Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07496
• Subject: XM_017315380.1
• Aligned Length: 2181
• Identities: 1717
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGCCTACCCCAAACTCATGGAAATTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCAGAAAAAACCACTGTCTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATATCACAGAAAAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAACGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGC  296
                                                                              ||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------ATGGATGC  8

Query  297  CAAGCTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAAACCTGG  370
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct    9  CAAGTTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTTACCTTTGCTCAGGAGTTCATAAACCTGG  82

Query  371  ACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTAGAGAGCGGCACTGAGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAG  444
            |.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct   83  ATGGCATCTCACTTCTCACTCAGATGGTGGAAAGTGGCACTGAACGATACCAGAAGTTGCAGAAGATTATGAAG  156

Query  445  CCTTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGATGGACCATGGCATAGTGTCCTG  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  157  CCCTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACTCTCACAGCCTTTGTGGAGTTGATGGACCACGGCATTGTATCATG  230

Query  519  GGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAGAAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTCGATCC  592
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  231  GGATACATTCTCAGTGGCCTTCATTAAGAAGATAGCCAGCTTTGTGAACAAGTCTGCCATAGACATCTCAATCC  304

Query  593  TGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCCATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAG  666
            |.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct  305  TCCAGCGGTCCTTGGCCATTCTGGAGTCAATGGTTCTCAACAGTCATGACCTCTACCAAAAGGTAGCCCAGGAG  378

Query  667  ATCACCATCGGCCAGCTCATTCCACACCTGCAAGGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATACTATTGCAGTGAT  740
            ||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct  379  ATCACCATTGGCCAACTCATTCCTCATCTTCAGGGGACAGACCAAGAAATACAAACTTACACCATTGCTGTAAT  452

Query  741  TAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGCAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGC  814
            .||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  453  CAACGCACTTTTCCTCAAAGCTCCTGATGAGAGGAGACAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAGCTGC  526

Query  815  GTTCCATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTT  888
            |.|.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||
Sbjct  527  GCTACATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCACAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCACACCAGTTATATGTT  600

Query  889  CTACAAGTGCTCACCTTTAACCTCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGCTCAGAG  962
            ||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  601  CTCCAAGTGCTGACCTTTAACCTTCTGGAAGACAGGATGATGACTAAGATGGACCCCCAGGACCAGGCCCAAAG  674

Query  963  GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGCTGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  675  GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTCGATGCAGAGTCAGAACCTAATAACAGCAGTGGCAGCATGG  748

Query 1037  AGAAACGCAAGTCCATGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATTAATCATGTCAACCCTGCCATGGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  749  AGAAACGCAAGTCCATGTACACTCGGGATTATAAAAAACTTGGCTTCATTAATCACGTCAATCCTGCCATGGAC  822

Query 1111  TTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCTGGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTA  1184
            |||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  823  TTCACACAGACCCCTCCTGGGATGCTGGCTCTGGACAACATGCTGTATTTCGCTAAGCACCACCAGGATGCATA  896

Query 1185  CATCCGGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGC  1258
            |||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  897  CATCCGGATCGTGCTAGAGAACAGCAGCCGAGAAGATAAACATGAGTGCCCCTTCGGCCGCAGCAGTATAGAGC  970

Query 1259  TGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAAGTGGGCGAGTTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTCCACCCGATG  1332
            |||||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  971  TGACCAAGATGCTGTGTGAGATCCTCAAAGTGGGCGAGCTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTTCACCCGATG  1044

Query 1333  TTCTTCACCCACGACAGATCCTTTGAGGAGTTTTTCTGCATCTGTATCCAGCTCCTGAACAAGACATGGAAGGA  1406
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1045  TTCTTCACCCATGACAGATCTTTTGAGGAATTCTTCTGCATTTGCATTCAACTCCTGAACAAAACATGGAAGGA  1118

Query 1407  AATGAGGGCAACTTCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAA  1480
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1119  AATGAGGGCAACATCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCGCTTACAA  1192

Query 1481  CCAAGCCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACACTGAGATCCTGAAAATCCGC  1554
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1193  CCAAGCCTAGTTCCCTGGACCAGTTCAAAAGCAAGCTGCAAAACCTGAGCTACACCGAGATCCTGAAAATCCGC  1266

Query 1555  CAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCCCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCAGA  1628
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1267  CAGTCTGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCTCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATCCAGCCAGA  1340

Query 1629  AATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCC  1702
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1341  AATCTTAGAGCTGATTAAACAGCAGCGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCTC  1414

Query 1703  GGCGGAGGCAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGAGACTTAGAA  1776
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1415  GCCGGAGACAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCACCAAATCACAAGGTCTTACATTATGGCGACTTGGAA  1488

Query 1777  GAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGACAAACTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGT  1850
            |||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1489  GAGAGCCCCCAAGGAGAAGTGCCCCACGATTCCCTGCAGGACAAATTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCAGTGGT  1562

Query 1851  GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTCGCTT  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1563  GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTTGCTT  1636

Query 1925  TCTCCATCTTGTATGACTCAAACTGCCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGTACTGTATCTGGACG  1998
            ||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1637  TCTCCATCTTATACGACTCAAATTGCCAACTGAACTTCATTGCTCCTGATAAGCATGAGTACTGCATCTGGACA  1710

Query 1999  GATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGACCTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAG  2072
            |||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1711  GATGGGCTGAATGCACTGCTTGGGAAGGACATGATGAGTGACCTGACACGCAATGACCTGGACACCCTGCTGAG  1784

Query 2073  CATGGAAATCAAGCTCCGCCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTCCCAAGG  2146
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1785  CATGGAGATCAAGCTTCGCCTGCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCGGATGCACCTCCGCCTATCCCCAAGG  1858

Query 2147  AGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC  2181
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1859  AACCTAGCAACTATGACTTTGTCTATGACTGTAAC  1893