Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07393
• Subject: XM_017025339.1
• Aligned Length: 1677
• Identities: 1657
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74

Query   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148

Query  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222

Query  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296

Query  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370

Query  371  GGTGGAGTGA------------------AGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACT  426
            ||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTGGAGTGAAGAGCTTTGTTTACTTTCAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACT  444

Query  427  TGGCAGACGATAGAGAACGCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGCAGACGATAGAGAACGCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCA  518

Query  501  AAACGTGGATCGTTATGCCTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCT  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACGTGGATCGTTATGCCTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCT  592

Query  575  CCCTCTTCCTGGCTCTCACCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAAC  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTCTTCCTGGCTCTCACCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAAC  666

Query  649  TTGTTTGCTTCTTTCATCCTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGTTTGCTTCTTTCATCCTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAA  740

Query  723  GAGGCCTGACAATGAGAATGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGGCCTGACAATGAGAATGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTC  814

Query  797  TCTTGCATTACTTTGTGGGTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTGCATTACTTTGTGGGTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAG  888

Query  871  CCCACAGTGCTTCCTGAGAGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCACAGTGCTTCCTGAGAGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGT  962

Query  945  TGTACCCTGGGGTTTCGCCCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCT  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTACCCTGGGGTTTCGCCCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCT  1036

Query 1019  GGTGGATCATCCGAGGACCCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTT  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGGATCATCCGAGGACCCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTT  1110

Query 1093  CTCATTTCTAAGCTCAAAGCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGT  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCATTTCTAAGCTCAAAGCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGT  1184

Query 1167  CCTCATTCCTTTATTGGGCGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAA  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTCATTCCTTTATTGGGCGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAA  1258

Query 1241  AACTTATACGACTTTTCATTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTT  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AACTTATACGACTTTTCATTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTT  1332

Query 1315  GCCAATGGAGAGGTGAAGGCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAG  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCAATGGAGAGGTGAAGGCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAG  1406

Query 1389  AGCCTGTGTCCTGGGGAAGAACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTG  1462
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCCTGTGTCCTGGGGAAGGACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTG  1480

Query 1463  AGAAGCTTCGGAAGCTGCAGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACACCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAG  1536
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAGCTTCGGAAGCTGCAGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACATCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAG  1554

Query 1537  CTGGGCGCCCAGCCCCAACAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGA  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGGGCGCCCAGCCCCAACAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGA  1628

Query 1611  TGTCACCATGGCCAACACCATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1659
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTCACCATGGCCAACACCATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1677