Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07589
- Subject:
- NM_001144897.2
- Aligned Length:
- 1250
- Identities:
- 1035
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 ATGTGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAAC-CAGTGGCATCA 73
|||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||.| ||||.| .||.|||.|..
Sbjct 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGG----AACAGCTGAGAGGCCTTG 70
Query 74 GACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTA-CAGGGTGTCTTGGCCATGG 146
|| ||||.|.|||| ||.|| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 71 GA----TTCCGACAGAC-------TCGAG--GAT--------ACAAGAGCT-TAGCAGGGTGTCTTGGCCATGG 122
Query 147 CGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCA 220
..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||| .||||||||||||||||||
Sbjct 123 TCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCACGCTCTTGGCTGGG------------CTCCTTGTCCAAGTGTCCA 184
Query 221 AGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCT 294
||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 AGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCT 258
Query 295 GCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGT 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 GCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGT 332
Query 369 GGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTG 442
|||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 GGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTG 406
Query 443 AGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTG 516
||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 407 AGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTT 480
Query 517 CCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGA 590
|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 481 CCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGA 554
Query 591 GAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAAT 664
||||||.||||.||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct 555 GAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAAT 628
Query 665 CCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAG 738
|.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||
Sbjct 629 CTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAG 702
Query 739 CAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGA 812
||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||
Sbjct 703 CAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGA 776
Query 813 CTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCT 886
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 777 ATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCT 850
Query 887 GCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCC 960
||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||| ||||.|||||
Sbjct 851 GCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGA------------------GCAGTCTTCC 906
Query 961 AGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTC 1034
||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 AGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTC 980
Query 1035 ACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGG 1108
||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||
Sbjct 981 ACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGG 1054
Query 1109 AATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG-- 1180
||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||.|||.|.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1055 AATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCC 1128
Query 1181 -CCTGCTTCAGAGACGAA------------------------------------------------ 1197
||||||.|||.||.|||
Sbjct 1129 TCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG 1194