Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07366
- Subject:
- NM_001318369.2
- Aligned Length:
- 2391
- Identities:
- 1686
- Gaps:
- 702
Alignment
Query 1 ATGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACTGCCAGCCAACAGCCCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGAGCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCGGCTGCCGCCCCGCCGCCGCCAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTGTGCCCAGGTCCGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCAGCGGACGCGCGAGCCTGCGAGGCTGAGCGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCAGGAGTGGGGTCTTGCAAACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGGCGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGACTTGAGAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGCGCAAGGCGCGCAGGCCTCGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGGCCCGGCAACGCGTTGCACTGTAAGATCCCTT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCTGCGAGGCCCGGAGGGGGATGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACCCTGGAGCGGAACAATACCCCTGTT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTGGGCTGGGTGAACATGAGCCAGAGCACCGTGGTGCTGGGCACGGATGGAATCACGTCCGTGCTCCCGGGCAG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CGTGGCCACCGTTGCCACCCAGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAAC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTCTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CAGAACGGGGGAGGTGCTTTCCTCATCCCTTACCTGATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------ATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTT 38
Query 741 GGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACAAGGCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 GGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACAAGGCT 112
Query 815 GTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAATAGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTATACACTTTTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 GTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAATAGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTATACACTTTTC 186
Query 889 TACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCTGGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACACCAGAATGCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 187 TACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCTGGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACGCCAGAATGCAA 260
Query 963 AGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 AGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTT 334
Query 1037 TCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 TCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGA 408
Query 1111 AGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 AGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCC 482
Query 1185 ACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCGTTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAA 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 ACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCATTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAA 556
Query 1259 AAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 AAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCT 630
Query 1333 GGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 GGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGA 704
Query 1407 TGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 TGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAAT 778
Query 1481 TCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 TCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTC 852
Query 1555 GTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 GTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCC 926
Query 1629 AGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 AGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTT 1000
Query 1703 TCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 TCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGAC 1074
Query 1777 GAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 GAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGG 1148
Query 1851 TTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 TTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTG 1222
Query 1925 TCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 TCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAG 1296
Query 1999 ATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 ATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTT 1370
Query 2073 TATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAACCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 TATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAGCCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGG 1444
Query 2147 TGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 TGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCC 1518
Query 2221 CCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 CCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACA 1592
Query 2295 CCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 CCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGG 1666
Query 2369 ATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 2391
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 ATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 1689