Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07309
Subject:
NM_010072.4
Aligned Length:
784
Identities:
684
Gaps:
8

Alignment

Query   1  ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAG-GTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTC--CACGACA  71
           |||||.|||..||..|..|||||.||| ||.||.| |||||.||||..||.|.|.|..|||  ||  |.|||||
Sbjct   1  ATGGCTTCCACGGGGGCGAGTCGCAGT-CTTGCTGCGTCTCCGCGGCCGCCGCAGGGCCGC--TCCTCGCGACA  71

Query  72  GAACAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGA  145
           |.||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  72  GGACAAGTACTCGGTGCTGTTGCCCACCTACAACGAACGGGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGA  145

Query 146  AAAGCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGAT  219
           |.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 146  AGAGCTTCTCCGAGAGTGCAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGACGGGACAAGAGAA  219

Query 220  GTTGCTGAACAGTTGG-AGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGAC  292
           |||||||||||..||| || |||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 220  GTTGCTGAACAACTGGCAG-AGATCTATGGGCCCGACAGAATTCTCCTAAGACCACGAGAGAAAAAGCTGGGTC  292

Query 293  TAGGAACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCA  366
           |.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||..|.||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 293  TCGGAACTGCCTACATTCATGGAATCAAACACGCCACGGGGAACTATGTGATCATCATGGATGCTGACCTCTCC  366

Query 367  CACCATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCG  440
           ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367  CACCATCCCAAATTTATTCCTGAATTTATCAGGAAACAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCG  440

Query 441  CTACAAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAATCAGCCGTGGGGCCAATTTTTTAA  514
           .|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 441  ATACAAGGGGAATGGGGGTGTTTATGGATGGGATTTGAAAAGAAAGATAATCAGCCGTGGGGCCAATTTTATAA  514

Query 515  CTCAGATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTAGAG  588
           ||||.||..||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 515  CTCAAATTCTGCTGAGACCTGGAGCGTCAGACTTAACAGGAAGCTTCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTACAG  588

Query 589  AAATTAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGAGATGATTGTTCGGGCAAGACAGTTGAA  662
           ||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 589  AAATTAATAGAAAAATGTGTCTCCAAAGGCTATGTCTTTCAGATGGAAATGATTGTTCGAGCAAGACAGATGAA  662

Query 663  TTATACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAA  736
           |||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663  TTACACTATTGGTGAGGTTCCAATTTCATTTGTGGATCGAGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAA  736

Query 737  TAGTATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTATA  780
           ||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|.|
Sbjct 737  TAGTCTCGTTCCTGAAAGGGTTATTGACTCTCTTTGCTACCACA  780