Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07309
• Subject: NM_001310084.1
• Aligned Length: 784
• Identities: 624
• Gaps: 77

Alignment

Query   1  ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAG-GTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTC--CACGACA  71
           |||||.|||..||..|..|||||.||| ||.||.| |||||.||||..||.|.|.|..|||  ||  |.|||||
Sbjct   1  ATGGCTTCCACGGGGGCGAGTCGCAGT-CTTGCTGCGTCTCCGCGGCCGCCGCAGGGCCGC--TCCTCGCGACA  71

Query  72  GAACAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGA  145
           |.||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  72  GGACAAGTACTCGGTGCTGTTGCCCACCTACAACGAACGGGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGA  145

Query 146  AAAGCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGAT  219
           |.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 146  AGAGCTTCTCCGAGAGTGCAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGACGGGACAAGAGAA  219

Query 220  GTTGCTGAACAGTTGG-AGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGAC  292
           |||||||||||..||| || |||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 220  GTTGCTGAACAACTGGCAG-AGATCTATGGGCCCGACAGAATTCTCCTAAGACCACGAGAGAAAAAGCTGGGTC  292

Query 293  TAGGAACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCA  366
           |.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||..|.||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 293  TCGGAACTGCCTACATTCATGGAATCAAACACGCCACGGGGAACTATGTGATCATCATGGATGCTGACCTCTCC  366

Query 367  CACCATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCG  440
           ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367  CACCATCCCAAATTTATTCCTGAATTTATCAGGAAACAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCG  440

Query 441  CTACAAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAATCAGCCGTGGGGCCAATTTTTTAA  514
           .|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||                        
Sbjct 441  ATACAAGGGGAATGGGGGTGTTTATGGATGGGATTTGAAAAGAAAGATAA------------------------  490

Query 515  CTCAGATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTAGAG  588
                                                        ||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 491  ---------------------------------------------TCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTACAG  519

Query 589  AAATTAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGAGATGATTGTTCGGGCAAGACAGTTGAA  662
           ||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 520  AAATTAATAGAAAAATGTGTCTCCAAAGGCTATGTCTTTCAGATGGAAATGATTGTTCGAGCAAGACAGATGAA  593

Query 663  TTATACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAA  736
           |||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594  TTACACTATTGGTGAGGTTCCAATTTCATTTGTGGATCGAGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAA  667

Query 737  TAGTATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTATA  780
           ||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|.|
Sbjct 668  TAGTCTCGTTCCTGAAAGGGTTATTGACTCTCTTTGCTACCACA  711