Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07589
- Subject:
- XR_936147.2
- Aligned Length:
- 1392
- Identities:
- 1196
- Gaps:
- 195
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ACCCAGCTTCCTGTTTGTCTTCCTGAGAGACAGTAGATTTAGAAAGTGAGGATCAGAGGGTGGAAAATAAAAGC 74
Query 1 --------------------------------------------ATGTGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAG 30
|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGTGGTCCCCAGGAGTCCTGAACATCTGGGGACAGCGGGAAAACATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAG 148
Query 31 CAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCA 104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCA 222
Query 105 GATACATGGCCACAAGAGCTCTACAGGGTGTCTTGGCCATGGCGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGC 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATACATGGCCACAAGAGCTCTACAGGGTGTCTTGGCCATGGCGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGC 296
Query 179 TCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCC 252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCC 370
Query 253 GAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCT 326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCT 444
Query 327 GCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGG 518
Query 401 AGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATC 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATC 592
Query 475 TACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCA 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCA 666
Query 549 GGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGC 622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGC 740
Query 623 TGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACC 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACC 814
Query 697 CAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTT 770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTT 888
Query 771 GAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCA 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCA 962
Query 845 TGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATC 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATC 1036
Query 919 AAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTC 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTC 1110
Query 993 AGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGA 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGA 1184
Query 1067 ACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGA 1258
Query 1141 TGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAA----------------- 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAATAGTTGTTTCCCTGCTA 1332
Query 1198 ------------------------------------------------------------ 1197
Sbjct 1333 GCCTCAGCCTCCATTGTGGTATAGCAGAACTTCACCCACTTGCTGGAGTGCAATGGCACG 1392