Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07415
- Subject:
- NM_001277925.1
- Aligned Length:
- 2328
- Identities:
- 2063
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGGAGCCCCCGTATTCGCTGACGGCGCACTACGATGAGTTCCAAGAGGTCAAGTACGTGAGCCGCTGCGGCGC 74
||||||.||||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||.|
Sbjct 1 ATGGAGGCCCCGTATTCCATGACAGCGCACTACGACGAGTTCCAGGAAGTCAAGTATGTGAGCCGGTGTGGCAC 74
Query 75 GGGGGGCGCGCGCGGGGCCTCCCTGCCCCCGGGCTTCCCGTTGGGCGCTGCGCGCAGCGCCACCGGGGCCCGGT 148
.||||||||.||.|||.||||.|||||.||.|||||||||..||||.|.|.||||||.||.|.||||.||.|||
Sbjct 75 CGGGGGCGCTCGAGGGACCTCACTGCCTCCAGGCTTCCCGAGGGGCTCAGGGCGCAGTGCTAGCGGGTCCAGGT 148
Query 149 CCGGGCTGCCGCGCTGGAACCGGCGCGAGGTGTGCCTGCTGTCGGGGCTGGTGTTCGCCGCCGGCCTCTGCGCC 222
|.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 149 CTGGGCTGCCCCGCTGGAATCGACGCGAGGTGTGCCTGCTGTCGGGGTTGGTGTTTGCTGCCGGCCTCTGCGCC 222
Query 223 ATTCTGGCGGCTATGCTGGCCCTCAAGTACCTGGGCCCGGTCGCGGC---CGGCGGCGGCGCCTGTCCCGAGGG 293
||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||..||||| |||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 223 ATCCTGGCGGCCATGCTGGCGCTCAAATACCTGGGCCCGGGAGCGGCGGGCGGTGGCGGAGCCTGTCCCGAGGG 296
Query 294 CTGCCCTGAGCGCAAGGCCTTCGCGCGCGCCGCTCGCTTCCTGGCCGCCAACCTGGACGCCAGCATCGACCCAT 367
||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CTGCCCCGAGCGCAAGGCCTTTGCACGCGCCGCCCGCTTTCTGTCTGCCAACCTGGACGCCAGCATCGACCCGT 370
Query 368 GCCAGGACTTCTACTCGTTCGCCTGCGGCGGTTGGCTGCGGCGCCACGCCATCCCCGACGACAAGCTCACCTAT 441
||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 GCCAGGACTTCTACTCGTTCGCGTGCGGAGGCTGGCTGCGGCGCCACGCTATCCCCGACGACAAGCTCACCTAC 444
Query 442 GGCACCATCGCGGCCATCGGCGAGCAAAACGAGGAGCGCCTACGGCGCCTGCTGGCGCGGCCCGGGGGTGGGCC 515
|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||...||.||.||
Sbjct 445 GGCACGATCGCGGCCATCGGAGAGCAGAACGAGGAGCGTCTGCGGCGCCTGCTGGCGAGACCCACCGGAGGCCC 518
Query 516 TGGCGGCGCGGCCCAGCGCAAGGTGCGCGCCTTCTTCCGCTCGTGCCTCGACATGCGCGAGATCGAGCGACTGG 589
.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|
Sbjct 519 CGGCGGCGCTGCGCAGCGCAAGGTGCGCGCCTTCTTCCGCTCGTGCCTCGACATGCGCGAGATCGAGAGGCTCG 592
Query 590 GCCCGCGACCCATGCTAGAGGTCATCGAGGACTGCGGGGGCTGGGACCTGGGCGGCGCGGAGGAGCGTCCGGGG 663
|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||.||.||.|||
Sbjct 593 GGCCGCGGCCCATGCTCGAGGTCATCGAGGACTGCGGCGGCTGGGACCTGGGCGGCGCGGCCGATCGCCCCGGG 666
Query 664 GTCGCGGCGCGATGGGACCTCAACCGGCTGCTGTACAAGGCGCAGGGCGTGTACAGCGCCGCCGCGCTCTTCTC 737
|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 ---GCGGCTCGCTGGGACCTCAACCGACTGCTGTACAAGGCACAGGGTGTGTACAGCGCGGCCGCGCTCTTCTC 737
Query 738 GCTCACGGTCAGCCTGGACGACAGGAACTCCTCGCGCTACGTCATCCGCATTGACCAGGATGGGCTCACCCTGC 811
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 GCTTACAGTCAGCCTGGACGACAGGAACTCCTCGCGCTACGTCATCCGCATTGACCAGGATGGGCTCACCCTGC 811
Query 812 CAGAGAGGACCCTGTACCTCGCTCAGGATGAGGACAGTGAGAAGATCCTGGCAGCATACAGGGTGTTCATGGAG 885
|||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 812 CAGAGAGAACCCTGTACCTAGCTCAAGACGAGGAGAGTGAGAAGATCTTGGCTGCATACAGGGTGTTCATGCAG 885
Query 886 CGAGTGCTCAGCCTCCTGGGTGCAGACGCTGTGGAACAGAAGGCCCAAGAGATCCTGCAAGTGGAGCAGCAGCT 959
||..|.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||..||||.|||..|||
Sbjct 886 CGTCTACTCAGACTACTGGGAGCGGACGCTGTGGAGCAGAAGGCGCAGGAAATCCTTCAGCTGGAACAGAGGCT 959
Query 960 GGCCAACATCACTGTGTCAGAGTATGACGACCTACGGCGAGATGTCAGCTCCATGTACAACAAGGTGACGCTGG 1033
||||||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||||||..|||||||||.|||||.||||
Sbjct 960 GGCCAATATCTCTGTGTCAGAATATGATGATCTCCGTCGTGATGTCAGCTCCGCGTACAACAAAGTGACTCTGG 1033
Query 1034 GGCAGCTGCAGAAGATCACCCCCCACTTGCGGTGGAAGTGGCTGCTAGACCAGATCTTCCAGGAGGACTTCTCA 1107
||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1034 GGCAGCTGCAGAAGATCATCCCCCATTTGCAGTGGAAGTGGCTGCTGGATCAGATCTTCCAGGAAGACTTCTCG 1107
Query 1108 GAGGAAGAGGAGGTGGTGCTGCTGGCGACAGACTACATGCAGCAGGTGTCGCAGCTCATCCGCTCCACACCCCA 1181
|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1108 GAGGAGGAGGAGGTGGTGCTGCTGGCCACAGACTACATGCAGCAGGTGTCCCAGCTCATCCGCTCCACACCTCG 1181
Query 1182 CCGGGTCCTGCACAACTACCTGGTGTGGCGCGTGGTGGTGGTCCTGAGTGAACACCTGTCCCCGCCATTCCGTG 1255
..||.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.|
Sbjct 1182 AAGGATCCTGCACAACTACCTAGTGTGGCGTGTGGTGGTGGTTCTGAGTGAGCACCTGTCCTCACCATTCCGAG 1255
Query 1256 AGGCACTGCACGAGCTGGCACAGGAGATGGAGGGCAGCGACAAGCCACAGGAGCTGGCCCGGGTCTGCTTGGGC 1329
||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||..||||||||.||||||.|||||||.||||||.|||||
Sbjct 1256 AGGCACTGCATGAGCTGGCCAAAGAGATGGAGGGCAATGACAAGCCCCAGGAGTTGGCCCGAGTCTGCCTGGGC 1329
Query 1330 CAGGCCAATCGCCACTTTGGCATGGCGCTTGGCGCCCTCTTTGTACATGAGCACTTCTCAGCTGCCAGCAAAGC 1403
||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1330 CAGGCCAACCGCCACTTCGGCATGGCTCTTGGTGCCCTCTTTGTACATGAACACTTCTCAGCTGCCAGTAAAGC 1403
Query 1404 CAAGGTGCAGCAGCTAGTGGAAGACATCAAGTACATCCTGGGCCAGCGCCTGGAGGAGCTGGACTGGATGGACG 1477
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1404 CAAGGTGCAGCAGCTAGTGGAAGATATCAAGTACATCTTGGGCCAGCGCCTGGAGGAGCTGGACTGGATGGATG 1477
Query 1478 CCGAGACCAGGGCTGCTGCTCGGGCCAAGCTCCAGTACATGATGGTGATGGTCGGCTACCCGGACTTCCTGCTG 1551
||.||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1478 CCCAGACCAAGGCAGCTGCTCGGGCCAAGCTCCAGTACATGATGGTCATGGTTGGCTATCCAGACTTCCTGCTG 1551
Query 1552 AAACCCGATGCTGTGGACAAGGAGTATGAGTTTGAGGTCCATGAGAAGACCTACTTCAAGAACATCTTGAACAG 1625
|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1552 AAACCTGAGGCTGTAGACAAAGAATATGAGTTCGAGGTCCACGAGAAGACCTACTTCAAGAACATTTTGAACAG 1625
Query 1626 CATCCGCTTCAGCATCCAGCTCTCAGTTAAGAAGATTCGGCAGGAGGTGGACAAGTCCACGTGGCTGCTCCCCC 1699
||||||.|||||.||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.|
Sbjct 1626 CATCCGATTCAGTATCCAGTTGTCCGTCAAAAAGATTCGACAGGAGGTGGACAAATCCTCGTGGCTCCTCCCAC 1699
Query 1700 CACAGGCGCTCAATGCCTACTATCTACCCAACAAGAACCAGATGGTGTTCCCCGCGGGCATCCTGCAGCCCACC 1773
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CACAGGCGCTCAATGCCTACTATCTGCCCAACAAGAATCAAATGGTCTTCCCAGCTGGCATCCTGCAGCCCACC 1773
Query 1774 CTGTACGACCCTGACTTCCCACAGTCTCTCAACTACGGGGGCATCGGCACCATCATTGGACATGAGCTGACCCA 1847
|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1774 CTGTATGACCCAGACTTCCCACAGTCTCTGAACTACGGGGGTATTGGCACCATCATTGGGCACGAACTGACCCA 1847
Query 1848 CGGCTACGACGACTGGGGGGGCCAGTATGACCGCTCAGGGAACCTGCTGCACTGGTGGACGGAGGCCTCCTACA 1921
.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1848 TGGCTATGACGACTGGGGGGGACAGTATGACCGCTCAGGAAACCTGTTGCACTGGTGGACTGAGACCTCCTACA 1921
Query 1922 GCCGCTTCCTGCGAAAGGCTGAGTGCATCGTCCGTCTCTATGACAACTTCACTGTCTACAACCAGCGGGTGAAC 1995
|||.|||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1922 GCCACTTTCTGCGCAAGGCCGAGTGCATCGTTCGCCTCTATGACAACTTCACCGTCTACAACCAGCGCGTGAAT 1995
Query 1996 GGGAAACACACGCTTGGGGAGAACATCGCAGATATGGGCGGCCTCAAGCTGGCCTACCACGCCTATCAGAAGTG 2069
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1996 GGGAAACACACACTTGGCGAGAACATCGCAGACATGGGAGGCCTCAAGCTGGCCTACTATGCCTATCAGAAGTG 2069
Query 2070 GGTGCGGGAGCACGGCCCAGAGCACCCACTTCCCCGGCTCAAGTACACACATGACCAGCTCTTCTTCATTGCCT 2143
|||.||||||||.|||||.||||||||.||.|.||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||
Sbjct 2070 GGTCCGGGAGCATGGCCCGGAGCACCCGCTGCACCGGCTCAAGTACACACACAACCAGCTTTTCTTCATTGCCT 2143
Query 2144 TTGCCCAGAACTGGTGCATCAAGCGGCGGTCGCAGTCCATCTACCTGCAGGTGCTGACTGACAAGCATGCCCCT 2217
||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 2144 TTGCACAGAACTGGTGCATCAAGCGACGGTCACAGTCCATCTACCTGCAGGTGCTGACAGACAAGCATGCACCT 2217
Query 2218 GAGCACTACAGGGTGCTGGGCAGTGTGTCCCAGTTTGAGGAGTTTGGCCGGGCTTTCCACTGTCCCAAGGACTC 2291
|||||||||.||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 GAGCACTACCGGGTCCTGGGCAGCGTATCCCAGTTTGAGGAATTCGGCCGGGCCTTCCACTGTCCCAAGGACTC 2291
Query 2292 ACCCATGAACCCTGCCCACAAGTGTTCCGTGTGG 2325
.|||||||||||.|.|||.|||||.||.||||||
Sbjct 2292 TCCCATGAACCCCGTCCATAAGTGCTCTGTGTGG 2325