Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07540
• Subject: NM_019748.3
• Aligned Length: 1055
• Identities: 911
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGAAGGAGGAGGCTGGCGGC------------GGCATTAGCGAGGAGGAGGCGGCACAGTATGACCG  62
            |||||.|||||||||||||||||||||            |||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGTAGAGAAGGAGGAGGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGCATCAGCGAGGAGGAGGCAGCGCAGTATGACCG  74

Query   63  GCAGATCCGCCTGTGGGGACTGGAGGCCCAGAAACGGCTGCGGGCCTCTCGGGTGCTTCTTGTCGGCTTGAAAG  136
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||..||||.|||.||||||
Sbjct   75  ACAGATCCGCCTGTGGGGACTGGAGGCCCAGAAGCGGCTTCGAGCTTCCCGGGTGCTGATTGTTGGCATGAAAG  148

Query  137  GACTTGGGGCTGAAATTGCCAAGAATCTCATCTTGGCAGGAGTGAAAGGACTGACCATGCTGGATCACGAACAG  210
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  GACTTGGAGCTGAAATTGCCAAGAATCTTATCCTGGCAGGAGTCAAAGGGCTCACCATGCTGGACCACGAACAG  222

Query  211  GTAACTCCAGAAGATCCCGGAGCTCAGTTCTTGATTCGTACTGGGTCTGTTGGCCGAAATAGGGCTGAAGCCTC  284
            |||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  223  GTATCTCCAGAAGACCCTGGAGCTCAGTTCTTGATTCAGACTGGGTCTGTGGGCCGCAATAGGGCCGAGGCCTC  296

Query  285  TTTGGAGCGAGCTCAGAATCTCAACCCCATGGTGGATGTGAAGGTGGACACTGAGGATATAGAGAAGAAACCAG  358
            ||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  297  TTTGGAACGAGCCCAGAATCTCAATCCCATGGTGGATGTAAAGGTGGACACTGAGGATGTAGAGAAGAAGCCAG  370

Query  359  AGTCATTTTTCACTCAATTCGATGCTGTGTGTCTGACTTGCTGCTCCAGGGATGTCATAGTTAAAGTTGACCAG  432
            ||||.||.|||||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||.||||||
Sbjct  371  AGTCCTTCTTCACGAAGTTTGATGCGGTGTGCCTGACTTGCTGCTCCAGAGATGTCATCATTAAAGTCGACCAG  444

Query  433  ATCTGTCACAAAAATAGCATCAAGTTCTTTACAGGAGATGTTTTTGGCTACCATGGATACACATTTGCCAATCT  506
            ||||||||||.|||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  445  ATCTGTCACAGAAACAGCATTAAGTTCTTCACAGGAGATGTCTTTGGGTACCATGGGTACACCTTTGCGAATCT  518

Query  507  AGGAGAGCATGAGTTTGTAGAGGAGAAAACTAAAGTTGCCAAAGTTAGCCAAGGAGTAGAAGATGGGCCCGACA  580
            .|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..
Sbjct  519  TGGAGAGCATGAATTTGTAGAAGAGAAAACCAAAGTTGCCAAAGTAAGCCAAGGAGTGGAAGATGGACCTGAGG  592

Query  581  CCAAGAGAGCAAAACTTGATTCTTCTGAGACAACGATGGTCAAAAAGAAGGTGGTCTTCTGCCCTGTTAAAGAA  654
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||.
Sbjct  593  CCAAGAGAGCAAAGCTTGATTCATCAGAGACAACCATGGTCAAAAAGAAAGTGCTTTTTTGCCCTGTAAAAGAG  666

Query  655  GCCCTGGAGGTGGACTGGAGCAGTGAGAAAGCAAAGGCTGCTCTGAAGCGCACGACCTCCGACTACTTTCTCCT  728
            ||.||.||.|||||||||||..|.||||||||.||||||||.||||||||.||..||.|||||||||||||.||
Sbjct  667  GCGCTAGAAGTGGACTGGAGTGGAGAGAAAGCCAAGGCTGCCCTGAAGCGTACTGCCCCCGACTACTTTCTGCT  740

Query  729  TCAAGTGCT-CTTAAAGTTCCGTACAGATAAAGGAAGAGATCCCAGTTCTGA----TACATATGAGGAAGATTC  797
            .|||||||| ||.||| |||||.|||||||||||.||||||||.|.||||||    ||||    ||||.|||.|
Sbjct  741  GCAAGTGCTGCTGAAA-TTCCGCACAGATAAAGGGAGAGATCCGACTTCTGAGAGCTACA----AGGAGGATGC  809

Query  798  TGAGTTGTTGCTCCAGATACGAAATGATGTGCTTGACTCACTGGGTATTAGTCCTGACCTGCTTCCTGAGGACT  871
            .|||.||.||||.||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  810  GGAGCTGCTGCTGCAGATACGGAATGACGTGTTTGACTCCCTGGGCATCAGTCCTGACCTGCTTCCCGATGACT  883

Query  872  TTGTCAGGTACTGCTTCTCCGAGATGGCCCCAGTGTGTGCGGTGGTTGGAGGGATTTTGGCACAGGAAATTGTG  945
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  884  TTGTCAGGTACTGCTTCTCTGAGATGGCCCCAGTATGTGCTGTGGTTGGAGGGATCTTGGCACAGGAAATTGTG  957

Query  946  AAGGCCCTGTCTCAGCGGGACCCTCCTCACAACAACTTCTTCTTCTTCGATGGCATGAAGGGGAATGGGATTGT  1019
            ||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  958  AAGGCCCTGTCTCAAAGGGACCCTCCTCACAACAACTTCTTCTTCTTCGACGGCATGAAGGGGAGTGGAATTGT  1031

Query 1020  GGAGTGCCTTGACCCCAAG  1038
            |||||||||||..|||.||
Sbjct 1032  GGAGTGCCTTGGTCCCCAG  1050