Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07309
• Subject: NM_001317035.1
• Aligned Length: 861
• Identities: 779
• Gaps: 81

Alignment

Query   1  ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAGGTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTCCACGACAGAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAGGTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTCCACGACAGAA  74

Query  75  CAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGAAAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGAAAA  148

Query 149  GCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGATGTT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGATGTT  222

Query 223  GCTGAACAGTTGGAGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGACTAGG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCTGAACAGTTGGAGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGACTAGG  296

Query 297  AACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCACACC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCACACC  370

Query 371  ATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCGCTAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCGCTAC  444

Query 445  AAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAAT---------------------------  491
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 445  AAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAATCAGTGATGGAGTTTTGCCATGTTGCCC  518

Query 492  ------------------------------------------------------CAGCCGTGGGGCCAATTTTT  511
                                                                 ||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AGGCTGGTCACTCCTGGGCTCAAGTGATCCAGCCATCTTGGCCTCCTGGGATTACAGCCGTGGGGCCAATTTTT  592

Query 512  TAACTCAGATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTA  585
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TAACTCAGATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTA  666

Query 586  GAGAAATTAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGAGATGATTGTTCGGGCAAGACAGTT  659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GAGAAATTAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGAGATGATTGTTCGGGCAAGACAGTT  740

Query 660  GAATTATACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATG  733
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GAATTATACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATG  814

Query 734  AAATAGTATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTATA  780
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 815  AAATAGTATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTACA  861