Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07505
• Subject: NM_014844.5
• Aligned Length: 1411
• Identities: 1261
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  MASISEPVTFREFCPLYYLLNAIPTKIQKGFRSIVVYLTALDTNGDYIAVGSSIGMLYLHCRHLNQMRKYNFEG  74
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Sbjct    1  MASISEPVTFREFCPLYYLLNAIPTKIQKGFRSIVVYLTALDTNGDYIAVGSSIGMLYLYCRHLNQMRKYNFEG  74

Query   75  KTESITVVKLLSCFDDLVAAGTASGRVAVFQLVSSLPGRNKQLRRFDVTGIHKNSITALAWSPNGMKLFSGDDK  148
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Sbjct   75  KTESITVVKLLSCFDDLVAAGTASGRVAVFQLVSSLPGRNKQLRRFDVTGIHKNSITALAWSPNGMKLFSGDDK  148

Query  149  GKIVYSSLDLDQGLCNSQLVLEEPSSIVQLDYSQKVLLVSTLQRSLLFYTEEKSVRQIGTQPRKSTGKFGACFI  222
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Sbjct  149  GKIVYSSLDLDQGLCNSQLVLEEPSSIVQLDYSQKVLLVSTLQRSLLFYTEEKSVRQIGTQPRKSTGKFGACFI  222

Query  223  PGLCKQSDLTLYASRPGLRLWKADVHGTVQATFILKDAFAGGVKPFELHPRLESPNSGSCSLPERHLGLVSCFF  296
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Sbjct  223  PGLCKQSDLTLYASRPGLRLWKADVHGTVQATFILKDAFAGGVKPFELHPRLESPNSGSCSLPERHLGLVSCFF  296

Query  297  QEGWVLSWNEYSIYLLDTVNQATIAGLEGSGDIVSVSCTENEIFFLKGDRNIIRISSRPEGLTSTVRDGLEMSG  370
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Sbjct  297  QEGWVLSWNEYSIYLLDTVNQATVAGLEGSGDIVSVSCTENEIFFLKGDRNIIRISSRPEGLTSTVRDGLEMSG  370

Query  371  CSERVHVQQAEKLPGATVSETRLRGSSMASSVASEPRSRSSSLNSTDSGSGLLPPGLQATPELGKGSQPLSQRF  444
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Sbjct  371  CSERVHVQQAEKLPGATVSETRLRGSSMASSVASEPRSRSSSLNSTDSGSGLLPPGLQATPELGKGSQPLSQRF  444

Query  445  NAISSEDFDQELVVKPIKVKRKKKKKKTEGGSRSTCHSSLESTPCSEFPGDSPQSLNTDLLSMTSSVLGSSVDQ  518
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Sbjct  445  NAISSEDFDQELVVKPIKVKRKKKKKKTEGGSRSTCHSSLESTPCSEFPGDSPQSLNTDLLSMTSSVLGSSVDQ  518

Query  519  LSAESPDQESSFNGEVNGVPQENTDPETFNVLEVSGSMPDSLAEEDDIRTEMPHCHHAHGRELLNGAREDVGGS  592
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Sbjct  519  LSAESPDQESSFNGEVNGVPQENTDPETFNVLEVSGSMPDSLAEEDDIRTEMPHCHHAHGRELLNGAREDVGGS  592

Query  593  DVTGLGDEPCPADDGPNSTQLPFQEQDSSPGAHDGEDIQPIGPQSTFCEVPLLNSLTVPSSLSWAPSAEQWLPG  666
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Sbjct  593  DVTGLGDEPCPADDGPNSTQLPFQEQDSSPGAHDGEDIQPIGPQSTFCEVPLLNSLTVPSSLSWAPSAEQWLPG  666

Query  667  TRADEGSPVEPSQEQDILTSMEASGHLSTNLWHAVTDDDTGQKEIPISERVLGSVGGQLTPVSALAASTHKPWL  740
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Sbjct  667  TRADEGSPVEPSQEQDILTSMEASGHLSTNLWHAVTDDDTGQKEIPISERVLGSVGGQLTPVSALAASTHKPWL  740

Query  741  EQPPRDQTLTSSDEEDIYAHGLPSSSSETSVTELGPSCSQQDLSRLGAEDAGLLKPDQFAESWMGYSGPGYGIL  814
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Sbjct  741  EQPPRDQTLTSSDEEDIYAHGLPSSSSETSVTELGPSCSQQDLSRLGAEDAGLLKPDQFAESWMGYSGPGYGIL  814

Query  815  SLVVSEKYIWCLDYKGGLFCSALPGAGLRWQKFEDAVQQVAVSPSGALLWKIEQKSNRAFACGKVTIKGKRHWY  888
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Sbjct  815  SLVVSEKYIWCLDYKGGLFCSALPGAGLRWQKFEDAVQQVAVSPSGALLWKIEQKSNRAFACGKVTIKGKRHWY  888

Query  889  EALPQAVFVALSDDTAWIIRTSGDLYLQTGLSVDRPCARAVKVDCPYPLSQITARNNVVWALTEQRALLYREGV  962
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Sbjct  889  EALPQAVFVALSDDTAWIIRTSGDLYLQTGLSVDRPCARAVKVDCPYPLSQITARNNVVWALTEQRALLYREGV  962

Query  963  SSFCPEGEQWKCDIVSERQALEPVCITLGDQQTLWALDIHGNLWFRTGIISKKPQGDDDHWWQVSITDYVVFDQ  1036
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Sbjct  963  SSFCPEGEQWKCDIVSERQALEPVCITLGDQQTLWALDIHGNLWFRTGIISKKPQGDDDHWWQVSITDYVVFDQ  1036

Query 1037  CSLFQTIIHATHSVATAAQAPVEKVADKLRMAFWSQQLQCQPSLLGVNNSGVWISSGKNEFHVAKGSLIGTYWN  1110
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Sbjct 1037  CSLFQTIIHATHSVATAAQAPVEKVADKLRMAFWSQQLQCQPSLLGVNNSGVWISSGKNEFHVAKGSLIGTYWN  1110

Query 1111  HVVPRGTASATKWAFVLASAAPTKEGSFLWLCQSSKDLCSVSAQSAQSRPSTVQLPPEAEMRAYAACQDALWAL  1184
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Sbjct 1111  HVVPRGTASATKWAFVLASAAPTKEGSFLWLCQSSKDLCSVSAQSAQSRPSTVQLPPEAEMRAYAACQDALWAL  1184

Query 1185  DSLGQVFIRTLSKSCPTGMHWTRLDLSQLGAVKLTSLACGNQHIWACDSRGGVYFRVGTQPLNPSLMLPAWIMI  1258
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Sbjct 1185  DSLGQVFIRTLSKSCPTGMHWTRLDLSQLGAVKLTSLACGNQHIWACDSRGGVYFRVGTQPLNPSLMLPAWIMI  1258

Query 1259  EPPVQVSRS-----------------------------------------------------------------  1267
            |||||....                                                                 
Sbjct 1259  EPPVQPAGVSLVSVHSSPNDQMLWVLDSRWNVHVRTGITEEMPVGTAWEHVPGLQACQLALSTRTVWARCPNGD  1332

Query 1268  --------------------------------------------------------------------------  1267
                                                                                      
Sbjct 1333  LARRYGVTDKNPAGDYWKKIPGSVSCFTVTASDELWAVGPPGYLLQRLTKTFSHSHGTQKSSQAAMPHPEDLED  1406

Query 1268  -----  1267
                 
Sbjct 1407  EWEVI  1411