Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07324
• Subject: XM_006529794.3
• Aligned Length: 2025
• Identities: 1499
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ATGTCACACCTGCCGATGAAACTCCTGCGTAAGAAGATCGAGAAGCGGAACCTCAAATTGCGGCAGCGGAACCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAAGTTTCAGGGGGCCTCAAATCTGACCCTATCGGAAACTCAAAATGGAGATGTATCTGAAGAAACAATGGGAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTAGAAAGGTTAAAAAATCAAAACAAAAGCCCATGAATGTGGGCTTATCAGAAACTCAAAATGGAGGCATGTCT  222
                                                                                |||.||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------ATGCCT  6

Query  223  CAAGAAGCAGTGGGAAATATAAAAGTTACAAAGTCTCCCCAGAAATCCACTGTATTAAGCAATGGAGAAGCAGC  296
            .|.||..|..|||.||||...|||||||.||||||.|||||||||..|||....|||..|||.|||||||||||
Sbjct    7  GAGGAGACCTTGGAAAATGGCAAAGTTAAAAAGTCACCCCAGAAACTCACAACTTTAGCCAACGGAGAAGCAGC  80

Query  297  AATGCAGTCTTCCA-------------ATTCAGAATCAAAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGAGAAAAATGGTGAAT  357
            |          |||             ||||||||..||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||
Sbjct   81  A----------CCAACACCACCTCCTGATTCAGAAGTAAAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGAGGAAAATGGCAAAT  144

Query  358  GATGCTGAGCCTGATACGAAAAAAGCAAAAACTGAAAACAAAGGGAAATCTGAAGAAGAAAGTGCCGAGACTAC  431
            |||||.|.|||||||||.||||||||.||||||                     |||||||||||.|||.||..
Sbjct  145  GATGCCGGGCCTGATACAAAAAAAGCGAAAACT---------------------GAAGAAAGTGCTGAGGCTTG  197

Query  432  TAAAGAAACAGAAAATAATGTGGAGAAGCCAGATAATGATGAAGATGAGAGTGAGGTGCCCAGTCTGCCCCTGG  505
            |.|.|||.|||||.||.|||||.|.|||            |.||||||.||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct  198  TGAGGAACCAGAAGATGATGTGAAAAAG------------GCAGATGACAGCGAGGTGCCCAGCCTGCCCCTAG  259

Query  506  GACTGACAGGAGCTTTTGAGGATACTTCGTTTGCTTCTCTATGTAATCTTGTCAATGAAAACACTCTGAAGGCA  579
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|.|.||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  260  GACTGACAGGTGCTTTTGAGGACACTTCATTTGCTTCCTTGTCTAATCTCGTCAATGAGAACACCCTGAAGGCC  333

Query  580  ATAAAAGAAATGGGTTTTACAA--ACATGACTGAAATTCAGCATAAAAGTATCAGACCACTTCTGGAAGGCAGG  651
            |||.||||||||||.||  |||  .||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  334  ATAGAAGAAATGGGCTT--CAAGCGCATGACGGAGATCCAGCATAAAAGTATCAGGCCACTTCTGGAAGGCAGG  405

Query  652  GATCTTCTAGCAGCTGCAAAAACAGGCAGTGGTAAAACCCTGGCTTTTCTCATCCCTGCAGTTGAACTCATTGT  725
            ||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||...|.||.||||||||
Sbjct  406  GACCTTCTGGCGGCTGCGAAAACCGGCAGTGGCAAAACCCTCGCTTTCCTCATCCCTGTGATCGAGCTCATTGT  479

Query  726  TAAGTTAAGGTTCATGCCCAGGAATGGAACAGGAGTCCTTATTCTCTCACCTACTAGAGAACTAGCCATGCAAA  799
            .|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  480  CAAGTTGAAGTTCATGCCCAGGAATGGAACAGGAGTCCTGATTCTCTCTCCTACCAGAGAACTGGCCATGCAGA  553

Query  800  CCTTTGGTGTTCTTAAGGAGCTGATGACTCACCACGTGCATACCTATGGCTTGATAATGGGTGGCAGTAACAGA  873
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||..||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  554  CCTTTGGTGTTCTCAAGGAGCTGATGACGCACCACGTTCACACGTATGGGCTGATCATGGGCGGCAGCAACAGG  627

Query  874  TCTGCTGAAGCACAGAAACTTGGTAATGGGATCAACATCATTGTGGCCACACCAGGCCGTCTGCTGGACCATAT  947
            ||||||||||..|||||.||....|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  628  TCTGCTGAAGTGCAGAAGCTCCTCAATGGGATCAACATCATCGTGGCCACGCCCGGCCGGCTCCTGGACCACAT  701

Query  948  GCAGAATACCCCAGGATTTATGTATAAAAACCTGCAGTGTCTGGTTATTGATGAAGCTGATCGTATCTTGGATG  1021
            ||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  702  GCAGAACACGCCAGGGTTTATGTACAAGAACCTGCAGTGTCTGGTTATTGATGAGGCTGACCGTATCTTGGATG  775

Query 1022  TGGGGTTTGAAGAGGAATTAAAGCAAATTATTAAACTTTTGCCAACACGTAGACAGACTATGCTCTTTTCTGCC  1095
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  776  TTGGGTTTGAAGAAGAATTAAAGCAAATTATTAAACTTTTGCCAGCCCGTAGGCAAACCATGCTCTTTTCTGCC  849

Query 1096  ACCCAAACTCGAAAAGTTGAAGACCTGGCAAGGATTTCTCTGAAAAAGGAGCCATTGTATGTTGGCGTTGATGA  1169
            ||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct  850  ACACAAACTCGAAAAGTTGAAGACTTGGCAAGAATTTCTCTGAAAAAGGAGCCTTTGTACGTGGGTGTTGATGA  923

Query 1170  TGATAAAGCGAATGCAACAGTGGATGGTCTTGAACAGGGATATGTTGTTTGTCCTTCTGAAAAGAGATTCCTTC  1243
            .||.||||.|..|||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  924  CGACAAAGAGGTTGCCACAGTGGATGGCCTTGAGCAGGGCTATGTTGTTTGTCCCTCTGAGAAGAGGTTCCTTC  997

Query 1244  TGCTCTTTACATTCCTTAAGAAGAACCGAAAGAAGAAGCTTATGGTCTTCTTTTCATCTTGTATGTCTGTGAAA  1317
            ||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  TGCTTTTCACATTCCTTAAGAAGAACCGGAAGAAGAAAGTGATGGTCTTCTTTTCATCTTGTATGTCTGTGAAA  1071

Query 1318  TACCACTATGAGTTGCTGAACTACATTGATTTGCCCGTCTTGGCCATTCATGGAAAGCAAAAGCAAAATAAGCG  1391
            ||||||||||||.||.|||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  TACCACTATGAGCTGTTGAACTACATTGACCTTCCCGTCTTGGCCATCCATGGAAAGCAAAAGCAAAATAAGCG  1145

Query 1392  TACAACCACATTCTTCCAGTTCTGCAATGCAGATTCGGGAACACTATTGTGTACGGATGTGGCAGCGAGAGGAC  1465
            .||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||.|||..|||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1146  AACAACCACGTTTTTCCAGTTCTGCAACGCGGATTCAGGAATACTGCTGTGTACTGATGTGGCAGCCAGAGGGC  1219

Query 1466  TAGACATTCCTGAAGTCGACTGGATTGTTCAGTATGACCCTCCGGATGACCCTAAGGAATATATTCATCGTGTG  1539
            |.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1220  TGGACATCCCCGAAGTGGACTGGATTGTTCAGTACGACCCTCCCGATGACCCCAAGGAATACATTCATCGTGTT  1293

Query 1540  GGTAGAACAGCCAGAGGCCTAAATGGGAGAGGGCATGCCTTGCTCATTTTGCGCCCAGAAGAATTGGGTTTTCT  1613
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||.|||||||..|||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1294  GGTAGAACAGCCAGGGGCCTGAATGGAAGAGGGCACGCCCTGCTCATCCTGCGCCCTGAAGAGTTGGGTTTCCT  1367

Query 1614  TCGCTACTTGAAACAATCCAAGGTTCCATTAAGTGAATTTGACTTTTCCTGGTCTAAAATTTCTGACATTCAGT  1687
            |||.|||||||||||.||||||||||||||.|.|.|.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.||||
Sbjct 1368  TCGTTACTTGAAACAGTCCAAGGTTCCATTGAATCAGTTTGACTTCTCCTGGTCTAAAGTTTCTGATATCCAGT  1441

Query 1688  CTCAGCTTGAGAAATTGATTGAAAAGAATTACTTTCTTCATAAGTCAGCCCAGGAAGCATATAAGTCATACATA  1761
            |||||||.||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1442  CTCAGCTGGAAAAACTGATCGAAAAGAACTACTTTCTCCACAAGTCTGCCCAGGAAGCATACAAATCCTACATA  1515

Query 1762  CGAGCCTATGATTCCCATTCTCTGAAACAGATCTTTAATGTTAATAACCTAAATTTGCCTCAGGTTGCTCTGTC  1835
            .||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1516  AGAGCATATGACTCTCACTCTCTCAAGCAGATCTTCAACGTGAACAACTTAAATCTGCCTCAGGTTGCTCTGTC  1589

Query 1836  ATTTGGTTTCAAGGTGCCTCCCTTCGTTGATCTGAACGTCAACAGTAATGAAGGCAAGCAGAAAAAGCGAGGAG  1909
            .||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|.|||..||||.|||||||..||.|||.||||.|
Sbjct 1590  TTTTGGTTTTAAGGTCCCTCCTTTTGTTGATCTGAATGTGAGCAGCCATGATGGCAAGCTTAAGAAGAGAGGCG  1663

Query 1910  GTGGTGGTGGATTTGGCTACCAGAAAACCAAGAAAGTTGAGAAATCCAAAATCTTTAAACACATTAGCAAGAAA  1983
            |||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1664  GTGGTGGCGGATTCGGCTACCAGAAAACAAAGAAAGTGGAGAAGTCCAAGATCTTTAAACACATCAGTAAGAAG  1737

Query 1984  TCATCTGACAGCAGGCAGTTCTCTCAC  2010
            .||.|.|||.|||||||||||||.|||
Sbjct 1738  CCAGCAGACCGCAGGCAGTTCTCACAC  1764