Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07393
• Subject: XM_011524077.3
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1657
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74

Query   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148

Query  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222

Query  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296

Query  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370

Query  371  GGTGGAGTG-----------------------------------------------------------------  379
            |||||||||                                                                 
Sbjct  371  GGTGGAGTGAAGACCACCAGCAAATACAAGGACAACTAAAACTGTTCTCAGGAAAGATAAGTGGTTACAAGCTC  444

Query  380  ----------AAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGACGATAGAGAA  443
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGCAAAACAAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGACGATAGAGAA  518

Query  444  CGCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCAAAACGTGGATCGTTATG  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCAAAACGTGGATCGTTATG  592

Query  518  CCTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTC  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTC  666

Query  592  ACCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCAT  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCAT  740

Query  666  CCTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGA  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGA  814

Query  740  ATGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTG  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTG  888

Query  814  GGTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGA  962

Query  888  GAGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCG  1036

Query  962  CCCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGA  1110

Query 1036  CCCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAA  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAA  1184

Query 1110  AGCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGG  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGG  1258

Query 1184  GCGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTC  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTC  1332

Query 1258  ATTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAA  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAA  1406

Query 1332  GGCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGA  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGA  1480

Query 1406  AGAACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTG  1479
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTG  1554

Query 1480  CAGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACACCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCA  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACATCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCA  1628

Query 1554  ACAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACA  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACA  1702

Query 1628  CCATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1734