Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07328
- Subject:
- NR_146783.2
- Aligned Length:
- 3715
- Identities:
- 3015
- Gaps:
- 694
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGAACCCAGCTCTTCCCTACACGGTCGGCACATGCGCGGCAGCTCTTTTCCTTCTTCCTCCACTTCCCCTACCC 74
Query 1 ----------------------------------------------------ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCACCGTCCGGGAGCCGCCGCCACCGCCGCCGAGGAGTCAGGAAGTTCAAGATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT 148
Query 23 CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA 222
Query 97 GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA 296
Query 171 TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG 370
Query 245 AGGTTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA 318
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGATTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA 444
Query 319 GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC 518
Query 393 TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA 592
Query 467 ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA 666
Query 541 AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT 740
Query 615 TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA 814
Query 689 GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG 888
Query 763 GCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAAT 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAAT 962
Query 837 TATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAAG 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAAG 1036
Query 911 ACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATCT 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATCT 1110
Query 985 CCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAG 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAG 1184
Query 1059 AAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAGC 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAGC 1258
Query 1133 AGAGCAAATACCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACGA 1206
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACGA 1332
Query 1207 GAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGATC 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGATC 1406
Query 1281 AAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTC 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTC 1480
Query 1355 GTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTACTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGG 1428
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTCCTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGG 1554
Query 1429 AGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGA 1502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGA 1628
Query 1503 AGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAAG 1576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAAG 1702
Query 1577 ACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAG 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAG 1776
Query 1651 AAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAG 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAG 1850
Query 1725 AACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAATG 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAATG 1924
Query 1799 TTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCAG 1872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCAG 1998
Query 1873 AAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTCT 1946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTCT 2072
Query 1947 TCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGCT 2020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGCT 2146
Query 2021 ATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATTC 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATTC 2220
Query 2095 AGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATGA 2168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATGA 2294
Query 2169 GCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAAT 2242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAAT 2368
Query 2243 TTCATTGTCTGAGACTCTTAAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCATG 2316
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TTCATTGTCTGAGACTCTTCAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCATG 2442
Query 2317 AACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAAGCTGTAAGATCCTATAGTCA 2390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAAGCTGTAAGATCCTATAGTCA 2516
Query 2391 GCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATCC 2464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATCC 2590
Query 2465 TGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACATA 2538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACATA 2664
Query 2539 ACACCTTATCTTTTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAGA 2612
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAGA 2738
Query 2613 TATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAACC 2686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAACC 2812
Query 2687 ATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGAT 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGAT 2886
Query 2761 CAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGT 2834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGT 2960
Query 2835 TATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAAC 2908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAAC 3034
Query 2909 GTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCATC 2982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCATC 3108
Query 2983 AACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCCGGAAAAAATT----------------------------------- 3021
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 3109 AACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATTTAAACAAGATGAAGAAACTCCAAGGGTTTGAGTAA 3182
Query 3022 -------------------------------------------------------------------------- 3021
Sbjct 3183 ATACAAAGACTGAAGAAATTTCACAGCAGTTTATTAATGTGTGTGTGTGCAGGCCACAGCAGCATGCCCTTGGT 3256
Query 3022 -------------------------------------------------------------------------- 3021
Sbjct 3257 GTAGTCAGTGCCGAAAGGGGTCTGTTCCTTCTTGAGCCTGCCTGCAGGGATGGTCTCCTTTTAAAGCAGGTTGT 3330
Query 3022 -------------------------------------------------------------------------- 3021
Sbjct 3331 GTGCAGCATTCAGTACACTGAAGGCATAAACCTTCCACTCTTGAACAAAGCAGCTGCTTTTTAAAAGCGAGAAA 3404
Query 3022 -------------------------------------------------------------------------- 3021
Sbjct 3405 AAGGAAAACGGGGCACAGGCCATTCGACGCCTTCTCCAAGGGGTCTGATTTGCTGAGACACCAGCTTCACCTTC 3478
Query 3022 -------------------------------------------------------------------------- 3021
Sbjct 3479 TTAACAAGGTGCAGCTCAGTGGAAGATGATGACAACCAGAAGACATGAGCTAAGGGTAAGGGACTGTTCTGAAG 3552
Query 3022 -------------------------------------------------------------------------- 3021
Sbjct 3553 AACCTTTCCATTTAGTGATCAAGATATGGAAGCTGATTTCTGAAAATGCTCAGTGTGTACTCTAATTATTTATG 3626
Query 3022 -------------------------------------------------------------------------- 3021
Sbjct 3627 GTACCATTTGAATTGTAACTTGCATTTTAGCAGTGCATGTTTCTAATTGACTTACTGGGAAACTGAATAAAATA 3700
Query 3022 --------------- 3021
Sbjct 3701 TGCCTCTTATTATCA 3715