Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07393
• Subject: XM_017025340.1
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1447
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCTGGGATCGAGCAGGGCAGGGCCTGGGAGAGGAAGCGCGGGACTCCTGCCTGGCGTCCACGAGCTGCC  74

Query   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGGCATCCCTGCCCCCTGGGGGACCAGTCCTCTCTCCTTCCACAGGAAGTGCTCTCTCTGGGCCCCTGGGA  148

Query  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAAGTTACAGGATCCCTCCTTGAGGAAACGACTCGG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct  149  GGCCCTTCCTCACTCTGGTCCTGCTGGTTTCCATCAAGCAA---------------------------------  189

Query  223  AAGTGGGCTCAGTACAAACAGGCATGTCTGAGAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCATATTTTGTAACGGGAC  296
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  190  -------------------------------------------------------GCATATTTTGTAACGGGAC  208

Query  297  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  209  ATTTGATCAGTACGTGTGTTGGCCTCATTCTTCTCCTGGAAATGTCTCTGTACCCTGCCCTTCATACTTACCTT  282

Query  371  GGTGGAGTGAAGAGAGCTCAGGAAGGGCCTACAGACACTGCTTGGCTCAGGGGACTTGGCAGACGATAGAGAAC  444
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  283  GGTGGAGTGAAG--------------------------------------------------------------  294

Query  445  GCCACGGATATTTGGCAGGATGACTCCGAATGCTCCGAGAACCACAGCTTCAAGCAAAACGTGGATCGTTATGC  518
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  295  ------------------------------------------------------------GTGGATCGTTATGC  308

Query  519  CTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  CTTGCTGTCAACCTTGCAGCTGATGTACACCGTGGGATACTCCTTCTCTCTTATCTCCCTCTTCCTGGCTCTCA  382

Query  593  CCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  CCCTCCTCTTGTTTCTTCGAAAACTCCACTGCACGCGCAACTACATCCACATGAACTTGTTTGCTTCTTTCATC  456

Query  667  CTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457  CTGAGAACCCTGGCTGTACTGGTGAAGGACGTCGTCTTCTACAACTCTTACTCCAAGAGGCCTGACAATGAGAA  530

Query  741  TGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  531  TGGGTGGATGTCCTACCTGTCAGAGATGTCCACCTCCTGCCGCTCAGTCCAGGTTCTCTTGCATTACTTTGTGG  604

Query  815  GTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  GTGCCAATTACTTATGGCTGCTGGTTGAAGGCCTCTACCTCCACACGCTGCTGGAGCCCACAGTGCTTCCTGAG  678

Query  889  AGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  AGGCGGCTGTGGCCCAGATACCTGCTGTTGGGTTGGGCCTTCCCTGTGCTATTTGTTGTACCCTGGGGTTTCGC  752

Query  963  CCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  753  CCGTGCACACCTGGAGAACACAGGGTGCTGGACAACAAATGGGAATAAGAAAATCTGGTGGATCATCCGAGGAC  826

Query 1037  CCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  CCATGATGCTCTGTGTAACAGTCAATTTCTTCATCTTCCTGAAAATTCTCAAGCTTCTCATTTCTAAGCTCAAA  900

Query 1111  GCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  GCTCATCAAATGTGCTTCAGAGATTATAAATACAGATTGGCAAAATCAACACTGGTCCTCATTCCTTTATTGGG  974

Query 1185  CGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  975  CGTTCATGAGATCCTCTTCTCTTTCATCACTGATGATCAAGTTGAAGGATTTGCAAAACTTATACGACTTTTCA  1048

Query 1259  TTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049  TTCAGTTGACACTGAGCTCCTTTCATGGGTTCCTGGTGGCCTTGCAGTATGGTTTTGCCAATGGAGAGGTGAAG  1122

Query 1333  GCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123  GCTGAGCTGCGGAAATACTGGGTCCGCTTCTTGCTAGCCCGCCACTCAGGCTGCAGAGCCTGTGTCCTGGGGAA  1196

Query 1407  GAACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTGC  1480
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197  GGACTTCCGGTTCCTAGGAAAATGTCCCAAGAAGCTCTCGGAAGGAGATGGCGCTGAGAAGCTTCGGAAGCTGC  1270

Query 1481  AGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACACCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCAA  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271  AGCCCTCACTTAACAGTGGGCGGCTCCTACATCTAGCCATGCGAGGTCTTGGGGAGCTGGGCGCCCAGCCCCAA  1344

Query 1555  CAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345  CAGGACCATGCACGCTGGCCCCGGGGCAGCAGCCTGTCCGAGTGCAGTGAGGGGGATGTCACCATGGCCAACAC  1418

Query 1629  CATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1659
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419  CATGGAGGAGATTCTGGAAGAGAGTGAGATC  1449