Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07384
Subject:
XM_011539005.1
Aligned Length:
861
Identities:
815
Gaps:
42

Alignment

Query   1  MTGRARARARGRARGQETAQLVGSTASQQPGYIQPRPQPPPAEGELFGRGRQRGTAGGTAKSQGLQISAGFQEL  74
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Sbjct   1  MTGRARARARGRARGQETAQLVGSTASQQPGYIQPRPQPPPAEGELFGRGRQRGTAGGTAKSQGLQISAGFQEL  74

Query  75  SLAERGGRRRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTNHFRLTSRPQWALYQYHIDYNPLMEARRLRSA  148
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Sbjct  75  SLAERGGRRRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTNHFRLTSRPQWALYQYHIDYNPLMEARRLRSA  148

Query 149  LLFQHEDLIGKCHAFDGTILFLPKRLQQKVTEVFSKTRNGEDVRITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKI  222
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Sbjct 149  LLFQHEDLIGKCHAFDGTILFLPKRLQQKVTEVFSKTRNGEDVRITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKI  222

Query 223  MNLQQIGRNYYNPNDPIDIPSHRLVIWPGFTTSILQYENSIMLCTDVSHKVLRSETVLDFMFNFYHQTEEHKFQ  296
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Sbjct 223  MNLQQIGRNYYNPNDPIDIPSHRLVIWPGFTTSILQYENSIMLCTDVSHKVLRSETVLDFMFNFYHQTEEHKFQ  296

Query 297  EQVSKELIGLVVLTKYNNKTYRVDDIDWDQNPKSTFKKADGSEVSFLEYYRKQYNQEITDLKQPVLVSQPKRRR  370
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Sbjct 297  EQVSKELIGLVVLTKYNNKTYRVDDIDWDQNPKSTFKKADGSEVSFLEYYRKQYNQEITDLKQPVLVSQPKRRR  370

Query 371  GPGGTLPGPAMLIPELCYLTGLTDKMRNDFNVMKDLAVHTRLTPEQRQREVGRLIDYIHKNDNVQRELRDWGLS  444
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Sbjct 371  GPGGTLPGPAMLIPELCYLTGLTDKMRNDFNVMKDLAVHTRLTPEQRQREVGRLIDYIHKNDNVQRELRDWGLS  444

Query 445  FDSNLLSFSGRILQTEKIHQGGKTFDYNPQFADWSKETRGAPLISVNPLDNWLLIYTRRNYEAANSLIQNLFKV  518
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Sbjct 445  FDSNLLSFSGRILQTEKIHQGGKTFDYNPQFADWSKETRGAPLISVKPLDNWLLIYTRRNYEAANSLIQNLFKV  518

Query 519  TPAMGMQMKKAIMIEVDDRTEAYLRVLQQKVTADTQIVVCLLSSNRKDKYDAIKKYPCTDCPTPSQCVVARTLG  592
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Sbjct 519  TPAMGMQMRKAIMIEVDDRTEAYLRVLQQKVTADTQIVVCLLSSNRKDKYDAIKKYLCTDCPTPSQCVVARTLG  592

Query 593  KQQTVMAIATKIALQMNCKMGGELWRVDIPLKLVMIVGIDCYHDMTAGRRSIAGFVASINEGMTRWFSRCIFQD  666
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Sbjct 593  KQQTVMAIATKIALQMNCKMGGELWRVDIPLKLVMIVGIDCYHDMTAGRRSIAGFVASINEGMTRWFSRCIFQD  666

Query 667  RGQELVDGLKVCLQAALRAWNSCNEYMPSRIIVYRDGVGDGQLKTLVNYEVPQFLDCLKSIGRGYNPRLTVIVV  740
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.        
Sbjct 667  RGQELVDGLKVCLQAALRAWNSCNEYMPSRIIVYRDGVGDGQLKTLVNYEVPQFLDCLKSIGRGYK--------  732

Query 741  KKRVNTRFFAQSGGRLQNPLPGTVIDVEVTRPEWYDFFIVSQAVRSGSVSPTHYNVIYDNSGLKPDHIQRLTYK  814
                                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733  ----------------------------------YDFFIVSQAVRSGSVSPTHYNVIYDNSGLKPDHIQRLTYK  772

Query 815  LCHIYYNWPGVIRVPAPCQYAHKLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL  861
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Sbjct 773  LCHIYYNWPGVIRVPAPCQYAHKLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL  819