Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07427
• Subject: XM_011522236.3
• Aligned Length: 1662
• Identities: 1553
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCACTTTGCATGGTCTCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCACTTTGCATGGTCTCCA  74

Query   75  GAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAACACCCAGGAGAAGAGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAACACCCAGGAGAAGAGCG  148

Query  149  CCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCTTAGCTTTACGAATATTAAAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCATAGCTTTACGAATATTAAAC  222

Query  223  TGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTTCACATCACATGGTTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTTCACATCACATGGTTTT  296

Query  297  CAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCCTTAATCTTTGCAAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCCTTAATCTTTGCAAGCA  370

Query  371  TTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGCTGATTTGGATTCCTAGACTTGCCCAAGCA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct  371  TTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGC-----------------------------  415

Query  445  CTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATCAGGAAGTGGCAAGATG  518
                                                                                      
Sbjct  416  --------------------------------------------------------------------------  415

Query  519  GGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA  592
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  --TGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA  487

Query  593  CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA  561

Query  667  TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT  635

Query  741  CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT  709

Query  815  CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTTGAAATTTAACGTGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTTGAAATTTAACGTGCTG  783

Query  889  CAGAACTTGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG  962
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  CAGAACTGGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG  857

Query  963  TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC  931

Query 1037  TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT  1005

Query 1111  ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC  1079

Query 1185  AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA  1153

Query 1259  AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT  1227

Query 1333  TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA  1301

Query 1407  TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTCACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTTACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT  1375

Query 1481  TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGTGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGCGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA  1449

Query 1555  AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA  1523

Query 1629  GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC  1662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC  1557