Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07573
• Subject: NM_001278784.2
• Aligned Length: 966
• Identities: 764
• Gaps: 201

Alignment

Query   1  ATGGCCTTTAGCAGCTCCCTGGTGCCCGACCGGCTGCGCCTGCCGCTCTGCTTCCTGGGTGTCTTTGTCTGCTA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TTTTTACTATGGGATCCTGCAGGAAAAGATAACAAGAGGAAAGTATGGGGAAGGAGCCAAGCAGGAGACGTTCA  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  CCTTTGCCTTAACTTTGGTCTTCATTCAATGTGTGATCAATGCTGTGTTTGCCAAGATCTTGATCCAGTTTTTT  222
                                       ||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct   1  ----------------------------ATGTGTGATCAATGCTGTGTTTGCCAAGATCT--------------  32

Query 223  GACACTGCCAGGGTGGATCATACCCGGAGCTGGCTCTATGCTGCCTGTTCTATCTCCTATCTGGGTGCCATGGT  296
                      ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  33  -----------GGTGGATCGTACCCGGAGCTGGCTCTATGCTGCCTGTTCTATCTCCTATCTGGGTGCCATGGT  95

Query 297  CTCCAGCAATTCAGCACTACAGTTTGTCAACTACCCAACTCAGGTCCTTGGTAAATCCTGCAAGCCAATCCCAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  96  CTCCAGCAATTCAGCACTACAGTTTGTCAACTACCCAACTCAGGTCCTTGGTAAATCCTGCAAGCCAATCCCAG  169

Query 371  TCATGCTCCTTGGGGTGACCCTCTTGAAGAAGAAGTACCCGTTGGCCAAGTACCTGTGTGTGCTGTTAATTGTG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 170  TCATGCTCCTTGGGGTGACCCTCTTGAAGAAGAAGTACCCGTTGGCCAAGTACCTGTGTGTGCTGTTAATTGTG  243

Query 445  GCTGGAGTGGCCCTTTTCATGTACAAACCCAAGAAAGTTGTTGGGATAGAAGAACACACAGTCGGCTATGGAGA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244  GCTGGAGTGGCCCTTTTCATGTACAAACCCAAGAAAGTTGTTGGGATAGAAGAACACACAGTCGGCTATGGAGA  317

Query 519  GCTACTCTTGCTATTATCGCTGACCCTGGATGGACTGACTGGTGTTTCCCAGGACCACATGCGGGCTCATTACC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 318  GCTACTCTTGCTATTATCGCTGACCCTGGATGGACTGACTGGTGTTTCCCAGGACCACATGCGGGCTCATTACC  391

Query 593  AAACAGGCTCCAACCACATGATGCTGAACATCAACCTTTGGTCGACATTGCTGCTGGGAATGGGAATCCTGTTC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 392  AAACAGGCTCCAACCACATGATGCTGAACATCAACCTTTGGTCGACATTGCTGCTGGGAATGGGAATCCTGTTC  465

Query 667  ACTGGGGAGCTCTGGGAGTTCTTGAGCTTTGCTGAAAGGTACCCTGCCATCATCTATAACATCCTGCTCTTTGG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 466  ACTGGGGAGCTCTGGGAGTTCTTGAGCTTTGCTGAAAGGTACCCTGCCATCATCTATAACATCCTGCTCTTTGG  539

Query 741  GCTGACCAGTGCCCTGGGTCAGAGCTTCATCTTTATGACGGTTGTGTATTTTGGTCCCCTGACCTGCTCCATCA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540  GCTGACCAGTGCCCTGGGTCAGAGCTTCATCTTTATGACGGTTGTGTATTTTGGTCCCCTGACCTGCTCCATCA  613

Query 815  TCACTACAACTCGAAAGTTCTTCACAATTTTGGCCTCTGTGATCCTCTTCGCCAATCCCATCAGCCCCATGCAG  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614  TCACTACAACTCGAAAGTTCTTCACAATTTTGGCCTCTGTGATCCTCTTCGCCAATCCCATCAGCCCCATGCAG  687

Query 889  TGGGTGGGCACTGTGCTTGTGTTCCTGGGTCTTGGTCTTGATGCCAAGTTTGGGAAAGGAGCTAAGAAGACATC  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 688  TGGGTGGGCACTGTGCTTGTGTTCCTGGGTCTTGGTCTTGATGCCAAGTTTGGGAAAGGAGCTAAGAAGACATC  761

Query 963  CCAC  966
           ||||
Sbjct 762  CCAC  765