Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07309
• Subject: NM_001317036.1
• Aligned Length: 780
• Identities: 710
• Gaps: 69

Alignment

Query   1  ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAGGTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTCCACGACAGAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAGGTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTCCACGACAGAA  74

Query  75  CAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGAAAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGAAAA  148

Query 149  GCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGATGTT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGATGTT  222

Query 223  GCTGAACAGTTGGAGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGACTAGG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCTGAACAGTTGGAGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGACTAGG  296

Query 297  AACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCACACC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCACACC  370

Query 371  ATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCGCTAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCGCTAC  444

Query 445  AAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAATCAGCCGTGGGGCCAATTTTTTAACTCA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 445  AAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAA----------------------------  490

Query 519  GATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTAGAGAAAT  592
                                                    |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491  -----------------------------------------TCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTAGAGAAAT  523

Query 593  TAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGAGATGATTGTTCGGGCAAGACAGTTGAATTAT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524  TAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGAGATGATTGTTCGGGCAAGACAGTTGAATTAT  597

Query 667  ACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAATAGT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598  ACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAATAGT  671

Query 741  ATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTATA  780
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 672  ATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTACA  711