Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07427
• Subject: XM_017022731.1
• Aligned Length: 1662
• Identities: 1260
• Gaps: 399

Alignment

Query    1  ATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCACTTTGCATGGTCTCCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAACACCCAGGAGAAGAGCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCTTAGCTTTACGAATATTAAAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTTCACATCACATGGTTTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCCTTAATCTTTGCAAGCA  370
                                    |||  |||||                         |||            
Sbjct    1  ------------------------ATG--CAGAG-------------------------TAA------------  11

Query  371  TTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGCTGATTTGGATTCCTAGACTTGCCCAAGCA  444
               |||                   |||                  ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  ---ACA-------------------GAA------------------GATTTGGATTCCTAGACTTGCCCAAGCA  45

Query  445  CTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATCAGGAAGTGGCAAGATG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   46  CTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATCAGGAAGTGGCAAGATG  119

Query  519  GGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  GGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA  193

Query  593  CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  194  CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA  267

Query  667  TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  268  TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT  341

Query  741  CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  342  CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT  415

Query  815  CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTTGAAATTTAACGTGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTTGAAATTTAACGTGCTG  489

Query  889  CAGAACTTGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG  962
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  CAGAACTGGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG  563

Query  963  TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC  637

Query 1037  TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT  711

Query 1111  ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC  785

Query 1185  AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA  859

Query 1259  AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT  933

Query 1333  TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA  1007

Query 1407  TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTCACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTTACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT  1081

Query 1481  TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGTGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGCGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA  1155

Query 1555  AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA  1229

Query 1629  GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC  1662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230  GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC  1263