Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07403
• Subject: XM_006515568.3
• Aligned Length: 1388
• Identities: 1181
• Gaps: 109

Alignment

Query    1  ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT  74
            ||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct    1  ATGCACCTGAGAATCCACCCAAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTCCCTCTT  74

Query   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||      ||||||||.||||||||||.||||
Sbjct   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTGTGGAGTTCTTCTAATGTAG------CCTCCTCCTCCTCTTCCTCTCCGG  142

Query  149  GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC  222
            |.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  143  GATCTCACTCTCAGCAGGAACACCATTTCCACGGCAGCAAGCACCACTCTGTGCCTATTTCTATCTATCGCTCC  216

Query  223  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  217  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGGCACGCTGGTGCAACATACATCTTTGGGAAAAGCGGTGGCCTCATCCTCTATAC  290

Query  297  CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG  370
            |||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  291  CTGGCCAGCAAATGACAGACCCAGCACACGCTCTGACCGTCTCGCCGTGGGCTTCAGCACTACTGTGAAGGATG  364

Query  371  GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT  444
            |.|||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  365  GTATCTTAGTACGCATTGACAGCGCCCCTGGACTTGGCGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAAGGGAAAATT  438

Query  445  GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA  518
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  439  GGAGTTGTCTTCAATATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAAGAGAGAACTCCTGTCAATGATGGCAAATA  512

Query  519  CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT  592
            |||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  513  CCACGTTGTGCGCTTCACCAGGAATGGGGGAAATGCTACACTTCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAGCACT  586

Query  593  ATCCTAC-------------------------------------------------------------------  599
            |||||||                                                                   
Sbjct  587  ATCCTACAGGCAACACTGATAATGAACGCCTCCAAATGGTAAAACAGAAAATCCCCTTCAAATATAACCGGCCC  660

Query  600  -----------------------AGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGG  650
                                   ||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  661  GTAGAGGAGTGGCTGCAGGAAAAAGGCCGGCAGCTAACCATCTTCAACACCCAGGCGCAAATAGCCATCGGAGG  734

Query  651  AAAGGACAAAGGACGCCTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGG  724
            |||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  AAAGGACAAAGGACGTCTCTTCCAAGGTCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGG  808

Query  725  CGGCTGAGAACAACCCCAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGA  798
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|..|||
Sbjct  809  CAGCTGAGAACAACCCTAATATTAAAATCAATGGAAGTGTCCGGCTAGTGGGAGAAGTCCCATCAGTCTCAGGA  882

Query  799  ACAACACAGACGACCTCCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTAC  872
            |||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct  883  ACAACACAGACAACGTCCATGCCACCTGAAATGTCTACCACCGTCATGGAAACCACCACCACCATGGCTACGAC  956

Query  873  CACAACCCGTAAGAATCGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTT  946
            |||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CACCACCCGAAAGAACCGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCCACGTCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTT  1030

Query  947  CAAGTGATGATGAAGACTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCGGGAATC  1020
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||         |||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1031  CAAGTGATGATGAAGACTTTGTCGAATGTGAACCAAGTA---------CAGCAAACCCCACGGAGCCAGGAATC  1095

Query 1021  AGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGC  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096  AGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCCAGCAGTACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGC  1169

Query 1095  TGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATC  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  TGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATC  1243

Query 1169  AAGTGGACGAGACGCGGAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCAGCAG  1242
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
Sbjct 1244  AAGTGGACGAGACGAGGAACTACATCAGCAACTCGGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCA--AG  1315

Query 1243  --AGCTCGAAGAGCGGCCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGCATTACGTG  1296
              |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||
Sbjct 1316  CCAGCTCCAAGAGCGGCCATAAGAAACAGAAAAACAAGGACAAGGAGTATTATGTG  1371