Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07193
• Subject: NR_161423.1
• Aligned Length: 2102
• Identities: 1563
• Gaps: 508

Alignment

Query    1  ----------------------------------------ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  AGACACCAAGAGCCGCGGCAGCAGAGAGGAGCGCTGAAACATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC  74

Query   35  TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC  148

Query  109  ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAA  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct  149  ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACA--------------------------------  190

Query  183  GTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTC  256
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  ---------------------------------------------------GATATTTGAATGGTGGTATTTTC  213

Query  257  GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC  287

Query  331  AACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  AACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT  361

Query  405  ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC  435

Query  479  TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT  509

Query  553  CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC  583

Query  627  CTTGGAGATAAATGAAATTAGGTCCAGAGTTGAAGTTCCCCTAATTGCTTCCTCTACCATCTGGGAGATAAAAT  700
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  584  CTTGGAGATAAATG------------------------------------------------------------  597

Query  701  TGTTACCAAAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA  774
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  ---------AGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA  662

Query  775  TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA  736

Query  849  GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA  810

Query  923  GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC  884

Query  997  AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA  958

Query 1071  GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT  1032

Query 1145  CTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATT  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  CTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATT  1106

Query 1219  CATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGA  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  CATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGA  1180

Query 1293  ACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGG  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  ACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGG  1254

Query 1367  AAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGG  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  AAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGG  1328

Query 1441  CACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTC  1514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  CACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTC  1402

Query 1515  AGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGG  1588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  AGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGG  1476

Query 1589  CCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTATGATT------GACATTTTCTGC  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||      .||.||.|.|||
Sbjct 1477  CCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCT----TTCCTCAGCACTTTGTTTGC  1546

Query 1657  TCGGC---AGAGT---TCAGGGACTGGAATTGCAAGAGTAT--TTTCAT---GCGTGTTG--------AAGA-T  1710
            .|  |   |.|.|   |||.|||  |.||.|| .||||.||  |..|||   |..|||.|        ||.| .
Sbjct 1547  CC--CCTTAAACTTTGTCATGGA--GAAAGTG-GAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACG  1615

Query 1711  GAACTG-GA-AATCCCT------CCGGCACCTCA-------ATTTCAACATTTCC------AAAAC--------  1755
            ||.||| || ||.||||      |...|||||||       .|..||.|||.|||      ..|||        
Sbjct 1616  GATCTGAGAGAAGCCCTGTCCTCCACTCACCTCACCCGCCGCTGCCACCATCTCCTCTGTGCCAACTCCTTGTG  1689

Query 1756  --------------------------------------------------------------------------  1755
                                                                                      
Sbjct 1690  GACCGCAAGAAAGCATGACTTTGAAAAAGGGAAGCCATTCCGAGATTTTAAAATGTTCATGGACTATTCCATAT  1763

Query 1756  --------------------------------------------------------------------------  1755
                                                                                      
Sbjct 1764  TAAAAGCTGTTTTTGTTGTACAAAATTCACTGATGTTCAGTTCTATTTTATTTTGCCTTCAGAAAAGAAGAAAG  1837

Query 1756  --------------------------------------------------------------------------  1755
                                                                                      
Sbjct 1838  TCAAAAATAAAACTTTTGTGTATTACAGCAATCATTTGTATCCTCCTGTGTCTTCCAACCCTAAAATTGTTGAT  1911

Query 1756  ------------------------------  1755
                                          
Sbjct 1912  GTCCCAAATAAACCTTTGGATTTACCTTGA  1941