Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07314
- Subject:
- XM_011510405.3
- Aligned Length:
- 3060
- Identities:
- 2805
- Gaps:
- 252
Alignment
Query 1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG 74
Query 75 CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGG------------------------ 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGTGAGGCGGCCTGCGCGGCGGC 148
Query 125 ---------AGGCTTTGGACGTGGACCGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGC 189
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCGGCCGCAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGC 222
Query 190 TCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATG 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 223 TCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACTGTGTATG 296
Query 264 CAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCA 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCA 370
Query 338 AAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCTCCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGA 411
|||||||
Sbjct 371 AAAACCT------------------------------------------------------------------- 377
Query 412 GTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAA 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 --------GGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAA 443
Query 486 GGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGA 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGA 517
Query 560 TGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAA 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 TGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAA 591
Query 634 AAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAA 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 AAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAA 665
Query 708 AGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAACGCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATG 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAACGCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATG 739
Query 782 AAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAG------ 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAGTCTAGG 813
Query 850 ---GACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGA 920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AGAGACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGA 887
Query 921 GCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGGGATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAA 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGGGATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAA 961
Query 995 ATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTG 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 ATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTG 1035
Query 1069 AAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGACCTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGA 1142
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 AAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGACCTCATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGA 1109
Query 1143 TGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCTGCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGG 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCTGCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGG 1183
Query 1217 GGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATG 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATG 1257
Query 1291 ACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGAC 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGAC 1331
Query 1365 CTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATG 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATG 1405
Query 1439 TACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGC 1512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 TACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGC 1479
Query 1513 CTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAA 1586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAA 1553
Query 1587 GTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCG 1660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCG 1627
Query 1661 TCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTG 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 TCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTG 1701
Query 1735 GCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACAT 1808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 GCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACAT 1775
Query 1809 TGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACT 1882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 TGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACT 1849
Query 1883 GCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAG 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 GCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAG 1923
Query 1957 TCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTT 2030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 TCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTT 1997
Query 2031 ATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTG 2104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 ATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTG 2071
Query 2105 ATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTG 2178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 ATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTG 2145
Query 2179 GGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCTTTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGAG 2252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2146 GGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCTTTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGAGAAGCAGAG 2219
Query 2253 GGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGC 2326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGC 2293
Query 2327 CTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAG----------------- 2383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 CTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAGTTCAGACAGCCTCCTCT 2367
Query 2384 -------------------------------------------------------------------------- 2383
Sbjct 2368 GCTAACACCCTGTGGAAGACAAACTCTGTAAGTGTGGACGGTGGAAGCCGGCAGCGATCTTCGTCAGATCCGCC 2441
Query 2384 --------------------------------------------ATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCG 2413
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 AGCTGTCCATCCACCGCTGCCCCCTCTTCGCGTGACATCTACCAATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCG 2515
Query 2414 TTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATC 2487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 TTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATC 2589
Query 2488 AGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTC 2561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 AGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTC 2663
Query 2562 CACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGT 2635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664 CACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGT 2737
Query 2636 CCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGG 2709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 CCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGG 2811
Query 2710 GTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGT 2783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 GTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGT 2885
Query 2784 GGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGG 2857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 GGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGG 2959
Query 2858 TGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC 2883
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 TGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC 2985