Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07193
- Subject:
- NR_161420.1
- Aligned Length:
- 2238
- Identities:
- 1715
- Gaps:
- 492
Alignment
Query 1 ----------------------------------------ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGACACCAAGAGCCGCGGCAGCAGAGAGGAGCGCTGAAACATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 74
Query 35 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 148
Query 109 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAA 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAA 222
Query 183 GTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTC 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTC 296
Query 257 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 370
Query 331 AACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 444
Query 405 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 518
Query 479 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 592
Query 553 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 666
Query 627 CTTGGAGATAAATGAAATTAGGTCCAGAGTTGAAGTTCCCCTAATTGCTTCCTCTACCATCTGGGAGATAAAAT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTGGAGATAAATGAAATTAGGTCCAGAGTTGAAGTTCCCCTAATTGCTTCCTCTACCATCTGGGAGATAAAAT 740
Query 701 TGTTACCAAAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTTACCAAAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA 814
Query 775 TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA 888
Query 849 GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA 962
Query 923 GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC 1036
Query 997 AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA 1110
Query 1071 GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT 1184
Query 1145 CTGACAA------------------------------------------------------------------- 1151
|||||||
Sbjct 1185 CTGACAAATCGCCAGTACCTACTGCAACATCTTTTCTCCCTACACAGCGACTCCAGCTTGGGAGGGCAGGGCCA 1258
Query 1152 ---------------------------------------------------------------------ATTCT 1156
|||||
Sbjct 1259 GGGTTGTCACAGCTTCCCCTGTGGTGTCTGCCTGCCAAGCACAGCTCTGGAGTTAGCCCTGGGTGTGAGATTCT 1332
Query 1157 CTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATTCATAGAGCTGTG 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATTCATAGAGCTGTG 1406
Query 1231 GAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGAACATATCCTGAA 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGAACATATCCTGAA 1480
Query 1305 GAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGGAAGGGGCTTTGA 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGGAAGGGGCTTTGA 1554
Query 1379 ATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGGCACCTATTTTAT 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGGCACCTATTTTAT 1628
Query 1453 CCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAA 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAA 1702
Query 1527 GAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACAC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACAC 1776
Query 1601 ATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTATGATT------GACATTTTCTGCTCGGC---AGAG 1665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || .||.||.|.|||.| | |.|.
Sbjct 1777 ATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCT----TTCCTCAGCACTTTGTTTGCCC--CCTTAAAC 1844
Query 1666 T---TCAGGGACTGGAATTGCAAGAGTAT--TTTCAT---GCGTGTTG--------AAGA-TGAACTG-GA-AA 1720
| |||.||| |.||.|| .||||.|| |..||| |..|||.| ||.| .||.||| || ||
Sbjct 1845 TTTGTCATGGA--GAAAGTG-GAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATCTGAGAGAA 1915
Query 1721 TCCCT------CCGGCACCTCA-------ATTTCAACATTTCC------AAAAC-------------------- 1755
.|||| |...||||||| .|..||.|||.||| ..|||
Sbjct 1916 GCCCTGTCCTCCACTCACCTCACCCGCCGCTGCCACCATCTCCTCTGTGCCAACTCCTTGTGGACCGCAAGAAA 1989
Query 1756 -------------------------------------------------------------------------- 1755
Sbjct 1990 GCATGACTTTGAAAAAGGGAAGCCATTCCGAGATTTTAAAATGTTCATGGACTATTCCATATTAAAAGCTGTTT 2063
Query 1756 -------------------------------------------------------------------------- 1755
Sbjct 2064 TTGTTGTACAAAATTCACTGATGTTCAGTTCTATTTTATTTTGCCTTCAGAAAAGAAGAAAGTCAAAAATAAAA 2137
Query 1756 -------------------------------------------------------------------------- 1755
Sbjct 2138 CTTTTGTGTATTACAGCAATCATTTGTATCCTCCTGTGTCTTCCAACCCTAAAATTGTTGATGTCCCAAATAAA 2211
Query 1756 ------------------ 1755
Sbjct 2212 CCTTTGGATTTACCTTGA 2229