Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07408
- Subject:
- XM_006496302.3
- Aligned Length:
- 2585
- Identities:
- 2224
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTT-GTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGCTGCTGATGGGCGACAAGGAGCGCG 73
|||||||.||||||.|||||.|| ||| ||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||..||.|.|.
Sbjct 1 ATGATGAACATCAAGGCCTTCAC-CTTGGTCTCTGCAGTGGAACGGGAACTGCTGATGGGCGACAGAGACCACA 73
Query 74 TCAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCGGCAGGGACCTCTACGTGGGCACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTC 147
|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||.|.||.||.||.||||||||.|||||||||.|.|||||.|||
Sbjct 74 TCAGCATTGAGTGTGTGGAGTGCTGTGGCAGGAATCTTTATGTCGGCACCAATGACTGCTTCATTTACCATTTC 147
Query 148 CTGTTGGAGGAG-AGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCACCAAACAGCTGCAGAGACACTTGG 220
|||.|||||||| |||||| |||||.|.|||.||||.||.|||..|||||||||||||||.||.||||||.|||
Sbjct 148 CTGCTGGAGGAGAAGGCCA-TGCCTACAGGGACAGCTACATTCGTTGCCACCAAACAGCTACACAGACACCTGG 220
Query 221 GCTTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGCGCGGCCTCAGCACTCAACAGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCC 294
||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 221 GCTTCAAGAAACCTGTGAACGAGCTGTGTGCGGCCTCAGCTCTCAATAGGCTGCTGGTGCTCTGTGACAACTCT 294
Query 295 ATCAGCCTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCGCATCAAGGGGGCAGCCACGTTTGC 368
||.|.||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||..|.||.|||||
Sbjct 295 ATAACCCTGGTTAACATGCTGAACCTGGAGCCAGTCCCCTCAGGAGCCCGCATCAAAGGGGCTACAACATTTGC 368
Query 369 ACTGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCTTCTGTGTAGAAGTTTGCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCA 442
|.|||||||||.|||.||||.|||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||..
Sbjct 369 AGTGAACGAGAGCCCCGTGAATGGGGACCCGTTCTGCGTGGAGGTGTGCATCATTTCCGTGAAGCGCAGGACTG 442
Query 443 TCCAGATGTTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTGTCGACTGCCGAACAGCCCCTCGCT 516
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||..|.||.|||||.||.|||
Sbjct 443 TCCAAATGTTTCTGGTGTATGAGGACCGAGTGCAGATTGTCAAGGAAGTGTCCACCCCAGAGCAGCCTCTTGCT 516
Query 517 GTGGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTCTGACCACTCAGTACATCATCCACAATTACAGCACAGGCGT 590
|||||||||||.|||.|.|||.||||.|||||..|||||||.||.||||||||||..||.||||||||||||.|
Sbjct 517 GTGGCTGTGGATGGCTATTTCTTGTGCCTGGCCTTGACCACACAATACATCATCCTGAACTACAGCACAGGCCT 590
Query 591 CTCCCAGGACCTTTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCAAGAGGATAGGGAGACAGGAGTTCC 664
.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 591 TTCCCAGGACCTGTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAAGCCACCCATCGTCAAGAGGATAGGCAGACAGGAGTTCC 664
Query 665 TGCTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGCATGTTTGCCACAGTCGCAGGGATATCCCAGCGTGCCCCCGTGCACTGG 738
|||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 665 TGCTGGCTGGCCCAGGAGGCTTGGGCATGTTTGCCACCGTGGCCGGGATTTCCCAGCGTGCCCCTGTGCACTGG 738
Query 739 TCGGAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCTCGATGACGAATTCATCACAGTCCA 812
||.||.||||||||||||||.|||||.|.|||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 739 TCAGAAAATGTGATTGGGGCAGCTGTTTGCTTCCCCTATGTCATAGCGCTCGATGACGAATTCATCACAGTTCA 812
Query 813 CAGCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGACGCTGCCCTTTAAGGAGGGCCATATCCTACAGGACTTTGAAGGAA 886
||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 813 CAGCATGTTGGATCAGCAGCAGAAACAGACCCTGCCCTTTAAGGAGGGGCACATCCTGCAGGACTTTGAAGGAA 886
Query 887 GAGTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTT 960
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 887 GAGTGATTGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCTCTGGAAAAACAAATACAGGATCTG 960
Query 961 CTAGCAAGCCGCAGAGTAGAAGAGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAATT 1034
.||||||.|||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 961 TTAGCAAACCGGAGAGTGGAGGAGGCTTTGGTCTTGGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAGAAATT 1034
Query 1035 TCAGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATTTATACAGTTTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTA 1108
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1035 TCAGGTAATGTACAGGAGGATTCTGCAGCAGGCAGGCTTTATACAGTTTGCACAACTCCAGTTCCTGGAAGCCA 1108
Query 1109 AAGAGCTCTTCAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCCTTCCTGTTGCCCACCTCC 1182
|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1109 AAGAGCTCTTCAGAAGCAGCCAGCTGGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCCTTTCTGCTGCCCACCTCC 1182
Query 1183 TCCTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGA 1256
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1183 TCCTCCTTCACCCGCTCTCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAAGGTGACCAGGA 1256
Query 1257 GAAGATGGCCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCCGCAGCACAGAGGTAGCAAATGGCT 1330
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1257 GAAGATGGCCAAGTGCAAGCGCTTCCTCATGAGCTACCTGAATGAAATCCGCAGCACAGAGGTAGCTAATGGCT 1330
Query 1331 ACAAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACTGTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTG 1404
|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct 1331 ACAAGGAAGACATCGACACGGCCTTGCTCAAGCTGTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTCCTGGACCTCTTG 1404
Query 1405 GTCACTGAGAACTTCTGTCTT-CTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGAAGCACAAAAAGTATTTTGCACTTG 1477
|||||||||||.||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1405 GTCACTGAGAATTTCTG-CTTGCTGACAGACAGTGCTGCCTGGCTGGAGAAGCACAAAAAGTACTTTGCACTGG 1477
Query 1478 GACTGCTCTATCATTATAATAACCAAGATGCTGCTGCAGTTCAGTTGTGGGTGAACATTGTGAATGGCGATGTC 1551
|.||||||||||||||.||.||.||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..||
Sbjct 1478 GGCTGCTCTATCATTACAACAAACAAGATGCCTCTGCGGTTCAGTTGTGGGTGAACATTGTGAATGGGGACATC 1551
Query 1552 CAGGACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTTCTTACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGT 1625
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||.|.||.||.||
Sbjct 1552 CAGGACTCTACACGCTCGGACCTGTATGAATACATCGTTGATTTCCTTACCTACTGCCTAGACCAAGAGCTGGT 1625
Query 1626 GTGGGCCTATGCTGATTGGGTCCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTCGGAGTTCAGGTTTTCACCAAGAGACCTTTGG 1699
||||.||.|||||||.|||.|.||||||||||||||.|||.|.||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GTGGACCCATGCTGACTGGCTGCTGCAGAAAAGTGAGGAGATTGGAGTTCAAATTTTCACCAAGAGACCTTTGG 1699
Query 1700 ATGAACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATTATCAATTGCCTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTG 1773
|.||.||||||.|||..|||||||||||||||.|||||||.|.||.||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1700 ACGAGCAGCAGCAGACTAGTTTTAATCCAGACAACATTATTAGTTCCCTTAAGAAATACCCTAAAGCCCTGGTT 1773
Query 1774 AAGTATCTGGAACATCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGAAAGAAGAGTATCACACCCACTTAGCTGTGCTGTA 1847
|||||||||||||||||.|||||.||||.||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||..|.||.||
Sbjct 1774 AAGTATCTGGAACATCTCGTGATCGACAGGAGATTGCAGAAAGAAGAGTACCACACCCACCTTGCCATCCTCTA 1847
Query 1848 CCTGGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCCGCCAGTGGCAAGGGTGCAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGC 1921
||||||.||.|||||||.||||||||..|||.|..|.|||||.|.||.|||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1848 CCTGGAGGAAGTGCTGCGGCAGAGGGTATCCACTGGGGGCAAAGATGTAGAAGCCACTGAGACACAGGCCAAAC 1921
Query 1922 TGCGGCGGCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTCGAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTG 1995
|.|||.|.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||..|....||||...|.|||||.||.||||||
Sbjct 1922 TCCGGAGACTACTCCAGAAGTCTGACTTGTACCGCGTCCACTTGTTGAAAGAGAAAGTCCAGGGTGCCGGCCTG 1995
Query 1996 CCCATGGAGAGCGCCATCCTGCACGGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCT 2069
||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1996 CCCATGGAAAGTGCCATCCTCCACGGGAAGCTGGGCGAGCACGAGAAGGCCCTGCACATCCTGGTGCACGAGAT 2069
Query 2070 GCAGGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCCGAGACCCACCCCACCGCCAGCAAC 2143
|..||||||..|.||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.|..|...||.||..|||.||||..|
Sbjct 2070 GGGGGACTTCTCTGCAGCTGAGGACTACTGCCTGTGGAGCTCCGAGGGTCAGGGTGCAGCCTGCCGTCAGCGCC 2143
Query 2144 TCTTTCACACGCTGCTGGCCATCTACCTGCATGCTGGCCCCACTGCCCACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGAC 2217
||||.||||||.||||.|||||.|||||.|.|||.||||||.|||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||
Sbjct 2144 TCTTCCACACGTTGCTCGCCATGTACCTCCGTGCAGGCCCCTCTGCCCAGGATCTGACAGTGGCCGCTGTGGAC 2217
Query 2218 CTGCTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATG-CAGCCCAGGTGCTGCAGATGCTGCCTGACACCTGGTCAGTGC 2290
.|||||||||..||.||||..|||||||||| || |||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2218 TTGCTGAACCATCATGCCAGGGAATTTGATGTCA-CCCAGGTCCTACAGCTGCTGCCAGACACCTGGTCCGTGC 2290
Query 2291 AGCTCCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCCATGAGGGACAGCATCCATGCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTC 2364
||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||.||.
Sbjct 2291 AGCTTCTCTGCCCATTCCTCATGGGGGCTATGAGGGACAGTATCCATGCCAGGAGGACCACACAGGTGGCCCTT 2364
Query 2365 GGCCTGGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAGATGAAGTTGAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTC 2438
||||||||||..||.||||||.|.||.||||..||.||||||||||||.||||.||.|...||.|||..|||||
Sbjct 2365 GGCCTGGCCAAATCAGAAAACCTGATTTACATGTATGATAAGATGAAGCTGAAGGGCAATGCAGTCCGGCTCTC 2438
Query 2439 AGACAAAAAGCTTTGTCAGATATGCCAAAATCCCTTT-TGTGAGCCTGTGTTTGTTAGATACCCAAATGGTGGT 2511
|||...|.|||||||.|||.|.|||||.|| |||||| .||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 2439 AGAACGAGAGCTTTGCCAGCTCTGCCAGAA-CCCTTTCGGTGAACCTGTGTTTGTCAGATACCCAAATGGAGGG 2511
Query 2512 CTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTCATCCAGTCCTGGCACTCGGACT 2580
|||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct 2512 CTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACGGCCCCCAGCTCGCCCAGCCCTGGCACTCGGACT 2580