Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07510
• Subject: NM_014868.5
• Aligned Length: 2433
• Identities: 2432
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCGCTGAGCTCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCTCCGACATGGACAAGAACAGCGGCTCCAACAGCTCCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGCTGAGCTCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCTCCGACATGGACAAGAACAGCGGCTCCAACAGCTCCTC  74

Query   75  CGCCTCTTCGGGCAGCAGCAAAGGGCAACAGCCGCCCCGCTCCGCCTCGGCGGGGCCAGCCGGCGAGTCTAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCCTCTTCGGGCAGCAGCAAAGGGCAACAGCCGCCCCGCTCCGCCTCGGCGGGGCCAGCCGGCGAGTCTAAAC  148

Query  149  CCAAGAGCGATGGAAAGAACTCCAGTGGATCCAAGCGTTATAATCGCAAACGTGAACTTTCCTACCCCAAAAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAGAGCGATGGAAAGAACTCCAGTGGATCCAAGCGTTATAATCGCAAACGTGAACTTTCCTACCCCAAAAAT  222

Query  223  GAAAGTTTTAACAACCAGTCCCGTCGCTCCAGTTCACAGAAAAGCAAGACTTTTAACAAGATGCCTCCTCAAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAGTTTTAACAACCAGTCCCGTCGCTCCAGTTCACAGAAAAGCAAGACTTTTAACAAGATGCCTCCTCAAAG  296

Query  297  GGGCGGCGGCAGCAGCAAACTCTTTAGCTCTTCTTTTAATGGTGGAAGACGAGATGAGGTAGCAGAGGCTCAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCGGCGGCAGCAGCAAACTCTTTAGCTCTTCTTTTAATGGTGGAAGACGAGATGAGGTAGCAGAGGCTCAAC  370

Query  371  GGGCAGAGTTTAGCCCTGCCCAGTTCTCTGGTCCTAAGAAGATCAACCTGAACCACTTGTTGAATTTCACTTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCAGAGTTTAGCCCTGCCCAGTTCTCTGGTCCTAAGAAGATCAACCTGAACCACTTGTTGAATTTCACTTTT  444

Query  445  GAACCCCGTGGCCAGACGGGTCACTTTGAAGGCAGTGGACATGGTAGCTGGGGAAAGAGGAACAAGTGGGGACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAACCCCGTGGCCAGACGGGTCACTTTGAAGGCAGTGGACATGGTAGCTGGGGAAAGAGGAACAAGTGGGGACA  518

Query  519  TAAGCCTTTTAACAAGGAACTCTTTTTACAGGCCAACTGCCAATTTGTGGTGTCTGAAGACCAAGACTACACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAGCCTTTTAACAAGGAACTCTTTTTACAGGCCAACTGCCAATTTGTGGTGTCTGAAGACCAAGACTACACAG  592

Query  593  CTCATTTTGCTGATCCTGATACATTAGTTAACTGGGACTTTGTGGAACAAGTGCGCATTTGTAGCCATGAAGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCATTTTGCTGATCCTGATACATTAGTTAACTGGGACTTTGTGGAACAAGTGCGCATTTGTAGCCATGAAGTG  666

Query  667  CCATCTTGCCCAATATGCCTCTATCCACCTACTGCAGCCAAGATAACCCGTTGTGGACACATCTTCTGCTGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCATCTTGCCCAATATGCCTCTATCCACCTACTGCAGCCAAGATAACCCGTTGTGGACACATCTTCTGCTGGGC  740

Query  741  ATGCATCCTGCACTATCTTTCACTGAGTGAGAAGACGTGGAGTAAATGTCCCATCTGTTACAGTTCTGTGCATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGCATCCTGCACTATCTTTCACTGAGTGAGAAGACGTGGAGTAAATGTCCCATCTGTTACAGTTCTGTGCATA  814

Query  815  AGAAGGATCTCAAGAGTGTTGTTGCCACAGAGTCACATCAGTATGTTGTTGGTGATACCATTACGATGCAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGGATCTCAAGAGTGTTGTTGCCACAGAGTCACATCAGTATGTTGTTGGTGATACCATTACGATGCAGCTG  888

Query  889  ATGAAGAGGGAGAAAGGGGTGTTGGTGGCTTTGCCCAAATCCAAATGGATGAATGTAGACCATCCCATTCATCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGAAGAGGGAGAAAGGGGTGTTGGTGGCTTTGCCCAAATCCAAATGGATGAATGTAGACCATCCCATTCATCT  962

Query  963  AGGAGATGAACAGCACAGCCAGTACTCCAAGTTTCTGCTGGCCTCTAAGGAGCAGGTGCTGCACCGGGTAGTTC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGAGATGAACAGCACAGCCAGTACTCCAAGTTGCTGCTGGCCTCTAAGGAGCAGGTGCTGCACCGGGTAGTTC  1036

Query 1037  TGGAGGAGAAAGTAGCACTAGAGCAGCAGCTGGCAGAGGAGAAGCACACTCCCGAGTCCTGCTTTATTGAGGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGAGGAGAAAGTAGCACTAGAGCAGCAGCTGGCAGAGGAGAAGCACACTCCCGAGTCCTGCTTTATTGAGGCA  1110

Query 1111  GCTATCCAGGAGCTCAAGACTCGGGAAGAGGCTCTGTCGGGATTGGCCGGAAGCAGAAGGGAGGTCACTGGTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTATCCAGGAGCTCAAGACTCGGGAAGAGGCTCTGTCGGGATTGGCCGGAAGCAGAAGGGAGGTCACTGGTGT  1184

Query 1185  TGTGGCTGCTCTGGAACAACTGGTGCTGATGGCTCCCTTGGCGAAGGAGTCTGTTTTTCAACCCAGGAAGGGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGGCTGCTCTGGAACAACTGGTGCTGATGGCTCCCTTGGCGAAGGAGTCTGTTTTTCAACCCAGGAAGGGTG  1258

Query 1259  TGCTGGAGTATCTGTCTGCCTTCGATGAAGAAACCACGGAAGTTTGTTCTCTGGACACTCCTTCTAGACCTCTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGGAGTATCTGTCTGCCTTCGATGAAGAAACCACGGAAGTTTGTTCTCTGGACACTCCTTCTAGACCTCTT  1332

Query 1333  GCTCTCCCTCTGGTAGAAGAGGAGGAAGCAGTGTCTGAACCAGAGCCTGAGGGGTTGCCAGAGGCCTGTGATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTCTCCCTCTGGTAGAAGAGGAGGAAGCAGTGTCTGAACCAGAGCCTGAGGGGTTGCCAGAGGCCTGTGATGA  1406

Query 1407  CTTGGAGTTAGCAGATGACAATCTTAAAGAGGGGACCATTTGCACTGAGTCCAGCCAGCAGGAACCCATCACCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTGGAGTTAGCAGATGACAATCTTAAAGAGGGGACCATTTGCACTGAGTCCAGCCAGCAGGAACCCATCACCA  1480

Query 1481  AGTCAGGCTTCACACGCCTCAGCAGCTCTCCTTGTTACTACTTTTACCAAGCGGAAGATGGACAGCATATGTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTCAGGCTTCACACGCCTCAGCAGCTCTCCTTGTTACTACTTTTACCAAGCGGAAGATGGACAGCATATGTTC  1554

Query 1555  CTGCACCCTGTGAATGTGCGCTGCCTCGTGCGGGAGTACGGCAGCCTGGAGAGGAGCCCCGAGAAGATCTCAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCACCCTGTGAATGTGCGCTGCCTCGTGCGGGAGTACGGCAGCCTGGAGAGGAGCCCCGAGAAGATCTCAGC  1628

Query 1629  AACTGTGGTGGAGATTGCTGGCTACTCCATGTCTGAGGATGTTCGACAGCGTCACAGATATCTCTCTCACTTGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AACTGTGGTGGAGATTGCTGGCTACTCCATGTCTGAGGATGTTCGACAGCGTCACAGATATCTCTCTCACTTGC  1702

Query 1703  CACTCACCTGTGAGTTCAGCATCTGTGAACTGGCTTTGCAACCTCCTGTGGTCTCTAAGGAAACCCTAGAGATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CACTCACCTGTGAGTTCAGCATCTGTGAACTGGCTTTGCAACCTCCTGTGGTCTCTAAGGAAACCCTAGAGATG  1776

Query 1777  TTCTCAGATGACATTGAGAAGAGGAAACGTCAGCGCCAAAAGAAGGCTCGGGAGGAACGCCGCCGAGAGCGCAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCTCAGATGACATTGAGAAGAGGAAACGTCAGCGCCAAAAGAAGGCTCGGGAGGAACGCCGCCGAGAGCGCAG  1850

Query 1851  GATTGAGATAGAGGAGAACAAGAAACAGGGCAAGTACCCAGAAGTCCACATTCCCCTCGAGAATCTACAGCAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GATTGAGATAGAGGAGAACAAGAAACAGGGCAAGTACCCAGAAGTCCACATTCCCCTCGAGAATCTACAGCAGT  1924

Query 1925  TTCCTGCCTTCAATTCTTATACCTGCTCCTCTGATTCTGCTTTGGGTCCCACCAGCACCGAGGGCCATGGGGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTCCTGCCTTCAATTCTTATACCTGCTCCTCTGATTCTGCTTTGGGTCCCACCAGCACCGAGGGCCATGGGGCC  1998

Query 1999  CTCTCCATTTCTCCTCTCAGCAGAAGTCCAGGTTCCCATGCAGACTTTCTGCTGACCCCTCTGTCACCCACTGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCTCCATTTCTCCTCTCAGCAGAAGTCCAGGTTCCCATGCAGACTTTCTGCTGACCCCTCTGTCACCCACTGC  2072

Query 2073  CAGTCAGGGCAGTCCCTCATTCTGCGTTGGGAGTCTGGAAGAAGACTCTCCCTTCCCTTCCTTTGCCCAGATGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAGTCAGGGCAGTCCCTCATTCTGCGTTGGGAGTCTGGAAGAAGACTCTCCCTTCCCTTCCTTTGCCCAGATGC  2146

Query 2147  TGAGGGTTGGAAAAGCAAAAGCAGATGTGTGGCCCAAAACTGCTCCAAAGAAAGATGAGAACAGCTTAGTTCCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGAGGGTTGGAAAAGCAAAAGCAGATGTGTGGCCCAAAACTGCTCCAAAGAAAGATGAGAACAGCTTAGTTCCT  2220

Query 2221  CCTGCCCCTGTGGACAGCGACGGGGAGAGTGATAATTCAGACCGTGTTCCTGTGCCCAGTTTTCAAAATTCCTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCTGCCCCTGTGGACAGCGACGGGGAGAGTGATAATTCAGACCGTGTTCCTGTGCCCAGTTTTCAAAATTCCTT  2294

Query 2295  CAGCCAAGCTATTGAAGCAGCCTTCATGAAACTGGACACACCAGCTACTTCAGATCCCCTCTCTGAAGAGAAAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CAGCCAAGCTATTGAAGCAGCCTTCATGAAACTGGACACACCAGCTACTTCAGATCCCCTCTCTGAAGAGAAAG  2368

Query 2369  GAGGAAAGAAAAGAAAAAAACAGAAACAGAAGCTCCTGTTCAGCACCTCAGTCGTCCACACCAAG  2433
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GAGGAAAGAAAAGAAAAAAACAGAAACAGAAGCTCCTGTTCAGCACCTCAGTCGTCCACACCAAG  2433