Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07393
• Subject: XM_005256861.3
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1198
• Gaps: 459

Alignment

Query    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  33

Query  371  GGTGGAGTGAAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGACGATAGAGAAC  444
            ||||||||||||                                                              
Sbjct   34  GGTGGAGTGAAG--------------------------------------------------------------  45

Query  445  GCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCAAAACGTGGATCGTTATGC  518
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct   46  ------------------------------------------------------------GTGGATCGTTATGC  59

Query  519  CTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   60  CTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTCA  133

Query  593  CCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  134  CCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCATC  207

Query  667  CTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  208  CTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGAA  281

Query  741  TGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  282  TGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTGG  355

Query  815  GTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  356  GTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGAG  429

Query  889  AGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  AGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCGC  503

Query  963  CCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  CCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGAC  577

Query 1037  CCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  CCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAAA  651

Query 1111  GCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  GCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGGG  725

Query 1185  CGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  CGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTCA  799

Query 1259  TTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  TTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAAG  873

Query 1333  GCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  874  GCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGAA  947

Query 1407  GAACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTGC  1480
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948  GGACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTGC  1021

Query 1481  AGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACACCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCAA  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  AGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACATCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCAA  1095

Query 1555  CAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096  CAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACAC  1169

Query 1629  CATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1659
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  CATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1200