Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07403
• Subject: XM_006515569.3
• Aligned Length: 1298
• Identities: 1190
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT  74
            ||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct    1  ATGCACCTGAGAATCCACCCAAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTCCCTCTT  74

Query   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||      ||||||||.||||||||||.||||
Sbjct   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTGTGGAGTTCTTCTAATGTAG------CCTCCTCCTCCTCTTCCTCTCCGG  142

Query  149  GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC  222
            |.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  143  GATCTCACTCTCAGCAGGAACACCATTTCCACGGCAGCAAGCACCACTCTGTGCCTATTTCTATCTATCGCTCC  216

Query  223  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  217  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGGCACGCTGGTGCAACATACATCTTTGGGAAAAGCGGTGGCCTCATCCTCTATAC  290

Query  297  CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG  370
            |||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  291  CTGGCCAGCAAATGACAGACCCAGCACACGCTCTGACCGTCTCGCCGTGGGCTTCAGCACTACTGTGAAGGATG  364

Query  371  GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT  444
            |.|||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  365  GTATCTTAGTACGCATTGACAGCGCCCCTGGACTTGGCGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAAGGGAAAATT  438

Query  445  GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA  518
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  439  GGAGTTGTCTTCAATATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAAGAGAGAACTCCTGTCAATGATGGCAAATA  512

Query  519  CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT  592
            |||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  513  CCACGTTGTGCGCTTCACCAGGAATGGGGGAAATGCTACACTTCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAGCACT  586

Query  593  ATCCTACAGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGGAAAGGACAAAGGACGC  666
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  587  ATCCTACAGGCCGGCAGCTAACCATCTTCAACACCCAGGCGCAAATAGCCATCGGAGGAAAGGACAAAGGACGT  660

Query  667  CTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGGCGGCTGAGAACAACCC  740
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  661  CTCTTCCAAGGTCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGGCAGCTGAGAACAACCC  734

Query  741  CAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGAACAACACAGACGACCT  814
            .|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|..||||||||||||||.||.|
Sbjct  735  TAATATTAAAATCAATGGAAGTGTCCGGCTAGTGGGAGAAGTCCCATCAGTCTCAGGAACAACACAGACAACGT  808

Query  815  CCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTACCACAACCCGTAAGAAT  888
            ||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  809  CCATGCCACCTGAAATGTCTACCACCGTCATGGAAACCACCACCACCATGGCTACGACCACCACCCGAAAGAAC  882

Query  889  CGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTTCAAGTGATGATGAAGA  962
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCCACGTCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTTCAAGTGATGATGAAGA  956

Query  963  CTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCGGGAATCAGACGGGTTCCGGGGG  1036
            ||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CTTTGTCGAATGTGAACCAAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCAGGAATCAGACGGGTTCCGGGGG  1030

Query 1037  CCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGCTGCTGCCGCCCTCTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  CCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCCAGCAGTACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGCTGCTGCCGCCCTCTGC  1104

Query 1111  ATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATCAAGTGGACGAGACGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1105  ATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATCAAGTGGACGAGACGAG  1178

Query 1185  GAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCAGCAG--AGCTCGAAGAGCGG  1256
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||.||||||||
Sbjct 1179  GAACTACATCAGCAACTCGGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCA--AGCCAGCTCCAAGAGCGG  1250

Query 1257  CCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGCATTACGTG  1296
            |||.||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||
Sbjct 1251  CCATAAGAAACAGAAAAACAAGGACAAGGAGTATTATGTG  1290