGGAATCTTGGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATT 281
||.|||....|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 GGGATGCCGCACAGGAATCTTGGGAAATCAGGACTCAGAGTTTCATGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATT 335
Query 282 TGGAGGTCAAATTTCAGATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTG 355
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 336 TGGAGGTCAAATCTCAGATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACAATTGCCTACGAAAGTGGAGTTAATCTCTTCG 409
Query 356 ATACTGCCGAAGTCTATGCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGG 429
|.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 ACACAGCTGAGGTCTATGCTGCTGGGAAGGCTGAGGTGATTCTGGGAAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGG 483
Query 430 AGGTCCAGTCTGGTCATAACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAA 503
||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 484 AGGTCCAGCTTGGTCATCACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAGACAGAAAGGGGACTGTCAAGAAA 557
Query 504 GCATATTATTGAAGGATTGAAGGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATC 577
|||.||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 GCACATCATTGAAGGACTGAAAGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAACTGGAATACGTGGATGTGGTCTTTGCAAATC 631
Query 578 GACCGGACAGTAACACTCCCATGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATG 651
|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 632 GCCCAGACAGCAACACTCCCATGGAAGAAATCGTTCGAGCCATGACGCACGTGATCAACCAAGGCATGGCCATG 705
Query 652 TACTGGGGCACCTCGAGATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGAT 725
|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||||.|||||
Sbjct 706 TACTGGGGCACCTCGAGGTGGAGCGCGATGGAGATCATGGAAGCCTACTCTGTCGCACGGCAGTTCAACATGAT 779
Query 726 CCCACCGGTCTGTGAACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCT 799
|||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 780 CCCGCCTGTCTGTGAGCAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAGGTGGAGGTCCAGCTGCCGGAGCTCT 853
Query 800 ACCACAAAATAGGTGTTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAAC 873
||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 854 ACCATAAAATAGGAGTTGGTGCAATGACATGGTCTCCACTTGCTTGTGGAATTATTTCAGGAAAATATGGAAAT 927
Query 874 GGGGTGCCTGAAAGTTCCAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGG 947
||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 928 GGGGTGCCAGAAAGTTCTAGAGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAGGAAAGAATCGTAAGTGAAGAAGG 1001
Query 948 GAGAAAACAGCAAAACAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAG 1021
|||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1002 GAGAAAACAGCAAAACAAGCTGAAAGACCTCTCTCCAATCGCTGAGCGCCTGGGGTGCACGCTACCTCAGCTGG 1075
Query 1022 CTGTTGCGTGGTGCCTGAGAAACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATT 1095
||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1076 CTGTGGCGTGGTGCCTGAGAAATGAGGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCGGAACAACTCATT 1149
Query 1096 GAAAACCTTGGTGCCATTCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCG 1169
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 GAAAACCTTGGTGCCATTCAGGTCCTCCCTAAGATGACATCTCACGTGGTGAACGAGATTGATAACATACTGCG 1223
Query 1170 CAACAAGCCCTACAGCAAGAAGGACTATAGATCA 1203
||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1224 CAACAAGCCCTACAGCAAAAAGGACTATAGATCA 1257