Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07393
• Subject: NM_175681.3
• Aligned Length: 1684
• Identities: 1307
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGC-TC-TCTCTGGGCCCCTGG  146
                                                               .||| || .|||||||.||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------ATGCGTCGGCTCTGGGGCCCTGG  23

Query  147  GAGGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGT---TACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGA  217
            ||.||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||||||||   |||||||||.|||||||||||.||..
Sbjct   24  GACGCCCTTCCTCGCCCTGCTTCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACTACAGGATCTCTCCTTGAGGAGACAG  97

Query  218  CTCGGAAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAAC  291
            .||.|||||||||||||||.||..||.|.|||||||.||||||.|||.||.||||||||||..||||||||||.
Sbjct   98  TTCAGAAGTGGGCTCAGTATAAGGAGACGTGTCTGAAAGACTTGCTCGAGAAACCTTCTGGTGTATTTTGTAAT  171

Query  292  GGGACATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTT  365
            ||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  172  GGAACATTTGATAAGTACGTGTGCTGGCCTCATTCTTTTCCTGGAAATGTCTCTGTCCCCTGTCCTTCATACTT  245

Query  366  ACCTTGGTGGAGTGAAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGACGATAG  439
            |||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||
Sbjct  246  ACCTTGGTGGAATAAAGAGAGCCCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGAAGCAAG  319

Query  440  AGAACGCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCAAAACGTGGATCGT  513
            |||||.||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||..
Sbjct  320  AGAACTCCACAGATACTTGGCAGGATGAGTCAGAATGCTCAGAGAACCACAGCTTCAAACAAAACGTGGATCAC  393

Query  514  T------ATGCCTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTT  581
            |      ||.|||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct  394  TATCACCATACCTTGTTGTCCACCTTGCAGCTGATGTACACTGTGGGCTACTCCCTGTCTCTCATCTCCCTCTT  467

Query  582  CCTGGCTCTCACCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTG  655
            |.|||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.|
Sbjct  468  CTTGGCTCTTACACTCTTCTTGTTCCTTCGAAAACTGCACTGCACACGCAATTACATCCACATGAACCTGTTCG  541

Query  656  CTTCTTTCATCCTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCT  729
            ||||.||||||||||||.|.||||.|||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  542  CTTCGTTCATCCTGAGAGCTCTGGTTGTCCTTGTGAAGGACATGGTCTTCTACAACTCTTACTCCAGGAGGCCT  615

Query  730  GACAATGAGAATGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCA  803
            ||||.|||||.|||.||||||||.||.|||||||||||.||..|||||||||||||.||||||||.|||.||||
Sbjct  616  GACAGTGAGAGTGGATGGATGTCATATCTGTCAGAGATTTCTGCCTCCTGCCGCTCTGTCCAGGTCCTCCTGCA  689

Query  804  TTACTTTGTGGGTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAG  877
            .|||||||||||..|||||.||||.|||.|||||||||||||.||.||||||||..|.|||||||||||.||||
Sbjct  690  CTACTTTGTGGGCACCAATCACTTGTGGTTGCTGGTTGAAGGACTTTACCTCCATGCTCTGCTGGAGCCAACAG  763

Query  878  TGCTTCCTGAGAGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCC  951
            ||||||||||.||||||||||||||||..||||||.||.||||||||||||||||..||||.||||||.|.|||
Sbjct  764  TGCTTCCTGAAAGGCGGCTGTGGCCCAAGTACCTGGTGGTGGGTTGGGCCTTCCCCATGCTGTTTGTTATTCCC  837

Query  952  TGGGGTTTCGCCCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGAT  1025
            |||..|||.|.|||.|||..|||||||||.||||||||||||.||..|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  838  TGGATTTTTGTCCGAGCAAGCCTGGAGAATACAGGGTGCTGGGCAGTAAATGAGAATAAGAAAATCTGGTGGAT  911

Query 1026  CATCCGAGGACCCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTT  1099
            ||||.||||||||||..||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  912  CATCAGAGGACCCATTCTGCTTTGTGTAACAGTTAATTTCTTCATCTTCCTCAAGATTCTCAAGCTTCTCATTT  985

Query 1100  CTAAGCTCAAAGCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATT  1173
            |||||.|||.|||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct  986  CTAAGTTCAGAGCTCATCAGATGTGCTTCAGAGACTACAAATATAGACTGGCAAAATCAACCCTGCTCCTCATT  1059

Query 1174  CCTTTATTGGGCGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTAT  1247
            |.|||..||||.|||||||||.||||||||.|||||.||||.||.||.||||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 1060  CTTTTGATGGGGGTTCATGAGTTCCTCTTCACTTTCTTCACCGACGACCAAGTTCAAGGATTTTCAAGACTTAT  1133

Query 1248  ACGACTTTTCATTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATG  1321
            .||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||.|.
Sbjct 1134  TCGTCTCTTCATCCAGTTGACCCTGAGCTCCTTCCATGGATTTCTGGTGGCCTTGCAGTACGGCTTTGCCAGTA  1207

Query 1322  GAGAGGTGAAGGCTGAGCTGCGGAAATA-CTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTG  1394
            |||||||||||||.|||||| .||||.| |||||.|||||||||..||||.|||||||..||||||||||||||
Sbjct 1208  GAGAGGTGAAGGCAGAGCTG-AGAAAGACCTGGGGCCGCTTCTTATTAGCTCGCCACTGGGGCTGCAGAGCCTG  1280

Query 1395  TGTCCTGGGGAAGAACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGC  1468
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||||..|
Sbjct 1281  TGTCCTAGGGAAGAACTTCCGGTTCCTGGGGAAATGTTCCAAGAAGCTGTCGGAGGGAGATGGTGCCGAGACAC  1354

Query 1469  TTCGGAAGCTGCAGCCCTCA-CTTAACAGTGGGCGGCTCCTACACCT----------AGCCATGCGAGGTCTTG  1531
            |.|.|||||||||      | |||  |||..|.|.||||  ||||||          |.|| ||||.|.||.||
Sbjct 1355  TCCAGAAGCTGCA------ATCTT--CAGGTGTCAGCTC--ACACCTGACCGCTGGGAACC-TGCGGGATCATG  1417

Query 1532  GGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCAACA-GGACCATGCACGC-TGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTG  1603
            ||         ||.|||||.| ||| ||.||.||.| || ||||||||||..|||||||||||.|||.||||.|
Sbjct 1418  GG---------GCACAGCCTC-ACAGGGGCCGTGGA-GCTTGGCCCCGGGCAAGCAGCCTGTCTGAGAGCAGCG  1480

Query 1604  AGGGGGATGTCACCATGGCCAACACCATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1659
            ||||.||..|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGGAGACTTCACCCTGGCCAATACCATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1536