Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07366
• Subject: XM_006540546.3
• Aligned Length: 2445
• Identities: 2124
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  --------------------------------------AT-------GGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAA  29
                                                  ||       |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCACCTGAAACTCACATGGTGCCTTCACATCCATCATCCGTAGAGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAA  74

Query   30  TAAACTGCCAGCCAACAGCCCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCACCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGA  103
            |||||.|||||||||||.|..|||   |||.||||.||..|||||||.||||.|.||..|.||.||.|||||.|
Sbjct   75  TAAACAGCCAGCCAACATCTTGGA---GGCAGCGGTGCCAGGCCACCGGGATAGTCCTCGTGCACCTAGGACCA  145

Query  104  GCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCGGCTGCCGCCCCG---------CCGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCCGCTTCC  168
            ||||.||.|||||.|||||.||.|..|||.||.||         |.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  146  GCCCTGAACAGGATCTTCCTGCTGAGGCCCCCACGGCCACTGTCCAGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCGGCTTCC  219

Query  169  ACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCAGCGGACGCGCGAGCCTGCGAGGCTGAGCGGCCAGGAGTGGGGTCTTGCAA  242
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||..|||.|.|.|||||.||||.|||.||
Sbjct  220  ACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCTGCGGATGCGAGAGCCTGCGAGGCCCAGCAGTCCGGAGTAGGGTTTTGTAA  293

Query  243  ACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGGCGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGACTTGAGAGAGGCGCAAGGCGCGCAGGCCT  316
            .|||||.|||||.|||||.||.|||.||||.||.||.||.||||||||.||.||.|.|||..||||.||||||.
Sbjct  294  TCTCAGCAGCCCCCGGGCACAAGCGACCTCCGCGGCCCTCCGGGACTTAAGCGAAGGGCACAGCGCACAGGCCA  367

Query  317  CGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGGCCCGGCAACGCGTTGCACTGTAAGATCCCTTCTCTGCGAGGCCCGGAGGGG  390
            ..||||||.|||||..|.|||||.|.||||||||..|||||||.|||||.||..|||||||.||||||||||.|
Sbjct  368  ATCCCCCTTCCGGGCCCGCCGGGGCTGGCAACGCTCTGCACTGCAAGATTCCAGCTCTGCGTGGCCCGGAGGAG  441

Query  391  GATGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACCCTGGAGCGGAACAATACCCCTGTTGTGGGCTGGGTGAACATGAG  464
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||||.|..||||||||||||||.|||||
Sbjct  442  GACGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACGCTGGAGCACAACAATACCCCAGCCGTGGGCTGGGTGAATATGAG  515

Query  465  CCAGAGCACCGTGGTGCTGGGCACGGATGGAATCACGTCCGTGCTCCCGGGCAGCGTGGCCACCGTTGCCACCC  538
            |||||||||.||.|||.||||.||.|||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||..|.|||..|
Sbjct  516  CCAGAGCACAGTAGTGTTGGGAACCGATGGCATCGCGTCGGTGCTCCCGGGCAGCGTGGCCACCACTACCATAC  589

Query  539  AGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATG  612
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATG  663

Query  613  GTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTCTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGTGCTTT  686
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  664  GTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTTTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGCGCGTT  737

Query  687  CCTCATCCCTTACCTGATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTTGGAGGTGTCGCTGGGCCAGT  760
            |||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||
Sbjct  738  CCTCATCCCTTACTTGATGATGCTGGCACTGGCTGGCTTACCCATCTTCTTCCTAGAGGTGTCCCTGGGCCAGT  811

Query  761  TTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACAAGGCTGTGGCATCGCGATGCTGATC  834
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  812  TTGCCAGCCAGGGTCCTGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTGCAGGGTTGTGGCATTGCGATGCTCATC  885

Query  835  ATCTCTGTCCTAATAGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTATACACTTTTCTACCTGTTTGCCTCCTTTGT  908
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  886  ATCTCTGTCCTCATAGCCATATACTACAACGTCATCATCTGCTACACGCTCTTCTACCTGTTTGCCTCCTTCGT  959

Query  909  GTCTGTACTACCCTGGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACACCAGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTAT  982
            ||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  960  GTCTGTGCTGCCCTGGGGGTCCTGCAACAACCCGTGGAACACACCAGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTAC  1033

Query  983  TAGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTTTCTGCATGACCGCTTATCCC  1056
            |||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1034  TAGATTCCTGTGTTATCGGTGACCATCCCAAGATACAGATCAAGAACTCTACTTTCTGCATGACTGCCTATCCG  1107

Query 1057  AACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGAAGTGAAGAGTACTTCAAGTA  1130
            |||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  AACTTGACAATGGTTAACTTCACCAGCCAGACCAATAAGACATTTGTCAGCGGGAGTGAAGAGTACTTCAAGTA  1181

Query 1131  CTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCCACTAGCTCTCTGCCTCTTCC  1204
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||..|.||..|||||||.|||.
Sbjct 1182  TTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCGGGTGAGATCCGGTGGCCCTTGGCCTTCTGCCTTTTCT  1255

Query 1205  TGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCGTTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAAAAGTGGTGTACTTCACGGCC  1278
            ||||||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1256  TGGCTTGGGTGATTGTGTACGCATCACTGGCGAAAGGAATTAAGTCATCAGGAAAAGTAGTCTACTTCACAGCC  1329

Query 1279  ACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCTGGAGCTGGAGCTGGGATCTG  1352
            ||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1330  ACATTCCCTTATGTCGTCCTGGTCATCCTCCTTATTCGAGGAGTCACCCTGCCTGGAGCTGGAGCCGGCATCTG  1403

Query 1353  GTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGATGCTGCCACTCAGATTTTCT  1426
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1404  GTACTTCATCACACCTAAGTGGGAAAAACTCACGGATGCCACGGTATGGAAGGATGCGGCCACTCAGATTTTCT  1477

Query 1427  TCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGG  1500
            ||||..|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  TCTCCCTGTCTGCGGCCTGGGGAGGGCTCATCACTCTTTCTTCTTACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGG  1551

Query 1501  GACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTCGTCATCTTCTCCGTTATCGG  1574
            ||.||..|||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1552  GATACGTTAATTGTAACCTGCACTAACAGTGCCACTAGCATCTTTGCTGGGTTTGTCATCTTCTCTGTCATCGG  1625

Query 1575  CTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCCAGGCATTGCATTTGTGGTTT  1648
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1626  CTTCATGGCCAACGAGCGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCCGACCAAGGGCCTGGCATTGCATTTGTGGTTT  1699

Query 1649  ACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTTTCCTGATGCTCCTCACTCTT  1722
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1700  ACCCTGAGGCCTTAACTAGGCTGCCTCTCTCTCCATTCTGGGCCATCATCTTTTTTCTGATGCTTCTCACGCTT  1773

Query 1723  GGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGACGAGTTTCCCAAGTACCTACG  1796
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1774  GGACTCGACACCATGTTTGCCACCATTGAGACCATCGTGACCTCCATCTCGGATGAGTTTCCCAAGTACCTGCG  1847

Query 1797  CACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGGTTTTCCAATGATCACTCAGG  1870
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 1848  CACACACAAGCCTGTGTTCACCCTGGGCTGCTGCATCTGCTTCTTCATTATGGGCTTCCCTATGATCACACAGG  1921

Query 1871  GTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTGTCATCATTGCCATTTTTGAG  1944
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1922  GTGGAATCTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTACGCTGCCTCCTATGCCCTTGTCATCATTGCCATATTTGAG  1995

Query 1945  CTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAGATGATGATTGGATTCCAGCC  2018
            ||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1996  CTTGTTGGCATCTCCTATGTGTATGGCTTGCAGAGATTCTGTGAAGACATCGAGATGATGATTGGATTCAAGCC  2069

Query 2019  TAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTTTATCCTTTGCTTCAGCTTTT  2092
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2070  CAACATTTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTCGTCACACCGACCATTTTGACTTTTATCCTTTGCTTCAGCTTCT  2143

Query 2093  ACCAGTGGGAACCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGGTGCTCGGATGGCTAATGCTC  2166
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2144  ACCAGTGGGAGCCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTACCCTAACTGGTCCATGGTGCTTGGATGGCTGATGCTC  2217

Query 2167  GCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCCCCTGGAAGATTTATTGAGAG  2240
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2218  GCCTGCTCCGTTATCTGGATCCCGATTATGTTCGTGATAAAAATGTATCTGGCTCCCGGGAGATTTATTGAGAG  2291

Query 2241  GCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACACCGCGGGGAGCGTTACAAGA  2314
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2292  GCTGAAGTTGGTATGCTCGCCACAGCCCGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAGCACCGCGGGGAACGCTACAAGA  2365

Query 2315  ACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAG  2388
            |.||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  ATATGATCGACCCCTTGGGAACTTCGTCGCTGGGACTCAAGCTGCCCGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAG  2439

Query 2389  TGC  2391
            |||
Sbjct 2440  TGC  2442