Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07510
• Subject: XM_017020282.1
• Aligned Length: 2433
• Identities: 2279
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGCCGCTGAGCTCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCTCCGACATGGACAAGAACAGCGGCTCCAACAGCTCCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGCCTCTTCGGGCAGCAGCAAAGGGCAACAGCCGCCCCGCTCCGCCTCGGCGGGGCCAGCCGGCGAGTCTAAAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCAAGAGCGATGGAAAGAACTCCAGTGGATCCAAGCGTTATAATCGCAAACGTGAACTTTCCTACCCCAAAAAT  222
              |.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --ATGATGGATGGAAAGAACTCCAGTGGATCCAAGCGTTATAATCGCAAACGTGAACTTTCCTACCCCAAAAAT  72

Query  223  GAAAGTTTTAACAACCAGTCCCGTCGCTCCAGTTCACAGAAAAGCAAGACTTTTAACAAGATGCCTCCTCAAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  GAAAGTTTTAACAACCAGTCCCGTCGCTCCAGTTCACAGAAAAGCAAGACTTTTAACAAGATGCCTCCTCAAAG  146

Query  297  GGGCGGCGGCAGCAGCAAACTCTTTAGCTCTTCTTTTAATGGTGGAAGACGAGATGAGGTAGCAGAGGCTCAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  GGGCGGCGGCAGCAGCAAACTCTTTAGCTCTTCTTTTAATGGTGGAAGACGAGATGAGGTAGCAGAGGCTCAAC  220

Query  371  GGGCAGAGTTTAGCCCTGCCCAGTTCTCTGGTCCTAAGAAGATCAACCTGAACCACTTGTTGAATTTCACTTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  GGGCAGAGTTTAGCCCTGCCCAGTTCTCTGGTCCTAAGAAGATCAACCTGAACCACTTGTTGAATTTCACTTTT  294

Query  445  GAACCCCGTGGCCAGACGGGTCACTTTGAAGGCAGTGGACATGGTAGCTGGGGAAAGAGGAACAAGTGGGGACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  GAACCCCGTGGCCAGACGGGTCACTTTGAAGGCAGTGGACATGGTAGCTGGGGAAAGAGGAACAAGTGGGGACA  368

Query  519  TAAGCCTTTTAACAAGGAACTCTTTTTACAGGCCAACTGCCAATTTGTGGTGTCTGAAGACCAAGACTACACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TAAGCCTTTTAACAAGGAACTCTTTTTACAGGCCAACTGCCAATTTGTGGTGTCTGAAGACCAAGACTACACAG  442

Query  593  CTCATTTTGCTGATCCTGATACATTAGTTAACTGGGACTTTGTGGAACAAGTGCGCATTTGTAGCCATGAAGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  CTCATTTTGCTGATCCTGATACATTAGTTAACTGGGACTTTGTGGAACAAGTGCGCATTTGTAGCCATGAAGTG  516

Query  667  CCATCTTGCCCAATATGCCTCTATCCACCTACTGCAGCCAAGATAACCCGTTGTGGACACATCTTCTGCTGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  CCATCTTGCCCAATATGCCTCTATCCACCTACTGCAGCCAAGATAACCCGTTGTGGACACATCTTCTGCTGGGC  590

Query  741  ATGCATCCTGCACTATCTTTCACTGAGTGAGAAGACGTGGAGTAAATGTCCCATCTGTTACAGTTCTGTGCATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  ATGCATCCTGCACTATCTTTCACTGAGTGAGAAGACGTGGAGTAAATGTCCCATCTGTTACAGTTCTGTGCATA  664

Query  815  AGAAGGATCTCAAGAGTGTTGTTGCCACAGAGTCACATCAGTATGTTGTTGGTGATACCATTACGATGCAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  AGAAGGATCTCAAGAGTGTTGTTGCCACAGAGTCACATCAGTATGTTGTTGGTGATACCATTACGATGCAGCTG  738

Query  889  ATGAAGAGGGAGAAAGGGGTGTTGGTGGCTTTGCCCAAATCCAAATGGATGAATGTAGACCATCCCATTCATCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  ATGAAGAGGGAGAAAGGGGTGTTGGTGGCTTTGCCCAAATCCAAATGGATGAATGTAGACCATCCCATTCATCT  812

Query  963  AGGAGATGAACAGCACAGCCAGTACTCCAAGTTTCTGCTGGCCTCTAAGGAGCAGGTGCTGCACCGGGTAGTTC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AGGAGATGAACAGCACAGCCAGTACTCCAAGTTGCTGCTGGCCTCTAAGGAGCAGGTGCTGCACCGGGTAGTTC  886

Query 1037  TGGAGGAGAAAGTAGCACTAGAGCAGCAGCTGGCAGAGGAGAAGCACACTCCCGAGTCCTGCTTTATTGAGGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  TGGAGGAGAAAGTAGCACTAGAGCAGCAGCTGGCAGAGGAGAAGCACACTCCCGAGTCCTGCTTTATTGAGGCA  960

Query 1111  GCTATCCAGGAGCTCAAGACTCGGGAAGAGGCTCTGTCGGGATTGGCCGGAAGCAGAAGGGAGGTCACTGGTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GCTATCCAGGAGCTCAAGACTCGGGAAGAGGCTCTGTCGGGATTGGCCGGAAGCAGAAGGGAGGTCACTGGTGT  1034

Query 1185  TGTGGCTGCTCTGGAACAACTGGTGCTGATGGCTCCCTTGGCGAAGGAGTCTGTTTTTCAACCCAGGAAGGGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  TGTGGCTGCTCTGGAACAACTGGTGCTGATGGCTCCCTTGGCGAAGGAGTCTGTTTTTCAACCCAGGAAGGGTG  1108

Query 1259  TGCTGGAGTATCTGTCTGCCTTCGATGAAGAAACCACGGAAGTTTGTTCTCTGGACACTCCTTCTAGACCTCTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TGCTGGAGTATCTGTCTGCCTTCGATGAAGAAACCACGGAAGTTTGTTCTCTGGACACTCCTTCTAGACCTCTT  1182

Query 1333  GCTCTCCCTCTGGTAGAAGAGGAGGAAGCAGTGTCTGAACCAGAGCCTGAGGGGTTGCCAGAGGCCTGTGATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GCTCTCCCTCTGGTAGAAGAGGAGGAAGCAGTGTCTGAACCAGAGCCTGAGGGGTTGCCAGAGGCCTGTGATGA  1256

Query 1407  CTTGGAGTTAGCAGATGACAATCTTAAAGAGGGGACCATTTGCACTGAGTCCAGCCAGCAGGAACCCATCACCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  CTTGGAGTTAGCAGATGACAATCTTAAAGAGGGGACCATTTGCACTGAGTCCAGCCAGCAGGAACCCATCACCA  1330

Query 1481  AGTCAGGCTTCACACGCCTCAGCAGCTCTCCTTGTTACTACTTTTACCAAGCGGAAGATGGACAGCATATGTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  AGTCAGGCTTCACACGCCTCAGCAGCTCTCCTTGTTACTACTTTTACCAAGCGGAAGATGGACAGCATATGTTC  1404

Query 1555  CTGCACCCTGTGAATGTGCGCTGCCTCGTGCGGGAGTACGGCAGCCTGGAGAGGAGCCCCGAGAAGATCTCAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  CTGCACCCTGTGAATGTGCGCTGCCTCGTGCGGGAGTACGGCAGCCTGGAGAGGAGCCCCGAGAAGATCTCAGC  1478

Query 1629  AACTGTGGTGGAGATTGCTGGCTACTCCATGTCTGAGGATGTTCGACAGCGTCACAGATATCTCTCTCACTTGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  AACTGTGGTGGAGATTGCTGGCTACTCCATGTCTGAGGATGTTCGACAGCGTCACAGATATCTCTCTCACTTGC  1552

Query 1703  CACTCACCTGTGAGTTCAGCATCTGTGAACTGGCTTTGCAACCTCCTGTGGTCTCTAAGGAAACCCTAGAGATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  CACTCACCTGTGAGTTCAGCATCTGTGAACTGGCTTTGCAACCTCCTGTGGTCTCTAAGGAAACCCTAGAGATG  1626

Query 1777  TTCTCAGATGACATTGAGAAGAGGAAACGTCAGCGCCAAAAGAAGGCTCGGGAGGAACGCCGCCGAGAGCGCAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  TTCTCAGATGACATTGAGAAGAGGAAACGTCAGCGCCAAAAGAAGGCTCGGGAGGAACGCCGCCGAGAGCGCAG  1700

Query 1851  GATTGAGATAGAGGAGAACAAGAAACAGGGCAAGTACCCAGAAGTCCACATTCCCCTCGAGAATCTACAGCAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  GATTGAGATAGAGGAGAACAAGAAACAGGGCAAGTACCCAGAAGTCCACATTCCCCTCGAGAATCTACAGCAGT  1774

Query 1925  TTCCTGCCTTCAATTCTTATACCTGCTCCTCTGATTCTGCTTTGGGTCCCACCAGCACCGAGGGCCATGGGGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775  TTCCTGCCTTCAATTCTTATACCTGCTCCTCTGATTCTGCTTTGGGTCCCACCAGCACCGAGGGCCATGGGGCC  1848

Query 1999  CTCTCCATTTCTCCTCTCAGCAGAAGTCCAGGTTCCCATGCAGACTTTCTGCTGACCCCTCTGTCACCCACTGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849  CTCTCCATTTCTCCTCTCAGCAGAAGTCCAGGTTCCCATGCAGACTTTCTGCTGACCCCTCTGTCACCCACTGC  1922

Query 2073  CAGTCAGGGCAGTCCCTCATTCTGCGTTGGGAGTCTGGAAGAAGACTCTCCCTTCCCTTCCTTTGCCCAGATGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923  CAGTCAGGGCAGTCCCTCATTCTGCGTTGGGAGTCTGGAAGAAGACTCTCCCTTCCCTTCCTTTGCCCAGATGC  1996

Query 2147  TGAGGGTTGGAAAAGCAAAAGCAGATGTGTGGCCCAAAACTGCTCCAAAGAAAGATGAGAACAGCTTAGTTCCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997  TGAGGGTTGGAAAAGCAAAAGCAGATGTGTGGCCCAAAACTGCTCCAAAGAAAGATGAGAACAGCTTAGTTCCT  2070

Query 2221  CCTGCCCCTGTGGACAGCGACGGGGAGAGTGATAATTCAGACCGTGTTCCTGTGCCCAGTTTTCAAAATTCCTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071  CCTGCCCCTGTGGACAGCGACGGGGAGAGTGATAATTCAGACCGTGTTCCTGTGCCCAGTTTTCAAAATTCCTT  2144

Query 2295  CAGCCAAGCTATTGAAGCAGCCTTCATGAAACTGGACACACCAGCTACTTCAGATCCCCTCTCTGAAGAGAAAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145  CAGCCAAGCTATTGAAGCAGCCTTCATGAAACTGGACACACCAGCTACTTCAGATCCCCTCTCTGAAGAGAAAG  2218

Query 2369  GAGGAAAGAAAAGAAAAAAACAGAAACAGAAGCTCCTGTTCAGCACCTCAGTCGTCCACACCAAG  2433
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219  GAGGAAAGAAAAGAAAAAAACAGAAACAGAAGCTCCTGTTCAGCACCTCAGTCGTCCACACCAAG  2283