Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07481
• Subject: XM_017011527.1
• Aligned Length: 1773
• Identities: 1772
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTGGTAGGATCCCAGTCTTTTTCGCCTGGAGGGCCCAATGGGATCATTAGAAGCCAGTCCTTTGCGGGTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGGTAGGATCCCAGTCTTTTTCGCCTGGAGGGCCCAATGGGATCATTAGAAGCCAGTCCTTTGCGGGTTT  74

Query   75  CAGCGGCCTCCAGGAAAGGCGATCCAGGTGTAACTCCTTCATTGAAAATTCCTCCGCTCTCAAGAAGCCTCAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCGGCCTCCAGGAAAGGCGATCCAGGTGTAACTCCTTCATTGAAAATTCCTCCGCTCTCAAGAAGCCTCAGG  148

Query  149  CCAAACTGAAGAAAATGCACAATTTAGGCCACAAAAACAACAATCCCCCCAAAGAGCCTCAGCCTAAAAGGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAACTGAAGAAAATGCACAATTTAGGCCACAAAAACAACAATCCCCCCAAAGAGCCTCAGCCTAAAAGGGTG  222

Query  223  GAAGAAGTCTACAGGGCCTTGAAAAATGGACTTGATGAATATCTGGAGGTTCACCAGACGGAGCTGGACAAGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGAAGTCTACAGGGCCTTGAAAAATGGACTTGATGAATATCTGGAGGTTCACCAGACGGAGCTGGACAAGTT  296

Query  297  GACAGCTCAGTTAAAAGATATGAAAAGAAACTCTCGCCTGGGTGTACTGTATGACCTAGACAAGCAAATTAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACAGCTCAGTTAAAAGATATGAAAAGAAACTCTCGCCTGGGTGTACTGTATGACCTAGACAAGCAAATTAAAA  370

Query  371  CAATTGAAAGATACATGAGACGCCTGGAGTTTCATATAAGTAAGGTAGATGAACTCTATGAAGCTTATTGTATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAATTGAAAGATACATGAGACGCCTGGAGTTTCATATAAGTAAGGTAGATGAACTCTATGAAGCTTATTGTATC  444

Query  445  CAGCGACGCCTCCAGGATGGTGCCAGCAAAATGAAGCAAGCCTTCGCAACATCCCCTGCCAGCAAAGCTGCCCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCGACGCCTCCAGGATGGTGCCAGCAAAATGAAGCAAGCCTTCGCAACATCCCCTGCCAGCAAAGCTGCCCG  518

Query  519  GGAGAGTCTGACAGAGATCAATCGGAGCTTCAAGGAGTACACAGAGAATATGTGCACCATTGAAGTGGAGCTAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGAGTCTGACAGAGATCAATCGGAGCTTCAAGGAGTACACAGAGAATATGTGCACCATTGAAGTGGAGCTAG  592

Query  593  AGAATCTGCTGGGAGAATTCTCCATCAAGATGAAAGGTCTGGCTGGCTTTGCACGCCTCTGTCCTGGAGATCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAATCTGCTGGGAGAATTCTCCATCAAGATGAAAGGTCTGGCTGGCTTTGCACGCCTCTGTCCTGGAGATCAA  666

Query  667  TATGAAATTTTCATGAAGTATGGCCGGCAGCGGTGGAAACTGAAAGGCAAAATAGAAGTAAATGGCAAGCAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGAAATTTTCATGAAGTATGGCCGGCAGCGGTGGAAACTGAAAGGCAAAATAGAAGTAAATGGCAAGCAGAG  740

Query  741  CTGGGATGGAGAAGAAACAGTTTTTCTGCCCCTGATAGTTGGGTTCATCTCCATCAAGGTCACGGAGCTCAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGGATGGAGAAGAAACAGTTTTTCTGCCCCTGATAGTTGGGTTCATCTCCATCAAGGTCACGGAGCTCAAAG  814

Query  815  GGCTAGCAACTCACATCCTGGTAGGTAGCGTGACCTGTGAGACCAAAGAGCTGTTTGCAGCCCGACCTCAGGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTAGCAACTCACATCCTGGTAGGTAGCGTGACCTGTGAGACCAAAGAGCTGTTTGCAGCCCGACCTCAGGTA  888

Query  889  GTGGCTGTCGACATCAATGACCTTGGTACCATCAAACTGAACCTGGAAATCACCTGGTATCCATTTGACGTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGCTGTCGACATCAATGACCTTGGTACCATCAAACTGAACCTGGAAATCACCTGGTATCCATTTGACGTGGA  962

Query  963  GGACATGACCGCATCCTCAGGCGCTGGGAACAAGGCAGCAGCCCTTCAGAGGAGAATGTCCATGTACAGCCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACATGACCGCATCCTCAGGCGCTGGGAACAAGGCAGCAGCCCTTCAGAGGAGAATGTCCATGTACAGCCAGG  1036

Query 1037  GTACCCCGGAAACGCCCACCTTCAAAGACCACTCCTTCTTTTCAAATCTACCTGATGACATCTTTGAAAATGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTACCCCGGAAACGCCCACCTTCAAAGACCACTCCTTCTTTTCAAATCTACCTGATGACATCTTTGAAAATGGA  1110

Query 1111  AAGGCAGCCGAGGAGAAAATGCCACTGTCGCTCAGCTTCAGTGACCTGCCCAACGGGGACTGCGCCCTCACCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGGCAGCCGAGGAGAAAATGCCACTGTCGCTCAGCTTCAGTGACCTGCCCAACGGGGACTGCGCCCTCACCTC  1184

Query 1185  CCACTCAACAGGCTCCCCTTCCAACTCAACAAATCCAGAAATTACCATCACCCCTGCGGAGTTTAACCTCAGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACTCAACAGGCTCCCCTTCCAACTCAACAAATCCAGAAATTACCATCACCCCTGCGGAGTTTAACCTCAGCA  1258

Query 1259  GCTTGGCCTCCCAGAATGAGGGTATGGATGACACCAGCTCAGCATCTTCCAGGAACTCCCTGGGAGAAGGCCAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCTTGGCCTCCCAGAATGAGGGTATGGATGACACCAGCTCAGCATCTTCCAGGAACTCCCTGGGAGAAGGCCAA  1332

Query 1333  GAGCCAAAGTCACACCTGAAGGAGGAAGACCCAGAGGAGCCCAGAAAACCTGCCTCGGCCCCATCTGAGGCTTG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGCCAAAGTCACACCTGAAGGAGGAAGACCCAGAGGAGCCCAGAAAACCTGCCTCGGCCCCATCTGAGGCTTG  1406

Query 1407  CCGCCGACAGTCCTCAGGTGCTGGGGCTGAGCACCTGTTCCTTGAGAATGATGTTGCAGAAGCACTTCTGCAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCGCCGACAGTCCTCAGGTGCTGGGGCTGAGCACCTGTTCCTTGAGAATGATGTTGCAGAAGCACTTCTGCAAG  1480

Query 1481  AGTCTGAGGAGGCCTCTGAGCTCAAGCCTGTGGAACTGGACACTTCGGAAGGAAACATCACAAAGCAGCTGGTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTCTGAGGAGGCCTCTGAGCTCAAGCCTGTGGAACTGGACACTTCGGAAGGAAACATCACAAAGCAGCTGGTC  1554

Query 1555  AAGAGGCTCACATCTGCAGAGGTGCCAATGGCCACAGACAGGCTGCTCTCTGAGGGTTCTGTTGGTGGAGAATC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGAGGCTCACATCTGCAGAGGTGCCAATGGCCACAGACAGGCTGCTCTCTGAGGGTTCTGTTGGTGGAGAATC  1628

Query 1629  TGAAGGCTGCAGATCCTTTCTAGATGGAAGCTTAGAGGATGCTTTTAATGGGCTTTTACTTGCATTAGAACCAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAAGGCTGCAGATCCTTTCTAGATGGAAGCTTAGAGGATGCTTTTAATGGGCTTTTACTTGCATTAGAACCAC  1702

Query 1703  ATAAAGAGCAGTATAAAGAGTTTCAGGATCTGAACCAAGAAGTCATGAATTTGGANGATATTCTAAAAAAG  1773
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703  ATAAAGAGCAGTATAAAGAGTTTCAGGATCTGAACCAAGAAGTCATGAATTTGGATGATATTCTAAAAAAG  1773