Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07496
- Subject:
- NM_080288.2
- Aligned Length:
- 2181
- Identities:
- 1982
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGCCTACCCCAAACTCATGGAAATTGA 74
||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGCCGCCGCCTTCGGACATCGTGAAGGTGGCCATAGAATGGCCTGGCGCCTACCCTAAACTCATGGAGATTGA 74
Query 75 TCAGAAAAAACCACTGTCTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG 148
.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGAAAAAGCCACTGTCTGCCATTATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG 148
Query 149 CACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATATCACAGAAAAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATC 222
||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CACTGCAGCACGCTGATAGTTCAAACTTCTACATCACAGAAAAGAATCGCAACGAAATAAAAAATGGCACGATC 222
Query 223 CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAACGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGC 296
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAATGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATACAGTCATCAAGTATGGATGC 296
Query 297 CAAGCTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAAACCTGG 370
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 297 CAAGTTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTTACCTTTGCTCAGGAGTTCATAAACCTGG 370
Query 371 ACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTAGAGAGCGGCACTGAGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAG 444
|.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 ATGGCATCTCACTTCTCACTCAGATGGTGGAAAGTGGCACTGAACGATACCAGAAGTTGCAGAAGATTATGAAG 444
Query 445 CCTTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGATGGACCATGGCATAGTGTCCTG 518
||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 445 CCCTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACTCTCACAGCCTTTGTGGAGTTGATGGACCACGGCATTGTATCATG 518
Query 519 GGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAGAAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTCGATCC 592
|||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 519 GGATACATTCTCAGTGGCCTTCATTAAGAAGATAGCCAGCTTTGTGAACAAGTCTGCCATAGACATCTCAATCC 592
Query 593 TGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCCATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAG 666
|.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 593 TCCAGCGGTCCTTGGCCATTCTGGAGTCAATGGTTCTCAACAGTCATGACCTCTACCAAAAGGTAGCCCAGGAG 666
Query 667 ATCACCATCGGCCAGCTCATTCCACACCTGCAAGGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATACTATTGCAGTGAT 740
||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 667 ATCACCATTGGCCAACTCATTCCTCATCTTCAGGGGACAGACCAAGAAATACAAACTTACACCATTGCTGTAAT 740
Query 741 TAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGCAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGC 814
.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CAACGCACTTTTCCTCAAAGCTCCTGATGAGAGGAGACAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAGCTGC 814
Query 815 GTTCCATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTT 888
|.|.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||
Sbjct 815 GCTACATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCACAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCACACCAGTTATATGTT 888
Query 889 CTACAAGTGCTCACCTTTAACCTCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGCTCAGAG 962
||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 889 CTCCAAGTGCTGACCTTTAACCTTCTGGAAGACAGGATGATGACTAAGATGGACCCCCAGGACCAGGCCCAAAG 962
Query 963 GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGCTGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTCGATGCAGAGTCAGAACCTAATAACAGCAGTGGCAGCATGG 1036
Query 1037 AGAAACGCAAGTCCATGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATTAATCATGTCAACCCTGCCATGGAC 1110
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037 AGAAACGCAAGTCCATGTACACTCGGGATTATAAAAAACTTGGCTTCATTAATCACGTCAATCCTGCCATGGAC 1110
Query 1111 TTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCTGGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTA 1184
|||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 TTCACACAGACCCCTCCTGGGATGCTGGCTCTGGACAACATGCTGTATTTCGCTAAGCACCACCAGGATGCATA 1184
Query 1185 CATCCGGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGC 1258
|||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 CATCCGGATCGTGCTAGAGAACAGCAGCCGAGAAGATAAACATGAGTGCCCCTTCGGCCGCAGCAGTATAGAGC 1258
Query 1259 TGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAAGTGGGCGAGTTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTCCACCCGATG 1332
|||||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259 TGACCAAGATGCTGTGTGAGATCCTCAAAGTGGGCGAGCTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTTCACCCGATG 1332
Query 1333 TTCTTCACCCACGACAGATCCTTTGAGGAGTTTTTCTGCATCTGTATCCAGCTCCTGAACAAGACATGGAAGGA 1406
|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 TTCTTCACCCATGACAGATCTTTTGAGGAATTCTTCTGCATTTGCATTCAACTCCTGAACAAAACATGGAAGGA 1406
Query 1407 AATGAGGGCAACTTCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAA 1480
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 AATGAGGGCAACATCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCGCTTACAA 1480
Query 1481 CCAAGCCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACACTGAGATCCTGAAAATCCGC 1554
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAAGCCTAGTTCCCTGGACCAGTTCAAAAGCAAGCTGCAAAACCTGAGCTACACCGAGATCCTGAAAATCCGC 1554
Query 1555 CAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCCCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCAGA 1628
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 CAGTCTGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCTCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATCCAGCCAGA 1628
Query 1629 AATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCC 1702
|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629 AATCTTAGAGCTGATTAAACAGCAGCGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCTC 1702
Query 1703 GGCGGAGGCAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGAGACTTAGAA 1776
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1703 GCCGGAGACAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCACCAAATCACAAGGTCTTACATTATGGCGACTTGGAA 1776
Query 1777 GAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGACAAACTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGT 1850
|||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777 GAGAGCCCCCAAGGAGAAGTGCCCCACGATTCCCTGCAGGACAAATTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCAGTGGT 1850
Query 1851 GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTCGCTT 1924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851 GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTTGCTT 1924
Query 1925 TCTCCATCTTGTATGACTCAAACTGCCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGTACTGTATCTGGACG 1998
||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1925 TCTCCATCTTATACGACTCAAATTGCCAACTGAACTTCATTGCTCCTGATAAGCATGAGTACTGCATCTGGACA 1998
Query 1999 GATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGACCTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAG 2072
|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1999 GATGGGCTGAATGCACTGCTTGGGAAGGACATGATGAGTGACCTGACACGCAATGACCTGGACACCCTGCTGAG 2072
Query 2073 CATGGAAATCAAGCTCCGCCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTCCCAAGG 2146
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2073 CATGGAGATCAAGCTTCGCCTGCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCGGATGCACCTCCGCCTATCCCCAAGG 2146
Query 2147 AGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC 2181
|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2147 AACCTAGCAACTATGACTTTGTCTATGACTGTAAC 2181