Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07414
- Subject:
- XM_011527522.2
- Aligned Length:
- 1881
- Identities:
- 1783
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA 74
Query 75 GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC 148
Query 149 TGGTGTCTCTGGGGTGTCCTGTTCCCAAAGCTGAGCTGATCTGCCACCTAGAGCATGGGCAGGAGCCATGGACC 222
|||||||||||
Sbjct 149 TGGTGTCTCTG--------------------------------------------------------------- 159
Query 223 AGGAAGGAAGACCTCTCCCAAGACACCTGTCCAGGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 160 ---------------------------------GGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG 200
Query 297 TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG 274
Query 371 GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCCAGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCCAGGAG 348
Query 445 AAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGGACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 AAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGGACA 422
Query 519 GGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATACAGTCCATAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTCAGG 592
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 GGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATAGAGTCCGTAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTCAGG 496
Query 593 AAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACATGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 AAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACATGAG 570
Query 667 AAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCTCCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 AAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCTCCT 644
Query 741 GCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCAAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 GCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCAAGT 718
Query 815 CATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCCTTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 CATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCCTTC 792
Query 889 ACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATGTGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 ACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATGTGG 866
Query 963 CCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTCTCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAGTGCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 CCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTCTCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAGTGCT 940
Query 1037 TGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAAGCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 TGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAAGCCC 1014
Query 1111 TATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACACTGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 TATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACACTGG 1088
Query 1185 AGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAGCGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 AGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAGCGGA 1162
Query 1259 TTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTATCTTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 TTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTATCTTG 1236
Query 1333 CATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGAAGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 CATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGAAGGA 1310
Query 1407 CCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTCACCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTCACCC 1384
Query 1481 GCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGGGAAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 GCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGGGAAA 1458
Query 1555 TCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTAGTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459 TCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTAGTGA 1532
Query 1629 ATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCCATCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533 ATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCCATCA 1606
Query 1703 GTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGGGAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607 GTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGGGAAG 1680
Query 1777 GACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAACCATA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAACCATA 1754
Query 1851 CCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG 1881
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 CCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG 1785