Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07553
- Subject:
- NM_006778.4
- Aligned Length:
- 1447
- Identities:
- 1160
- Gaps:
- 266
Alignment
Query 1 ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGACCAGCCTGGCAGATGAAGTCAACTGCCCCATCTGTCAGGGTACCCTGAGGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGACCAGCCTGGCAGATGAAGTCAACTGCCCCATCTGTCAGGGTACCCTGAGGGA 74
Query 75 GCCGGTCACTATCGACTGCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCGGTCACTATCGACTGCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAG 148
Query 149 ACCTGGAGGAGTCCCCTACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCTGGAGGAGTCCCCTACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAG 222
Query 223 CTGGCTAACGTGGTGGAGAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGCTAACGTGGTGGAGAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTG 296
Query 297 CCAAGAGCACGGAGAGAAGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAAGAGCACGGAGAGAAGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGG 370
Query 371 CTGGGGAGCACGCTACCCACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGGGGAGCACGCTACCCACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAG 444
Query 445 TGTCTTAAATGTCTAAGAAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGTCTTAAATGTCTAAGAAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGT 518
Query 519 CCTCCTGACTCAGGTGTCCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTCCTGACTCAGGTGTCCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGG 592
Query 593 AACAGCAGAGCATCCTCTTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACAGCAGAGCATCCTCTTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGAT 666
Query 667 TTGCTGGTTGCTGGGGAGATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTGCTGGTTGCTGGGGAGATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGC 740
Query 741 AAGGGAGCTCCTGACGGACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAGGGAGCTCCTGACGGACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTG 814
Query 815 TGTCGCCAGAGCTGGGCCAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGTCGCCAGAGCTGGGCCAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATG 888
Query 889 TTTCTGGAAAAACTATGCTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTCTGGAAAAACTATGCTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCC 962
Query 963 CAAGCTCCTCTTGTCCGAGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGCTCCTCTTGTCCGAGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCC 1036
Query 1037 AGCGTTTTGACCGGGCCACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGTGGA-- 1108
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 1037 AACGTTTTGACCGGGCCACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGGTGAGT 1110
Query 1109 -------TGGCC----AGGGTACCT--------------------------------------GGGGA-CTCAG 1132
||||| .|||.|.|| ||||| ||..|
Sbjct 1111 ATAGACCTGGCCCATGGGGGCAGCTGCACCGTGGGCGTGGTGAGCGAGGATGTGCAGCGGAAGGGGGAGCTTCG 1184
Query 1133 GCTGCTGCCAG-----------------------------------TTCTGCTCACCACCATCCGTGCT----- 1166
|||||.||||| |||..|||..| ||.|.|||
Sbjct 1185 GCTGCGGCCAGAGGAGGGGGTGTGGGCTGTGAGGCTGGCTTGGGGCTTCGTCTCGGC----TCTGGGCTCCTTC 1254
Query 1167 ----------TGGCACAGAAGTAGCTGCA--------------------------------------------- 1185
||.|.|.||||.|||.||.
Sbjct 1255 CCCACACGGCTGACCCTGAAGGAGCAGCCCCGGCAGGTGAGGGTGTCTCTTGACTATGAGGTGGGCTGGGTGAC 1328
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1329 CTTCACCAACGCTGTCACCCGAGAGCCCATCTACACCTTCACTGCCTCCTTCACTAGGAAGGTCATTCCCTTCT 1402
Query 1186 ----------------------------------------- 1185
Sbjct 1403 TTGGGCTCTGGGGCCGAGGGTCCAGTTTCTCCCTGAGCTCC 1443