Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07393
• Subject: NM_004246.3
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1657
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74

Query   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148

Query  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222

Query  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296

Query  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370

Query  371  GGTGGAGTGAAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGACGATAGAGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTGGAGTGAAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGACGATAGAGAAC  444

Query  445  GCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCAAAACGTGGATCGTTATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCAAAACGTGGATCGTTATGC  518

Query  519  CTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTCA  592

Query  593  CCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCATC  666

Query  667  CTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGAA  740

Query  741  TGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTGG  814

Query  815  GTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGAG  888

Query  889  AGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCGC  962

Query  963  CCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGAC  1036

Query 1037  CCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAAA  1110

Query 1111  GCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGGG  1184

Query 1185  CGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTCA  1258

Query 1259  TTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAAG  1332

Query 1333  GCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGAA  1406

Query 1407  GAACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTGC  1480
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTGC  1480

Query 1481  AGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACACCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCAA  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACATCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCAA  1554

Query 1555  CAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACAC  1628

Query 1629  CATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1659
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1659