Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07321
• Subject: NM_003900.5
• Aligned Length: 1320
• Identities: 1066
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGTCGCTCACCGTGAAGGCCTACCTTCTGGGCAAGGAGGACGCGGCGCGCGAGATTCGCCGCTTCAGCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGCTGCAGCCCCGAGCCTGAGGCGGAAGCCGAGGCTGCGGCGGGTCCGGGACCCTGCGAGCGGCTGCTGAGCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGGTGGCCGCCCTGTTCCCCGCGCTGCGGCCTGGCGGCTTCCAGGCGCACTACCGCGATGAGGACGGGGACTTG  222

Query    1  ------------------------------ATGGCCATGTCCTACGTGAAGGATGACATCTTCCGAATCTACAT  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTGCCTTTTCCAGTGACGAGGAATTGACAATGGCCATGTCCTACGTGAAGGATGACATCTTCCGAATCTACAT  296

Query   45  TAAAGAGAAAAAAGAGTGCCGGCGGGACCACCGCCCACCGTGTGCTCAGGAGGCGCCCCGCAACATGGTGCACC  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGAGAAAAAAGAGTGCCGGCGGGACCACCGCCCACCGTGTGCTCAGGAGGCGCCCCGCAACATGGTGCACC  370

Query  119  CCAATGTGATCTGCGATGGCTGCAATGGGCCTGTGGTAGGAACCCGCTACAAGTGCAGCGTCTGCCCAGACTAC  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATGTGATCTGCGATGGCTGCAATGGGCCTGTGGTAGGAACCCGCTACAAGTGCAGCGTCTGCCCAGACTAC  444

Query  193  GACTTGTGTAGCGTCTGCGAGGGAAAGGGCTTGCACCGGGGGCACACCAAGCTCGCATTCCCCAGCCCCTTCGG  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTGTGTAGCGTCTGCGAGGGAAAGGGCTTGCACCGGGGGCACACCAAGCTCGCATTCCCCAGCCCCTTCGG  518

Query  267  GCACCTGTCTGAGGGCTTCTCGCACAGCCGCTGGCTCCGGAAGGTGAAACACGGACACTTCGGGTGGCCAGGAT  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACCTGTCTGAGGGCTTCTCGCACAGCCGCTGGCTCCGGAAGGTGAAACACGGACACTTCGGGTGGCCAGGAT  592

Query  341  GGGAAATGGGTCCACCAGGAAACTGGAGCCCACGTCCTCCTCGTGCAGGGGAGGCCCGCCCTGGCCCCACGGCA  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGAAATGGGTCCACCAGGAAACTGGAGCCCACGTCCTCCTCGTGCAGGGGAGGCCCGCCCTGGCCCCACGGCA  666

Query  415  GAATCAGCTTCTGGTCCATCGGAGGATCCGAGTGTGAATTTCCTGAAGAACGTTGGGGAGAGTGTGGCAGCTGC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATCAGCTTCTGGTCCATCGGAGGATCCGAGTGTGAATTTCCTGAAGAACGTTGGGGAGAGTGTGGCAGCTGC  740

Query  489  CCTTAGCCCTCTGGGCATTGAAGTTGATATCGATGTGGAGCACGGAGGGAAAAGAAGCCGCCTGACCCCCGTCT  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTTAGCCCTCTGGGCATTGAAGTTGATATCGATGTGGAGCACGGAGGGAAAAGAAGCCGCCTGACCCCCGTCT  814

Query  563  CTCCAGAGAGTTCCAGCACAGAGGAGAAGAGCAGCTCACAGCCAAGCAGCTGCTGCTCTGATCCCAGCAAGCCG  636
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  CTCCAGAGAGTTCCAGCACAGAGGAGAAGAGCAGCTCACAGCCAAGCAGCTGCTGCTCTGACCCCAGCAAGCCG  888

Query  637  GGTGGGAATGTTGAGGGCGCCACGCAGTCTCTGGCGGAGCAGATGAGAAAGATCGCCTTGGAGTCCGAGGGGCG  710
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGGGAATGTTGAGGGCGCCACGCAGTCTCTGGCGGAGCAGATGAGGAAGATCGCCTTGGAGTCCGAGGGGCG  962

Query  711  CCCTGAGGAACAGATGGAGTCGGATAACTGTTCAGGAGGAGATGATGACTGGACCCATCTGTCTTCAAAAGAAG  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGAGGAACAGATGGAGTCGGATAACTGTTCAGGAGGAGATGATGACTGGACCCATCTGTCTTCAAAAGAAG  1036

Query  785  TGGACCCGTCTACAGGTGAACTCCAGTCCCTACAGATGCCAGAATCCGAAGGGCCAAGCTCTCTGGACCCCTCC  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGACCCGTCTACAGGTGAACTCCAGTCCCTACAGATGCCAGAATCCGAAGGGCCAAGCTCTCTGGACCCCTCC  1110

Query  859  CAGGAGGGACCCACAGGGCTGAAGGAAGCTGCCTTGTACCCACATCTCCCGCCAGAGGCTGACCCGCGGCTGAT  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGAGGGACCCACAGGGCTGAAGGAAGCTGCCTTGTACCCACATCTCCCGCCAGAGGCTGACCCGCGGCTGAT  1184

Query  933  TGAGTCCCTCTCCCAGATGCTGTCCATGGGCTTCTCTGATGAAGGCGGCTGGCTCACCAGGCTCCTGCAGACCA  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGTCCCTCTCCCAGATGCTGTCCATGGGCTTCTCTGATGAAGGCGGCTGGCTCACCAGGCTCCTGCAGACCA  1258

Query 1007  AGAACTATGACATCGGAGCGGCTCTGGACACCATCCAGTATTCAAAGCATCCCCCGCCGTTG  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAACTATGACATCGGAGCGGCTCTGGACACCATCCAGTATTCAAAGCATCCCCCGCCGTTG  1320