Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07412
Subject:
XM_017319646.1
Aligned Length:
960
Identities:
883
Gaps:
0

Alignment

Query   1  ATGTCGACCAAGAATTTCCGAGTCAGTGACGGGGACTGGATTTGCCCTGACAAAAAATGTGGAAATGTAAACTT  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCGACCAAGAATTTCCGAGTCAGTGACGGGGACTGGATCTGCCCTGACAAGAAGTGTGGAAATGTAAACTT  74

Query  75  TGCTAGAAGAACCAGCTGTAATCGATGTGGTCGGGAGAAAACAACTGAGGCCAAGATGATGAAAGCTGGGGGCA  148
           ||||||.||||||||||||||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  75  TGCTAGGAGAACCAGCTGTAACAGATGTGGTCGAGAAAAGACAACTGAGGCCAAGATGATGAAAGCTGGGGGAA  148

Query 149  CTGAAATAGGAAAGACACTTGCAGAAAAGAGCCGAGGCCTATTTAGTGCTAATGACTGGCAATGTAAAACTTGC  222
           |.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 149  CAGAAATAGGAAAGACACTGGCAGAGAAGAGCCGGGGCTTATTTAGTGCCAATGATTGGCAATGCAAAACTTGC  222

Query 223  AGCAATGTGAATTGGGCCAGAAGATCAGAGTGTAATATGTGTAATACTCCAAAGTATGCTAAATTAGAAGAAAG  296
           ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AGTAATGTGAATTGGGCTAGAAGATCAGAGTGTAACATGTGTAATACTCCAAAGTATGCTAAATTAGAAGAAAG  296

Query 297  AACAGGATATGGTGGTGGTTTTAATGAAAGAGAAAATGTTGAATATATAGAAAGAGAAGAATCTGATGGTGAAT  370
           ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297  AACAGGATATGGAGGTGGTTTTAATGAAAGAGAGAATGTTGAATACATAGAAAGAGAAGAATCTGATGGGGAAT  370

Query 371  ATGATGAGTTTGGACGTAAAAAGAAAAAATACAGAGGGAAAGCAGTTGGTCCTGCATCTATATTAAAGGAAGTT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATGATGAGTTTGGACGTAAAAAGAAAAAATACAGGGGGAAAGCAGTTGGCCCTGCATCTATATTAAAGGAAGTT  444

Query 445  GAAGATAAAGAATCAGAGGGAGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGATCTTTCTAAATATAAGTTAGATGAGGATGA  518
           |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||.||
Sbjct 445  GAAGATAAAGAGTCAGAGGGAGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGATCTATCTAAGTATAAGCTAGATGAGGACGA  518

Query 519  GGATGAAGATGACGCTGATCTCTCAAAATATAATCTTGATGCCAGTGAAGAAGAAGATAGTAATAAAAAGAAAT  592
           ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 519  GGATGAAGATGATGCTGATCTCTCAAAATATAATCTTGATGCCAGCGAAGAAGAAGATAGTAACAAAAAGAAAA  592

Query 593  CTAATAGACGAAGTCGCTCAAAGTCTGGATCTTCACATTCACGATCTTCATCACGCTCATCCTCCCCCTCAAGT  666
           ..|||||.||.||.|||||||||||..||||.||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GCAATAGGCGGAGCCGCTCAAAGTCACGATCGTCTCACTCAAGGTCTTCATCACGCTCATCCTCCCCCTCAAGT  666

Query 667  TCAAGGTCTAGGTCCAGGTCCCGTTCAAGAAGTTCTTCCAGTTCGCAGTCAAGATCTCGTTCCAGTTCCAGAGA  740
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||..|||.||||||||||
Sbjct 667  TCAAGGTCCAGGTCCAGGTCCCGTTCAAGAAGCTCTTCCAGTTCGCAGTCCAGGTCTCACTCCGGTTCCAGAGA  740

Query 741  ACGTTCGAGATCTCGTGGGTCGAAATCAAGATCCAGCTCCAGGTCCCACAGGGGCTCTTCTTCCCCACGAAAAA  814
           ||.|||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 741  ACATTCCAGATCCCGTGGTTCGAAATCAAGATCCAGCTCCAGGTCCCACAGGGGCTCTTCTTCCCCAAGAAAAA  814

Query 815  GATCTTATTCAAGTTCATCATCTTCTCCTGAGAGGAACAGAAAGAGAAGTCGTTCTAGATCTTCTTCATCTGGT  888
           ||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||..||||.|||||.|||||.||||||.||||||||.|.|.|
Sbjct 815  GATCTTATTCGAGTTCTTCGTCATCTCCTGAAAGAGACAGGAAGAGGAGTCGCTCTAGACCTTCTTCACCAGCT  888

Query 889  GATCGCAAAAAAAGACGAACAAGATCACGGTCACCCGAAAGCCAGGTGATTGGTGAAAACACTAAACAACCC  960
           |.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 889  GTTCGCAAAAAAAGACGAACGAGATCACGGTCACCCGAAAGCCAGGTGATTGGTGAAAACATTAAACAACCC  960