Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07585
• Subject: XM_011510488.2
• Aligned Length: 1334
• Identities: 1033
• Gaps: 262

Alignment

Query    1  ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC  74

Query   75  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  148

Query  149  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  222

Query  223  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  296

Query  297  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  370

Query  371  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  444

Query  445  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  518

Query  519  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  592

Query  593  GCCTGCACGGCATCCAGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  666
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTGCACGGCATCCGGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  666

Query  667  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  740

Query  741  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  814

Query  815  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  888

Query  889  AAGATGCTGTTTGTCCTGGT------CGTGGTGTTTGGCATCTGCTGGGCCCCGTTCCACGCCGACCGCGTCAT  956
            ||||||||||...|||.|||      ||    |.||    |||       |||..||||           ||| 
Sbjct  889  AAGATGCTGTACTTCCAGGTTCTAGACG----GCTT----TCT-------CCCAATCCA-----------TCA-  935

Query  957  GTGGAGCGTCGTGTCACAGTGGACAGATGGCCTGCACCTGGCCTTCCAGCACGTGCACGTC-------ATCTCC  1023
                                         ||||        |||...|||   |.|||.||       ||| ||
Sbjct  936  -----------------------------GCCT--------CCTCTGAGC---TTCACTTCTTTTCTGATC-CC  968

Query 1024  GGCATC--TTCTTCTACCTGGGCTCGGCGGCCAACCCCGTGCTCTATAGCCTCATGTCCAGCCGCTTCC-GAGA  1094
            ..||||  |||.||||||                         |||    ||| || |||||  .|||| |||.
Sbjct  969  ACCATCAGTTCATCTACC-------------------------CTA----CTC-TG-CCAGC--GTTCCTGAGG  1009

Query 1095  GACCTTCCAGGAG-GCCCTG------TGCCTCGGGGCCTGCTGCCATCGCCTCAGA--------------CCCC  1147
            |        .||| .|.|||      |.|.||    |||          .||||||              ||..
Sbjct 1010  G--------TGAGTACACTGGAATAATTCTTC----CCT----------TCTCAGAAAAAGGCTTAATTTCCTT  1061

Query 1148  G------------CCACAGCTCCCACAGCCTCAGCAGGATGACCACAG--GCA---GC--ACCCTGTGTGATGT  1202
            |            ||| ||.|    .||.||||.||  |..|.||.||  |||   ||  |||||...|..|||
Sbjct 1062  GAAAATTGAAAGTCCA-AGAT----TAGTCTCATCA--ACAAACAAAGCTGCATATGCCTACCCTTCCTTCTGT  1128

Query 1203  GGGCTCCCTGGGCAGCTGGGTCCACCCCCTGGCTGGGAACGATGGCCCAGAGGCGCAGCAAGAGACCGATCCAT  1276
                                                                                      
Sbjct 1129  --------------------------------------------------------------------------  1128

Query 1277  CC  1278
              
Sbjct 1129  --  1128